目的:本實(shí)驗(yàn)通過檢測不同臨床表型過敏性紫癜（Henoch-Schonlein purpura,HSP）患兒腸道菌群的變化,初步探究腸道菌群的變化是否參與了HSP及臟器損傷的發(fā)生及發(fā)展,為我們尋找和研究HSP的病因、發(fā)病機(jī)制以及治療提供新的理論依據(jù)。方法:收集自2018年5月至2019年5月江西省兒童醫(yī)院初次就診且診斷為HSP患兒共30例,其中單純紫癜型（B組）、消化道出血型（C組）、腎臟損傷型（D組）患兒各10例,以10名健康兒童糞便作為對照組（A組）,提取糞便DNA,對16S rRNA基因的V4區(qū)進(jìn)行高通量測序,并進(jìn)行生物信息學(xué)分析。并應(yīng)用ELISA法檢測受試者血清中IL-6、IL-8和IL-10的水平,采用免疫散射比濁法檢測血清IgA、IgG、IgM和IgE的水平。應(yīng)用Spearman相關(guān)性分析方法,探討腸道菌群與炎癥因子的相關(guān)性。結(jié)果:與健康兒童相比,單純紫癜型HSP患兒中雙歧桿菌屬（門到屬水平）豐度明顯降低（P<0.05）;消化道出血型HSP患兒中變形菌門、δ變形菌綱、脫硫弧菌科（目到科水平）、Oscillospira屬、Parabacteroides屬豐度明顯增高,而雙... 

【文章來源】：南昌大學(xué)江西省 211工程院校

【文章頁數(shù)】：55 頁

【學(xué)位級別】：碩士

【部分圖文】：

不同臨床表型腸道菌群和健康兒童組OTUVenn圖

第3章結(jié)果11圖1不同臨床表型腸道菌群和健康兒童組OTUVenn圖注釋：圖中不同顏色代表不同組，兩兩交疊部分?jǐn)?shù)字為組與組之間共同擁有的OTU個(gè)數(shù)。3.2.2測序與質(zhì)量控制通過測序得到RawReads共6551486條，對其進(jìn)行優(yōu)化后得到CleanReads共6418300條，平均每個(gè)樣本160456條，最多為160544條/樣本，最少為160306測序覆蓋度較好，序列拼接使用軟件FLASH（FastLengthAdjustmentofShortreads，v1.2.11），利用重疊關(guān)系將雙末端測序得到的成對reads組裝成一條序列，得到高變區(qū)的Tags。序列拼接的要求：最小匹配長度15bp；重疊區(qū)域允許錯(cuò)配率為0.1。拼接后獲得序列3200920條，總序列平均讀長504bp，共注釋獲得OTU總數(shù)692。Shannon指數(shù)曲線隨測序深度的增加趨向于平坦，表明測序數(shù)據(jù)足夠大，足以反映各組微生物信息（見圖2）。圖2四組研究對象的Shannon指數(shù)值與樣品深度的關(guān)系稀釋曲線即為上圖，用從樣本中隨機(jī)抽取的序列數(shù)表示橫坐標(biāo)，用抽取的序列其所屬的Shannon指數(shù)表示縱坐標(biāo)；圖中每個(gè)樣本用一個(gè)曲線表示，不同的組別用不同的顏色標(biāo)識(shí)。

第3章結(jié)果123.2.3腸道菌群的豐度及多樣性分析（1）Alpha多樣性分析通過用Qimme軟件得出Chao、Ace、Simpson、Shannon指數(shù)，并且對四組兒童這四個(gè)指數(shù)進(jìn)行差異性分析，得出P值分別為0.14、0.13、0.68、0.65，即P＞0.05，提示四個(gè)指數(shù)均無統(tǒng)計(jì)學(xué)差異（見圖3，表2）。圖3四組樣本腸道菌群的Alpha多樣性比較表2四組樣本腸道菌群的Alpha多樣性比較（X±S）Alpha指數(shù)A組B組C組D組P值Chao203.2±58.4234.3±73.9236.9±63.7278.2±66.80.14Ace211.0±52.8235.1±61.1236.9±53.3276.6±61.70.13Shannon2.96±0.392.88±0.593.07±0.603.16±0.540.65Simpson0.11±0.030.14±0.080.11±0.060.13±0.090.68（2）OTU的PLS-DA分析PLS-DA結(jié)果顯示，提示過不同臨床表型敏性紫癜患兒(B、C、D組)和A組的健康兒童存在腸道菌群組內(nèi)分布相似，但是各組之間的腸道菌群被明顯分開，則提示四組腸道菌群存在顯著差異，可以進(jìn)行

【參考文獻(xiàn)】：
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碩士論文
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