本文關(guān)鍵詞：新生兒輪狀病毒流行與進化的基因分析，由筆耕文化傳播整理發(fā)布。

【摘要】：目的:監(jiān)測2015年新生兒輪狀病毒(rotavirus,RV)感染情況及流行基因型特征,分析1996-2015年20年間新生兒RV主要流行株的基因變化,探索其起源與流行,為新生兒RV的感染防治打下堅實基礎(chǔ)。方法:收集2015年新疆維吾爾自治區(qū)人民醫(yī)院新生兒科住院新生兒大便(包括腹瀉和非腹瀉)樣本818份,用酶聯(lián)免疫吸附法(ELISA)檢測RV,查閱病歷采集一般情況和臨床資料,應(yīng)用SPSS17.0統(tǒng)計分析相關(guān)指標(biāo)。提取陽性樣本RV核酸,用多重RT-PCR方法進行G型(VP7)和P型(VP4)基因分型。選取保存的1996-2014年新生兒RV主要流行株及2015年新生兒RV流行株進行VP7和VP4基因測序,利用MEGA6.0軟件繪制系統(tǒng)進化樹,分析其變化及演化趨勢。選取2006年新生兒RV主要流行株G3P[6]株進行11個基因片段的全基因組測序,確立其全基因組分型及起源。結(jié)果:2015年新生兒RV感染檢出率為7.58%,腹瀉新生兒和非腹瀉新生兒RV檢出率差異有統(tǒng)計學(xué)意義(2?=68.496,P0.05),本年度新生兒RV主要流行基因型為G9P[6]型。系統(tǒng)進化分析表明1996-2003年流行的9株G2型分屬兩大進化簇,株間核苷酸同源性為97.7%~100%;2004-2015年流行的31株G9型也分屬兩大進化簇,株間核苷酸同源性為97.6%~100%;1996-2015年間流行的37株新生兒RV P[6]型分屬于5個進化分支,株間核苷酸同源性為96.6%~100%。無論是G型還是P型,每年有多株同基因型病毒株在流行,循環(huán)往復(fù)。全基因組分析表明2006年流行的G3P[6]型毒株屬于Wa-like基因組,具有G3-P[6]-I1-R1-C1-M1-A1-N1-T1-E1-H1的基因特點,可能為嬰幼兒G3P[8]株與新生兒G9P[6]株發(fā)生基因重配或突變而引起G3P[6]毒力相對增強,而致新生兒RV感染流行。結(jié)論:2015年新生兒RV主要流行基因型仍為G9P[6]型。2006年的G3P[6]株可能為人源重配突變株。新生兒RV株基因變化起伏不大,處于緩慢突變螺旋上升適存進化中,但感染長期穩(wěn)定存在,需持續(xù)監(jiān)測并警惕因嬰幼兒與新生兒RV株混合感染而致新生兒新基因型RV感染或院內(nèi)感染暴發(fā)流行。
【關(guān)鍵詞】：輪狀病毒 新生兒 流行 進化 基因
【學(xué)位授予單位】：新疆醫(yī)科大學(xué)
【學(xué)位級別】：碩士
【學(xué)位授予年份】：2016
【分類號】：R722.1
【目錄】：

• 摘要8-9
• ABSTRACT9-11
• 前言11-14
• 研究內(nèi)容與方法14-27
• 1. 研究對象14
• 1.1 標(biāo)本來源14
• 1.2 納入標(biāo)準(zhǔn)和排除標(biāo)準(zhǔn)14
• 1.3 診斷標(biāo)準(zhǔn)14
• 2. 主要儀器與試劑14-15
• 2.1 主要儀器14
• 2.2 實驗儀器設(shè)備14-15
• 3. 研究方法15-25
• 3.1 標(biāo)本處理15
• 3.2 RV的ELISA檢測15-16
• 3.3 RV核酸提取16
• 3.4 Mutiplex-RT-PCR基因分型16-18
• 3.5 瓊脂糖凝膠電泳18
• 3.6 基因片段擴增及測序引物18-19
• 3.7 基因片段擴增19-22
• 3.8 PCR產(chǎn)物純化22-23
• 3.9 PCR產(chǎn)物測序23-24
• 3.10 因序列分析24
• 3.11 考株GenBank注冊號24-25
• 3.12 因序列注冊25
• 4.質(zhì)量控制25-26
• 5.統(tǒng)計分析26
• 6.技術(shù)路線26-27
• 結(jié)果27-55
• 討論55-61
• 小結(jié)61-62
• 致謝62-63
• 參考文獻63-68
• 綜述68-80
• 參考文獻75-80
• 攻讀碩士學(xué)位期間發(fā)表的學(xué)位論文80-81
• 導(dǎo)師評閱表81

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本文編號：317957