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尿道下裂差異表達(dá)miRNA的篩選研究

發(fā)布時間:2017-04-15 22:00

  本文關(guān)鍵詞:尿道下裂差異表達(dá)miRNA的篩選研究,,由筆耕文化傳播整理發(fā)布。


【摘要】:目的本研究通過篩選尿道下裂包皮組織中差異表達(dá)的mi RNA,探討mi RNA及其靶基因和信號通路在尿道下裂的發(fā)病機(jī)制中的作用,尋找尿道下裂預(yù)防和治療的新靶點(diǎn)。方法收集9例尿道下裂患兒及3例包莖患兒的包皮組織作為研究對象,其中3例尿道下裂患兒術(shù)前接受過HCG治療。分別在組織中抽提總RNA,對總RNA進(jìn)行質(zhì)量檢測,利用丹麥Exiqon公司研制的芯片篩選差異性表達(dá)的mi RNA,同時采用RT-PCR方法對芯片結(jié)果進(jìn)行驗(yàn)證。進(jìn)一步結(jié)合生物信息學(xué)方法對mi RNA的靶基因進(jìn)行預(yù)測,并應(yīng)用DAVID數(shù)據(jù)庫進(jìn)行靶基因功能富集分析和信號轉(zhuǎn)導(dǎo)通路富集分析。探討總結(jié)與尿道下裂發(fā)病、治療和預(yù)后相關(guān)的mi RNA及其調(diào)控機(jī)制。結(jié)果1.mi RNA芯片技術(shù)篩選結(jié)果:選擇差異倍數(shù)兩倍以上、P值0.05的差異表達(dá)mi RNA進(jìn)行聚類分析。與包莖患兒比較,尿道下裂患兒包皮組織中表達(dá)上調(diào)的mi RNA共19個,表達(dá)下調(diào)的mi RNA共15個。對尿道下裂患兒術(shù)前是否應(yīng)用HCG治療也做了對比分析,術(shù)前應(yīng)用藥物較未應(yīng)用藥物患兒包皮組織中表達(dá)上調(diào)的mi RNA共25個,表達(dá)下調(diào)的mi RNA共19個。進(jìn)一步對所有包皮組織差異表達(dá)mi RNA進(jìn)行綜合分析發(fā)現(xiàn)部分mi RNA形成在尿道下裂組低表達(dá),而在包莖和尿道下裂術(shù)前應(yīng)用藥物治療組高表達(dá)。2.RT-PCR驗(yàn)證結(jié)果:選擇差異表達(dá)的10個mi RNA進(jìn)行RT-PCR驗(yàn)證,其中5個mi RNA得到驗(yàn)證,其差異表達(dá)趨勢與芯片結(jié)果相符,分別為let-7b-3p、mi R-145-5p、mi R-376a-3p、mi R-377-3p、mi R-1-3p。3.生物信息學(xué)結(jié)果:let-7b-3p、mi R-145-5p、mi R-376a-3p、mi R-377-3p、mi R-1-3p可能與尿道下裂發(fā)病相關(guān),靶基因?yàn)镾OX9、FGF14、FGFR2、TCF7L2、ZEB2、PAX3、SOD1、ZFPM2、THBS1、PAX6、SMAD4、DMRT2等,其功能與胚胎發(fā)育、腺體發(fā)育、性別分化和傷口愈合等相關(guān),相關(guān)信號通路為MAPK信號通路、TGFβ信號通路、Wnt信號通路、鈣信號轉(zhuǎn)導(dǎo)通路和前列腺癌相關(guān)信號通路等。結(jié)論1.首次建立尿道下裂mi RNA基因表達(dá)譜,篩選出差異表達(dá)的mi RNA,在尿道下裂與包莖、術(shù)前是否用藥物治療的尿道下裂間獲得差異表達(dá)mi RNA,并推測mi RNA表達(dá)趨勢。2.通過構(gòu)建特異性莖環(huán)RT引物,采用實(shí)時定量PCR技術(shù),驗(yàn)證了10個差異表達(dá)mi RNA,其中5個mi RNA的RT-PCR結(jié)果與基因芯片結(jié)果相符。3.預(yù)測5個mi RNA的靶基因,并進(jìn)行靶基因功能分析,總結(jié)與尿道下裂相關(guān)的mi RNA及其作用機(jī)制。
【關(guān)鍵詞】:尿道下裂 mi RNA 基因芯片 RT-PCR
【學(xué)位授予單位】:蘇州大學(xué)
【學(xué)位級別】:碩士
【學(xué)位授予年份】:2015
【分類號】:R726.9
【目錄】:
  • 中文摘要4-6
  • Abstract6-9
  • 序言9-11
  • 第一部分:尿道下裂差異表達(dá)MIRNA的篩選和RT-PCR驗(yàn)證11-32
  • 1 材料與方法11-20
  • 2 結(jié)果20-32
  • 第二部分:MIRNA靶基因的生物信息學(xué)研究32-39
  • 1 對象與方法32-33
  • 2 結(jié)果33-39
  • 討論39-48
  • 結(jié)論48-49
  • 參考文獻(xiàn)49-55
  • 綜述55-65
  • 參考文獻(xiàn)61-65
  • 英文縮略詞一覽表65-67
  • 攻讀學(xué)位期間公開發(fā)表的論文67-68
  • 攻讀學(xué)位期間承擔(dān)的科研項目68-69
  • 致謝69-70

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本文編號:309320

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