基于生物信息學(xué)分析microRNA-495-5p在早產(chǎn)兒支氣管肺發(fā)育不良中的表達(dá)及其臨床意義
發(fā)布時(shí)間:2021-01-24 12:28
目的探討支氣管肺發(fā)育不良(BPD)早產(chǎn)兒血清中microRNA-495-5p(miRNA-495-5p)的表達(dá)變化并對(duì)其進(jìn)行生物信息學(xué)分析,為深入研究miRNA-495-5p與BPD的關(guān)系提供理論依據(jù)。方法收集2015年1月至2016年12月NICU住院治療早產(chǎn)兒的一般臨床資料,選取具有早期BPD臨床表現(xiàn)的20例患兒為BPD組,無早期BPD臨床表現(xiàn)的20例患兒為對(duì)照組。采集兩組患兒末梢外周血,每組各隨機(jī)選取5例患兒,應(yīng)用miRNA芯片技術(shù)篩選兩組患兒血清中差異性表達(dá)的miRNAs;每組各隨機(jī)選取6例患兒,采用RT-PCR技術(shù)再次驗(yàn)證其差異性表達(dá)。應(yīng)用TargetScan、miRDB、miRWalk數(shù)據(jù)庫對(duì)miRNA-495-5p進(jìn)行靶基因預(yù)測;采用DAVID數(shù)據(jù)庫對(duì)靶基因進(jìn)行基因功能富集分析和信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)通路富集分析。結(jié)果與對(duì)照組患兒相比,BPD組患兒血清miRNA-495-5p表達(dá)顯著上調(diào)(P<0.05)。通過3種數(shù)據(jù)庫預(yù)測miRNA-495-5p的靶基因共有117個(gè),其靶基因功能分別富集于轉(zhuǎn)錄調(diào)節(jié)活性、轉(zhuǎn)錄激活活性、轉(zhuǎn)錄輔助激活活性等分子功能,代謝過程的調(diào)控、依賴DNA的轉(zhuǎn)錄調(diào)控...
【文章來源】:中國當(dāng)代兒科雜志. 2020,22(01)北大核心
【文章頁數(shù)】:7 頁
【文章目錄】:
1 資料與方法
1.1 觀察對(duì)象
1.2 miRNA芯片
1.3 RT-PCR檢測
1.4 靶基因預(yù)測
1.5 Gene Ontology分析
1.6 統(tǒng)計(jì)學(xué)分析
2 結(jié)果
2.1 miRNA芯片及RT-PCR驗(yàn)證結(jié)果
2.2 靶基因預(yù)測結(jié)果
2.3 GO分析結(jié)果
2.4 KEGG通路分析結(jié)果
3 討論
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]mTOR信號(hào)通路與相關(guān)疾病的研究進(jìn)展[J]. 宋曉紅,劉明明,仉紅剛. 微循環(huán)學(xué)雜志. 2018(03)
本文編號(hào):2997246
【文章來源】:中國當(dāng)代兒科雜志. 2020,22(01)北大核心
【文章頁數(shù)】:7 頁
【文章目錄】:
1 資料與方法
1.1 觀察對(duì)象
1.2 miRNA芯片
1.3 RT-PCR檢測
1.4 靶基因預(yù)測
1.5 Gene Ontology分析
1.6 統(tǒng)計(jì)學(xué)分析
2 結(jié)果
2.1 miRNA芯片及RT-PCR驗(yàn)證結(jié)果
2.2 靶基因預(yù)測結(jié)果
2.3 GO分析結(jié)果
2.4 KEGG通路分析結(jié)果
3 討論
【參考文獻(xiàn)】:
期刊論文
[1]mTOR信號(hào)通路與相關(guān)疾病的研究進(jìn)展[J]. 宋曉紅,劉明明,仉紅剛. 微循環(huán)學(xué)雜志. 2018(03)
本文編號(hào):2997246
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