發(fā)布時(shí)間：2020-12-30 06:46

　　目的:通過(guò)16Sr DNA測(cè)序分析肥胖兒童和正常體重兒童腸道菌群組成結(jié)構(gòu)及差異性,為解決兒童肥胖的治療及預(yù)防問(wèn)題打下了一定的基礎(chǔ)。方法:選取安徽醫(yī)科大學(xué)第二附屬醫(yī)院門診的肥胖兒童30名和安徽省某小學(xué)正常體重兒童29名,收集糞便,采用16Sr DNA的檢測(cè)方法,進(jìn)行DNA的提取與檢測(cè),PCR的擴(kuò)增、產(chǎn)物純化、文庫(kù)制備與庫(kù)檢,在機(jī)器上對(duì)Ion S5 TMXL進(jìn)行測(cè)序,并通過(guò)單端測(cè)序構(gòu)建小片段文庫(kù)用于末端測(cè)序,通過(guò)切割和過(guò)濾讀數(shù),OUTs聚類,最后進(jìn)行物種注釋,豐度分析,多樣性分析,以了解腸道微生物的組成和腸道菌群之間的差異。結(jié)果:在OUT注釋中肥胖兒童和正常體重兒童clean reads平均數(shù)目分別為79963.3和80860.7,表明肥胖兒童中最終用于后續(xù)分析的序列較正常體重組少。在Alpha Diversity中Chaol和ACE兩個(gè)指數(shù)不存在顯著性差異,表明肥胖組和正常體重組兒童物種豐富度是一致的。Shannon和Simpson兩個(gè)指數(shù)間也不存在顯著性差異,表明肥胖組和正常體重組兒童物種的多樣性是一致的。肥胖組兒童和正常體重組兒童在門、綱、目、科、屬水平上物種豐度排名前十的物種組成基... 

【文章來(lái)源】：安徽醫(yī)科大學(xué)安徽省

【文章頁(yè)數(shù)】：55 頁(yè)

【學(xué)位級(jí)別】：碩士

【部分圖文】：

OUT分布venn圖

是一種非常適用的方法,用來(lái)幫助分析樣品的構(gòu)成部分以及推斷樣品的物性，所以在進(jìn)行生物群落及其豐富度的研究時(shí)，常常被研究者用來(lái)進(jìn)行樣生物群落的多樣性的分析。本研究中當(dāng)樣本數(shù)量達(dá)到 42 時(shí)，箱型圖的位置緩，說(shuō)明樣本的數(shù)量是充分的， 使用 R 軟件（Version 2.15.3）繪制稀釋曲果表明，當(dāng)測(cè)序深度達(dá) 50000reads 時(shí)，見(jiàn)圖 3，稀釋曲線漸漸變得平坦，測(cè)序所需求的數(shù)據(jù)量也隨之變的越來(lái)越好，即使再增加數(shù)據(jù)量也很難出現(xiàn)種。由圖 4 可知，59 個(gè)樣品的文庫(kù)覆蓋率（good-coverage）均在 0.99 以明測(cè)序深度可以滿足后續(xù)分析要求。由圖 5、6 對(duì)兩組兒童的 ACE 、 Chao指數(shù)進(jìn)行差異顯著性分析 P 值分別 ０.316、0.224 ，均大于 0.05 ，說(shuō)明數(shù)間不存在顯著性差異，表明兩組兒童腸道微生物的豐富度是一致的。由圖兩組兒童的 Shannon 和 Simpson 進(jìn)行差異顯著性分析，P 值分別為０.44493 也大于 0.05 ，所以兩個(gè)指數(shù)間差異無(wú)統(tǒng)計(jì)學(xué)意義，表明兩組兒童腸道群多樣性沒(méi)有差異。

是一種非常適用的方法,用來(lái)幫助分析樣品的構(gòu)成部分以及推斷樣品的物性，所以在進(jìn)行生物群落及其豐富度的研究時(shí)，常常被研究者用來(lái)進(jìn)行樣生物群落的多樣性的分析。本研究中當(dāng)樣本數(shù)量達(dá)到 42 時(shí)，箱型圖的位置緩，說(shuō)明樣本的數(shù)量是充分的， 使用 R 軟件（Version 2.15.3）繪制稀釋曲果表明，當(dāng)測(cè)序深度達(dá) 50000reads 時(shí)，見(jiàn)圖 3，稀釋曲線漸漸變得平坦，測(cè)序所需求的數(shù)據(jù)量也隨之變的越來(lái)越好，即使再增加數(shù)據(jù)量也很難出現(xiàn)種。由圖 4 可知，59 個(gè)樣品的文庫(kù)覆蓋率（good-coverage）均在 0.99 以明測(cè)序深度可以滿足后續(xù)分析要求。由圖 5、6 對(duì)兩組兒童的 ACE 、 Chao指數(shù)進(jìn)行差異顯著性分析 P 值分別 ０.316、0.224 ，均大于 0.05 ，說(shuō)明數(shù)間不存在顯著性差異，表明兩組兒童腸道微生物的豐富度是一致的。由圖兩組兒童的 Shannon 和 Simpson 進(jìn)行差異顯著性分析，P 值分別為０.44493 也大于 0.05 ，所以兩個(gè)指數(shù)間差異無(wú)統(tǒng)計(jì)學(xué)意義，表明兩組兒童腸道群多樣性沒(méi)有差異。

【參考文獻(xiàn)】：
期刊論文
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博士論文
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[3]積雪草醇提物對(duì)ZDF大鼠胰島的保護(hù)功能及其機(jī)制研究[D]. 斯琴.北京中醫(yī)藥大學(xué) 2016
[4]魚油飲食對(duì)肥胖模型大鼠血糖、血脂、胰島素敏感性的影響及其影響機(jī)制的實(shí)驗(yàn)研究[D]. 趙飛.山東大學(xué) 2005

碩士論文
[1]輪作和生物制劑對(duì)甜瓜連作障礙土壤的修復(fù)作用研究[D]. 馬慧.沈陽(yáng)農(nóng)業(yè)大學(xué) 2018



本文編號(hào)：2947195