發(fā)布時(shí)間：2020-10-17 11:50

　　 目的篩查新生兒TLR4基因的多態(tài)性位點(diǎn)(SNP),并進(jìn)一步檢測SNP與新生兒G-菌感染的相關(guān)性。 方法取上海地區(qū)出生的漢族新生兒外周血0.5 ml,依次進(jìn)行DNA提取、聚合酶鏈反應(yīng)(PCR)和基因測序檢測SNP位點(diǎn)；組與組之間的連續(xù)性變量比較應(yīng)用方差分析,計(jì)數(shù)資料采用卡方檢驗(yàn)。 結(jié)果共檢測上海地區(qū)出生的465例漢族新生兒,包括早產(chǎn)兒205例(26～32周早產(chǎn)兒133例,33～36周早產(chǎn)兒172例)和足月兒160例；其中G-菌感染186例,非感染279例；極低出生體重兒68例,低出生體重兒274例,小于胎齡兒96例。 1、TLR4常見的SNP位點(diǎn)集中在啟動(dòng)子部位6個(gè)位點(diǎn),包括T-1418C、A-1837G、G-1892A、-2242C、A-2381G、A-2415G,未發(fā)現(xiàn)在歐美人群比較常見的編碼區(qū)SNP位點(diǎn)。 2、465例新生兒均進(jìn)行了上述6個(gè)SNP位點(diǎn)的檢測,其中345例新生兒具有上述一個(gè)或多個(gè)SNP位點(diǎn)(SNP組),120例沒有發(fā)現(xiàn)上述SNP位點(diǎn)(非SNP組)： (1)SNP與G-菌感染：早產(chǎn)兒中,SNP組G-菌感染率為41.8%(94／225),非SNP組為25%(20／80),兩組之間差異有顯著性意義(P=0.008,OR=2.153),足月兒兩組之間差異無顯著性意義；低出生體重兒中,SNP組G-菌感染率為45.8%(93/203),非SNP組為23.9%(17／71),兩組之間差異有顯著性意義(P=0.001,OR=2.686),而足月兒以及BW2500g的新生兒,SNP組和非SNP組之間差異無顯著性意義。465例不同胎齡的新生兒,A-2381G的A／A基因型組,G-菌感染率為33.7%(56／166),而非A／A基因型組感染率為43.4%(130／299),兩組之間差異有顯著性意義(P=0.040,OR=0.662)；根據(jù)胎齡不同分層檢驗(yàn)：GA33w的新生兒,A-2381G的A/A基因型組感染率為41.3%(19／46),而非A／A基因型組感染率為59.8%(52／87),兩組之間差異有顯著性意義(P=0.042)；胎齡33-36w早產(chǎn)兒,A-1837G的A／A基因型組感染率為15.6%(10／64),而非A/A基因型組感染率為30.6%(33／108),兩組差異有顯著性意義(P=0.029),足月兒人群中沒有發(fā)現(xiàn)啟動(dòng)子各SNP位點(diǎn)與G-菌感染存在相關(guān)性；根據(jù)出生體重不同進(jìn)行分層檢驗(yàn)：出生體重1500g的新生兒,T-1418C的T／T基因型組感染率為61%(25/41),而非T／T基因型組感染率為85.2%(23／27),兩組之間差異有顯著性意義(P=0.032,OR=0.272；A-1837G的G／G基因型組感染率為100%(10／10),而非G／G基因型組感染率為65.5%(38／58),兩組之間差異有顯著性意義(P=0.027,OR=1.526)；A-2415G的G／G基因型組感染率為100%(12／12),而非G／G基因型組感染率為64.2%(36／56),兩組差異有顯著性意義(P=0.014,OR=1.556)；BW：1500～2500g的新生兒,A-1837G的A/A基因型組感染率為18.8%(13／69),而非A／A基因型組感染率35.8%(49／137),兩組差異有顯著性意義(P=0.012,OR=0.417)；T-2242C的T／T基因型組感染率為20.5%(15／73),而非T／T基因型組感染率為35.3%(47／133),兩組差異有顯著性意義(P=0.027,OR=0.473)；A-2381G的A／A基因型組感染率為18.4%(14／76),而非A／A基因型組感染率為36.9%(48／130),兩組有差異有顯著性意義(P=0.005,OR=0.386)；A-2415G的A／A基因型組感染率為20.3%(15／74),而非A/A基因型組感染率為35.6%(47／132),兩組差異有顯著性意義(P=0.021,OR=0.460)；對(duì)于BW2500g的新生兒,沒有發(fā)現(xiàn)TLR4啟動(dòng)子部位各SNP位點(diǎn)與G-菌感染存在相關(guān)性。 (2)SNP與早產(chǎn)的相關(guān)性：啟動(dòng)子部位常見的6種SNP位點(diǎn)不同基因型組早產(chǎn)率無統(tǒng)計(jì)學(xué)差異(P0.1)。 (3)SNP與出生體重的相關(guān)性：T-2242C的C／C基因型組極低出生體重兒的發(fā)生率為18.8%(15／80),低出生體重兒的發(fā)生率為73.8%(59/80),而其他基因型極低出生體重兒的發(fā)生率為13.8%(53／385),低出生體重的發(fā)生率為55.8%(215／385),R×C表卡方檢驗(yàn)P=0.012。C／C基因型組體重為2170.3±722.2g；非C／C基因型組體重為2402.7±822.6g；兩組差異有顯著性意義(P=0.019)。 (4)SNP與宮內(nèi)發(fā)育遲緩的相關(guān)性：465例不同胎齡的新生兒,6個(gè)SNP位點(diǎn)各基因型對(duì)應(yīng)的SGA發(fā)生率差異無顯著性意義；根據(jù)胎齡不同分層檢驗(yàn),結(jié)果顯示：早產(chǎn)兒TLR4啟動(dòng)子部位常見的SNP位點(diǎn)不同基因型人群SGA的發(fā)生率無明顯差異；足月兒中,T-1418C的C／C基因型人群SGA的發(fā)生率為50%(5／10),T／C雜合子人群SGA的發(fā)生率為27.1%(16／59),T／T基因型為15.8%(13／82),三組之間差異有顯著性意義,P=0.028；C／C基因型是SGA的高危因素,OR=3.862,T／T則是SGA的對(duì)抗因素,OR=0.431；G-1892A的G／G基因型SGA的發(fā)生率為15.9%(14／88),而非G／G基因型SGA的發(fā)生率為31.7%(20／63),兩組之間差異有顯著性意義(P=0.022),G／G基因型表現(xiàn)為SGA的對(duì)抗因素,OR=0.407；足月兒中,T-1418C的C／C基因型組體重為2994.1±653.9g；T／C組體重為3165.5±455.1g,T／T組體重為3251.7±557.4g；三組之間差異有顯著性意義；G-1892A的A/A基因型組體重為2838.0±546.0g；G／A：3201.2±529.1g；G／G：3276.2±552.2g；三組之間差異有顯著性意義(P=0.024) 結(jié)論TLR4基因多態(tài)性存在明顯的種族差異性,我國漢族新生兒人群中常見的SNP位點(diǎn)集中在啟動(dòng)子部位,編碼區(qū)SNP的頻率分布偏低；啟動(dòng)子部位常見的6個(gè)SNP位點(diǎn)可能與G-菌感染、低出生體重和宮內(nèi)發(fā)育遲緩等存在相關(guān)性。
【學(xué)位單位】：復(fù)旦大學(xué)
【學(xué)位級(jí)別】：碩士
【學(xué)位年份】：2010
【中圖分類】：R722.1
【部分圖文】：

C/T0.372 T/T0.574T:0，760圖2是本研究發(fā)現(xiàn)的TLR4啟動(dòng)子區(qū)域一3000bp范圍內(nèi)，樣本的6個(gè)常見SNP位點(diǎn)的峰圖，均選擇雜合標(biāo)本為代表。
【參考文獻(xiàn)】

相關(guān)期刊論文 前1條

1 王永堂;蔣建新;段朝霞;顧瑋;曾靈;陳客宏;;TLR4基因啟動(dòng)子區(qū)多態(tài)性及其對(duì)蛋白表達(dá)的影響[J];現(xiàn)代生物醫(yī)學(xué)進(jìn)展;2009年07期

本文編號(hào)：2844738