粵東地區(qū)喘息性疾病患兒中人偏肺病毒的檢出及其N蛋白編碼基因的序列分析
發(fā)布時(shí)間:2020-08-07 01:53
【摘要】: 目的了解粵東地區(qū)喘息性疾病患兒的病原體中是否存在人類偏肺病毒(Human Metapneumovirus,HMPV)并分析其N蛋白編碼基因的特征,同時(shí)探討其感染的臨床特征,為臨床防治小兒喘息性疾病提供病原學(xué)基礎(chǔ)實(shí)驗(yàn)依據(jù)。 材料與方法 材料:選取2006年6月1日至2007年6月1日期間因喘息性疾病收住院治療的2歲以下患兒(240例),采集其鼻咽吸取物或咽試子以供病毒學(xué)檢測之用,并收集其年齡、性別、癥狀、體征等臨床資料以供分析研究;同時(shí)采集同時(shí)期健康體檢兒童(100例)的咽試子作為對照研究。 方法:1.應(yīng)用多重PCR篩查呼吸道合胞病毒(RSV),腺病毒(ADV),流感病毒A型,B型(IVA,B),副流感病毒1型,3型(PIV1,3) ,鼻病毒(RV),博卡病毒( HBOV)。 2.應(yīng)用針對HMPV的N蛋白基因的RT-PCR引物進(jìn)行HMPV基因片段檢測,隨機(jī)選取6份RT-PCR擴(kuò)增陽性產(chǎn)物進(jìn)行核苷酸序列測定。將所測序列與GenBank中公布的基因序列進(jìn)行比較分析,通過生物信息學(xué)方法對測定的人偏肺病毒基因片段進(jìn)行進(jìn)化分析,分析與其它地方病毒株的同源性。同時(shí)對HMPV N蛋白基因陽性病例的臨床資料進(jìn)行分析。 結(jié)果 1.240份小兒喘息性疾病呼吸道標(biāo)本中,病毒陽性101份(42%),單一病毒感染86份(85%),混合感染15例(占15%);檢出病毒中以RSV占首位,41例(占41%),其次遞減為PIV3 18例(占18%),RV 17例(占17%), IVA 16例(占16%),PIV1 13例(占13%),HMPV 12例(占12%),ADV 5例(占5%), HBOV 4例(占4%),未檢測到IVB。 2.240份標(biāo)本中HMPV陽性率為5%(12/240),在其他病毒陰性標(biāo)本中陽性率為7.9%(其中2例與其他病毒混合感染,分別與ADV和RV),其中3、4月份為發(fā)病高峰。陽性患兒均為年齡較小的患兒。6份HMPV陽性標(biāo)本目標(biāo)基因部分核苷酸序列與GenBank中公布的多株HMPV N基因同源性為80.8%~98.4%。核苷酸序列基因進(jìn)化樹分析顯示存在2種不同的基因型。12例HMPV陽性患兒均表現(xiàn)發(fā)熱、咳嗽及喘息等臨床癥狀;臨床診斷為毛細(xì)支氣管炎8例、喘息型肺炎4例。 3.100份健康體檢兒童的呼吸道標(biāo)本中均未檢測到HMPV特異性基因片段;檢出PIV3:1例,RSV:3例,RV:4例,其余病毒未檢出。 結(jié)論HMPV是粵東地區(qū)嬰幼兒喘息性疾病的重要病毒性病原體之一;與常見呼吸道病毒感染所致疾病的臨床表現(xiàn)相似;粵東地區(qū)兒童感染的HMPV株同時(shí)存在2種不同的基因型。
【學(xué)位授予單位】:汕頭大學(xué)
【學(xué)位級別】:碩士
【學(xué)位授予年份】:2008
【分類號】:R725.6
本文編號:2783290
【學(xué)位授予單位】:汕頭大學(xué)
【學(xué)位級別】:碩士
【學(xué)位授予年份】:2008
【分類號】:R725.6
【參考文獻(xiàn)】
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本文編號:2783290
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