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HoxC簇基因與先天性髖脫位的傳遞不平衡檢驗(yàn)及D12S1686位點(diǎn)基因頻率分析

發(fā)布時(shí)間:2020-05-13 08:54
【摘要】: 目的 先天性髖脫位(congenital dislocation of the hip,CDH)是小兒骨科常見的先天畸形之一,在我國(guó)的發(fā)病率為0.91~3.80‰不等。目前,遺傳流行病學(xué)調(diào)查資料表明其屬于多基因遺傳病。 近年來,在基因敲除的動(dòng)物實(shí)驗(yàn)中發(fā)現(xiàn)Hox基因參與并調(diào)節(jié)骨骼形態(tài)發(fā)育,動(dòng)物實(shí)驗(yàn)亦表明Abd-B組HoxC簇基因在下肢表達(dá);1993年Spielman首先應(yīng)用遺傳標(biāo)記進(jìn)行傳遞不平衡檢驗(yàn)(transmission disequilibrium test,TDT),成功地定位了Ⅰ型糖尿病的易感基因,這種方法非常適合在我國(guó)目前核心家系優(yōu)勢(shì)的社會(huì)進(jìn)行多基因遺傳病易感基因定位研究。 目前,國(guó)內(nèi)外尚無HoxC簇基因與先天性髖脫位之間的研究報(bào)道。因此,,本實(shí)驗(yàn)在HoxC簇基因所在染色體區(qū)域選取微衛(wèi)星多態(tài)標(biāo)記D12S1686,檢測(cè)了101個(gè)CDH核心家系各成員的基因型,對(duì)65個(gè)雜合雙親家系進(jìn)行TDT分析,初步探討HoxC簇基因與先天性髖脫位的關(guān)系,并分析D12S1686位點(diǎn)的基因頻率。 方法 1.實(shí)驗(yàn)對(duì)象: 實(shí)驗(yàn)組:101例CDH患兒及其父母組成101個(gè)核心家系。 對(duì)照組:3名正常人 2.提取基因組DNA 取外周靜脈血5-10ml,EDTA抗凝,常規(guī)酚/氯仿法提取基因組DNA。 3.PCR擴(kuò)增 遺傳標(biāo)記D1251686位于HOXC簇基因所在染色體區(qū)域;PCR 反應(yīng)體系為25 ul,循環(huán)條件:94 T預(yù)變性10分鐘;94℃40秒35℃ 40秒、72℃40秒,循環(huán)30次;72℃延伸7分鐘。 4.基因型檢測(cè) PC R產(chǎn)物經(jīng)6%變性聚丙烯酸胺凝膠電泳3.5-4小時(shí),銀染 法顯帶。根據(jù)正常對(duì)照者等位基因的位置及已知等位基因片斷長(zhǎng) 度確定核心家系各成員的基因型及片斷長(zhǎng)度。 5.傳遞不平衡檢驗(yàn) 列出雜合型父母向子代傳批不傳遞的等位基因數(shù),建立TDT 表格,并應(yīng)用SAS軟件中的 FREQ程序進(jìn)行分析。 6.基因頻率分析 按文獻(xiàn)的統(tǒng)計(jì)方法進(jìn)行基因頻率計(jì)算,Hardg-Weinbers平衡 吻合度檢驗(yàn)及不同人群基因頻率比較。 實(shí)驗(yàn)結(jié)果 二.TDT分析結(jié)果 x‘=6.且*,P=0.965,提示 D12S1686 位 點(diǎn)與CDH不存在傳遞不平衡。 2.中國(guó)遼寧漢族人群在D1251686位點(diǎn)基因頻率分析 由于 D1251686位點(diǎn)與CDH之間不存在傳遞不平衡,選擇患兒父母(共 188人)作為無遺傳關(guān)系人群進(jìn)行基因頻率分析。 a.在188名無遺傳關(guān)系的中國(guó)遼寧漢族人中檢測(cè)到16個(gè)等 位基因,59個(gè)基因型。等位基因片段長(zhǎng)度在2 15-249hP之間,基 因頻率在0.003-0.245之間,雜合度為0.855。 b.Hardg-Weinbere平衡吻合度檢測(cè)基因型頻率的期望值和 觀察值無顯著性差異*‘=50.245,P>0.10人符合 Hardy-Wein- hers平衡,提示該位點(diǎn)可作為有效的遺傳標(biāo)記用于基因連鎖分析。 ·2· C.中國(guó)遼寧漢族人群與高加索人群(白種人)的基因頻率之 間存在顯著差異(a二 0.005,X’二 48.456,P<0.001)。 結(jié) 論 1.D1251686位點(diǎn)與CDH之間不存在傳遞不平衡,HoxC簇基 因可能與先天性髓脫位無明顯相關(guān)。 2.中國(guó)遼寧漢族人群在D1251686位點(diǎn)處共檢測(cè)到16個(gè)等 位基因,片斷長(zhǎng)度在215-249hP之間,基因頻率在0.003-0.245 之間、雜合度為0.855,與國(guó)外文獻(xiàn)報(bào)道高加索人群(白種人)的基 因頻率差異顯著河<o(jì).001人提示該結(jié)果可能與種族、民族差異 有關(guān)。
【圖文】:

父母,標(biāo)本,電泳分析,位點(diǎn)


(Nl、N2、N3)及部分CDH標(biāo)本在D12s1686Cl)111理)7Cl)川(爭(zhēng)封Cl川10,N1NZN3CD卜11】()父母了父母子父tjj父臺(tái)矛
【學(xué)位授予單位】:中國(guó)醫(yī)科大學(xué)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【學(xué)位授予年份】:2003
【分類號(hào)】:R726.8

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本文編號(hào):2661698

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