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HoxC簇基因與先天性髖脫位的傳遞不平衡檢驗及D12S1686位點基因頻率分析

發(fā)布時間:2020-05-13 08:54
【摘要】: 目的 先天性髖脫位(congenital dislocation of the hip,CDH)是小兒骨科常見的先天畸形之一,在我國的發(fā)病率為0.91~3.80‰不等。目前,遺傳流行病學調查資料表明其屬于多基因遺傳病。 近年來,在基因敲除的動物實驗中發(fā)現(xiàn)Hox基因參與并調節(jié)骨骼形態(tài)發(fā)育,動物實驗亦表明Abd-B組HoxC簇基因在下肢表達;1993年Spielman首先應用遺傳標記進行傳遞不平衡檢驗(transmission disequilibrium test,TDT),成功地定位了Ⅰ型糖尿病的易感基因,這種方法非常適合在我國目前核心家系優(yōu)勢的社會進行多基因遺傳病易感基因定位研究。 目前,國內外尚無HoxC簇基因與先天性髖脫位之間的研究報道。因此,,本實驗在HoxC簇基因所在染色體區(qū)域選取微衛(wèi)星多態(tài)標記D12S1686,檢測了101個CDH核心家系各成員的基因型,對65個雜合雙親家系進行TDT分析,初步探討HoxC簇基因與先天性髖脫位的關系,并分析D12S1686位點的基因頻率。 方法 1.實驗對象: 實驗組:101例CDH患兒及其父母組成101個核心家系。 對照組:3名正常人 2.提取基因組DNA 取外周靜脈血5-10ml,EDTA抗凝,常規(guī)酚/氯仿法提取基因組DNA。 3.PCR擴增 遺傳標記D1251686位于HOXC簇基因所在染色體區(qū)域;PCR 反應體系為25 ul,循環(huán)條件:94 T預變性10分鐘;94℃40秒35℃ 40秒、72℃40秒,循環(huán)30次;72℃延伸7分鐘。 4.基因型檢測 PC R產物經6%變性聚丙烯酸胺凝膠電泳3.5-4小時,銀染 法顯帶。根據正常對照者等位基因的位置及已知等位基因片斷長 度確定核心家系各成員的基因型及片斷長度。 5.傳遞不平衡檢驗 列出雜合型父母向子代傳批不傳遞的等位基因數(shù),建立TDT 表格,并應用SAS軟件中的 FREQ程序進行分析。 6.基因頻率分析 按文獻的統(tǒng)計方法進行基因頻率計算,Hardg-Weinbers平衡 吻合度檢驗及不同人群基因頻率比較。 實驗結果 二.TDT分析結果 x‘=6.且*,P=0.965,提示 D12S1686 位 點與CDH不存在傳遞不平衡。 2.中國遼寧漢族人群在D1251686位點基因頻率分析 由于 D1251686位點與CDH之間不存在傳遞不平衡,選擇患兒父母(共 188人)作為無遺傳關系人群進行基因頻率分析。 a.在188名無遺傳關系的中國遼寧漢族人中檢測到16個等 位基因,59個基因型。等位基因片段長度在2 15-249hP之間,基 因頻率在0.003-0.245之間,雜合度為0.855。 b.Hardg-Weinbere平衡吻合度檢測基因型頻率的期望值和 觀察值無顯著性差異*‘=50.245,P>0.10人符合 Hardy-Wein- hers平衡,提示該位點可作為有效的遺傳標記用于基因連鎖分析。 ·2· C.中國遼寧漢族人群與高加索人群(白種人)的基因頻率之 間存在顯著差異(a二 0.005,X’二 48.456,P<0.001)。 結 論 1.D1251686位點與CDH之間不存在傳遞不平衡,HoxC簇基 因可能與先天性髓脫位無明顯相關。 2.中國遼寧漢族人群在D1251686位點處共檢測到16個等 位基因,片斷長度在215-249hP之間,基因頻率在0.003-0.245 之間、雜合度為0.855,與國外文獻報道高加索人群(白種人)的基 因頻率差異顯著河<o.001人提示該結果可能與種族、民族差異 有關。
【圖文】:

父母,標本,電泳分析,位點


(Nl、N2、N3)及部分CDH標本在D12s1686Cl)111理)7Cl)川(爭封Cl川10,N1NZN3CD卜11】()父母了父母子父tjj父臺矛
【學位授予單位】:中國醫(yī)科大學
【學位級別】:碩士
【學位授予年份】:2003
【分類號】:R726.8

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