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PRSS12基因多態(tài)性與秦巴山區(qū)精神發(fā)育遲滯的關(guān)聯(lián)分析

發(fā)布時間:2020-04-12 15:44
【摘要】: 精神發(fā)育遲滯(Mental Retardation, MR)亦稱弱智是兒童和青少年中主要的精神、神經(jīng)類疾病之一,在人群中的患病率約為1-3%。主要表現(xiàn)為智力低下和社會適應(yīng)能力不足;谕麑Ψ治,家系分析以及寄養(yǎng)子的研究表明,遺傳因素在精神發(fā)育遲滯中起重要的作用。秦巴山區(qū)是我國MR的高發(fā)區(qū)之一。本論文從基因組水平上出發(fā),研究了PRSS12基因與秦巴山區(qū)漢族人群中MR的相關(guān)性。 PRSS12基因是第一個已報道的與MR有關(guān)的胞外神經(jīng)蛋白酶基因。自2002年首次被發(fā)現(xiàn)以來,對常染色體上由PRSS12基因引起的非特異性精神發(fā)育遲滯(Non-specific mental retardation, NSMR)的進一步深入研究,對PRSS12基因以及動物的同源基因在人類大腦和鼠類大腦表達區(qū)域,特別是中樞神經(jīng)系統(tǒng)區(qū)域的深入研究表明,PRSS12基因在大腦中與學習和記憶有關(guān)的海馬組織中起著重要的作用。PRSS12基因已經(jīng)被確定為常染色體的NSMR基因。 本研究以130個陜南秦巴山區(qū)MR患者及其正常父母雙親組成的核心家系為研究對象。根據(jù)神經(jīng)蛋白酶調(diào)控神經(jīng)遞質(zhì)的機理,選擇了PRSS12基因上的6個SNPs作為遺傳標記。利用PCR-RFLP方法確定個體的基因型,再做基于家系的連鎖不平衡分析及單倍型相對風險率估計,采用SPSS17.0和UNPHASE3.1.3統(tǒng)計分析軟件,分析PRSS12基因與秦巴山區(qū)MR的關(guān)系。結(jié)果發(fā)現(xiàn),PRSS12基因的rs11098432位點和rs793813位點與秦巴山區(qū)MR相關(guān)聯(lián)(P=0.034,P=0.036)。同時對多位點間的單倍型分析結(jié)果顯示,由rs11098432-rs788668組成的C-C單倍型,rs788668-rs7690554組成的T-A單倍型與MR密切相關(guān)(P=0.017,P=0.024)。此外,研究還顯示,經(jīng)Bonferroni校正后由包含rs11098432或rs793813位點的多個SNPs位點組成的單倍型(A-C-G,C-C-A-G-C)發(fā)現(xiàn)存在顯著性差異(P=0.016,P=0.033)(GlobalP=0.03,P=0.004)。綜上所述,在秦巴山區(qū)人群中,PRSS12基因的異常突變可能是MR的一個遺傳風險因子,而在rs11098432和rs793813位點間的這一區(qū)域附近可能存在引起PRSS12基因功能異常的突變位點。
【圖文】:

cDNA序列,基因結(jié)構(gòu),結(jié)構(gòu)域


第二章實驗研究通過GenBank,,EMBL和PIR數(shù)據(jù)庫cDNA序列的比較,PRSS12基因編碼NeurotryPsin是一個多功能域神經(jīng)蛋白酶。主要結(jié)構(gòu)域為:位于氨基末端的一富含脯氨酸堿性片段、眾ngle結(jié)構(gòu)域(眾ngledomain)、4個scavenger富含半氨酸重復(fù)的清道夫受體結(jié)構(gòu)域(Scavengerreeeptoreysteine一riehrepeats,sReR)及位于梭基末端(CooH一)的一個絲氨酸蛋白酶結(jié)構(gòu)域(serineproteasedomain)。尸天5512基因結(jié)構(gòu)如圖3。

分布圖,位點,基因,分布圖


基因SNPs位點分布圖
【學位授予單位】:西北大學
【學位級別】:碩士
【學位授予年份】:2010
【分類號】:R749.94

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本文編號:2624893

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