【摘要】：目的分析中國大陸地區(qū)2004-2016年柯薩奇病毒A組10型(coxsackievirus group A type 10,CA10)流行毒株基因型分布概況和進化規(guī)律,為手足口病防控提供數(shù)據(jù)支撐。方法利用MEGA 6.0軟件對GenBank核酸數(shù)據(jù)庫收錄的流行于中國大陸地區(qū)的CA10毒株VP1區(qū)基因序列進行分析,構(gòu)建系統(tǒng)進化樹,并對毒株彼此間的核苷酸和氨基酸同源性進行計算。結(jié)果納入本研究的中國大陸地區(qū)CA10毒株共計218株,中國大陸地區(qū)CA10流行毒株的基因型以C型為主。與原型株CA10-Kowalik相比,中國大陸地區(qū)CA10毒株核苷酸和氨基酸的同源性分別為69.4%~73.9%和90.6%~93.6%;中國大陸地區(qū)CA10毒株內(nèi)部的核苷酸和氨基酸同源性分別為76.4%~100.0%和92.9%~100.0%。結(jié)論本研究提示應(yīng)針對CA10毒株流行趨勢和基因型分布情況,采取有效措施防控手足口病。
【圖文】：

．1CA10毒株核苷酸序列篩選結(jié)果本次研究共檢索到GenBank核苷酸數(shù)據(jù)庫里具有完整VP1基因核苷酸序列的毒株273株:北京57株，深圳57株，石家莊20株，山東23株，長沙9株，云南20株，安陽32株，法國54株，美國1株。去除國外的55株，中國大陸地區(qū)流行株共計218株。2．2CA10毒株時間分布中國大陸地區(qū)218株CA10毒株分離時間年份跨度為2004－2016年，主要集中分布在2009－2014年，其中2012年分離毒株最多，為60株，占27.5%，其次為2010年和2009年，毒株數(shù)分別為42株和32株，分別占19.3%和14.7%;而2005年和2007年毒株數(shù)為0。見圖1。2．3CA10毒株地區(qū)分布對檢索到的中國大陸地區(qū)218株CA10毒株的地區(qū)分布研究顯示，前三位主要集中在北京、深圳和安陽地區(qū)，所占構(gòu)成比分別為26.1%、26.1%和14.7%。見圖2。2．4CA10毒株基因型分布通過MEGA6.0軟件構(gòu)建系統(tǒng)進化樹，，結(jié)果顯示所選取的218株中國圖1中國大陸地區(qū)2004－2016年不同年份CA10毒株分布趨勢Figure1Time-distributionprofileofCA10isolatesinmainlandChina，2004－2016圖2中國地區(qū)2004－2016年CA10毒株地區(qū)分布情況Figure2ＲegionaldistributionofCA10isolatesinmainlandChina，2004－2016大陸分離株，其基因型分布如下:B型8株，C型210株，分別占中國大陸CA10分離毒株總數(shù)的3.7%和96.3%。國外分離株基因型分布如下:A型毒株為原型株CA10-Kowalik，分離于美國(GenBankaccessingnumber:AF081300.1)，D型毒株均為法國分離株(GenBankaccessingnumber:HE572940.1-HE572989.1、HE572991.1-HE572992.1和HE573016.1);所獲取的中國大陸地區(qū)2004－2016年CA10毒株以基因型C流行為主，共210株，見圖3、表1。2．5核苷酸和氨基酸同源性分析利用MEGA6.0軟件對CA10毒株VP1區(qū)序列進行核苷酸同源性?

0株，安陽32株，法國54株，美國1株。去除國外的55株，中國大陸地區(qū)流行株共計218株。2．2CA10毒株時間分布中國大陸地區(qū)218株CA10毒株分離時間年份跨度為2004－2016年，主要集中分布在2009－2014年，其中2012年分離毒株最多，為60株，占27.5%，其次為2010年和2009年，毒株數(shù)分別為42株和32株，分別占19.3%和14.7%;而2005年和2007年毒株數(shù)為0。見圖1。2．3CA10毒株地區(qū)分布對檢索到的中國大陸地區(qū)218株CA10毒株的地區(qū)分布研究顯示，前三位主要集中在北京、深圳和安陽地區(qū)，所占構(gòu)成比分別為26.1%、26.1%和14.7%。見圖2。2．4CA10毒株基因型分布通過MEGA6.0軟件構(gòu)建系統(tǒng)進化樹，結(jié)果顯示所選取的218株中國圖1中國大陸地區(qū)2004－2016年不同年份CA10毒株分布趨勢Figure1Time-distributionprofileofCA10isolatesinmainlandChina，2004－2016圖2中國地區(qū)2004－2016年CA10毒株地區(qū)分布情況Figure2ＲegionaldistributionofCA10isolatesinmainlandChina，2004－2016大陸分離株，其基因型分布如下:B型8株，C型210株，分別占中國大陸CA10分離毒株總數(shù)的3.7%和96.3%。國外分離株基因型分布如下:A型毒株為原型株CA10-Kowalik，分離于美國(GenBankaccessingnumber:AF081300.1)，D型毒株均為法國分離株(GenBankaccessingnumber:HE572940.1-HE572989.1、HE572991.1-HE572992.1和HE573016.1);所獲取的中國大陸地區(qū)2004－2016年CA10毒株以基因型C流行為主，共210株，見圖3、表1。2．5核苷酸和氨基酸同源性分析利用MEGA6.0軟件對CA10毒株VP1區(qū)序列進行核苷酸同源性比較分析，結(jié)果顯示273株毒株核苷酸和氨基酸平均同源性為89.4%和96.8%。中國大陸地區(qū)CA10毒株VP1區(qū)序列與基因A型原型株CA10-Kowalik的核苷酸和氨基酸同源性為69.4%～73.9
【作者單位】： 鹽城市疾病預(yù)防控制中心急性傳染病防治科;
【分類號】：R725.1

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本文編號：2527709