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GATA-3基因多態(tài)性與LAPTM5基因功能在兒童白血病中的研究

發(fā)布時間:2018-11-13 12:48
【摘要】:第一部分GATA-3SNP rs3824662與中國兒童急性淋巴細(xì)胞 白血病的相關(guān)性 目的:研究GATA結(jié)合蛋白3(GATA-binding protein-3, GATA-3)SNP rs3824662在中國兒童急性淋巴細(xì)胞白血。ˋcute lymphoblastic leukemia,ALL)中的分布,分析其與中國兒童急性淋巴細(xì)胞白血病的相關(guān)性。 方法:收集137例中國兒童ALL患者及389例非血液系統(tǒng)惡性疾病人員EDTA抗凝靜脈血,提取DNA,采用巢式PCR擴(kuò)增包含GATA-3SNP rs3824662位點(diǎn)的特異性條帶后送公司測序,對其進(jìn)行單核苷酸多態(tài)性(single nucleotide polymorphisms,SNPs)分析。SPSS18.0分析軟件對數(shù)據(jù)進(jìn)行分析。 結(jié)果:基因型C-C、C-A和A-A及等位基因C、A在對照和中國兒童ALL中比例沒有差異,且與ALL的臨床指標(biāo)沒有相關(guān)性。 結(jié)論: GATA-3SNP rs3824662位點(diǎn)的多態(tài)性改變與中國兒童ALL的發(fā)病沒有相關(guān)性,提示該位點(diǎn)與中國兒童ALL發(fā)病機(jī)制無關(guān)。 第二部分兒童急性淋巴細(xì)胞白血病患者LAPTM5基因的表達(dá)及臨床意義 目的:溶酶體相關(guān)的五次跨膜蛋白(lysosomal-associated protein transmembrane5,LAPTM5)功能尚不十分明了,本研究通過定量PCR檢測兒童急性淋巴細(xì)胞白血。ˋcute lymphoblastic leukemia, ALL)患者骨髓標(biāo)本中LAPTM5mRNA的相對表達(dá)量,回顧性的分析其表達(dá)水平與兒童ALL臨床特征的相關(guān)性。 方法:病例來源于2012-2013年期間在蘇州大學(xué)附屬兒童醫(yī)院診斷和治療的ALL患者144例(初診82例、完全緩解54例、復(fù)發(fā)8例);40例對照為同期的特發(fā)性血小板減少性紫癜(Idiopathic Thrombocytopenic Purpura, ITP)或細(xì)胞株。應(yīng)用定量RT-PCR方法檢測LAPTM5基因的mRNA表達(dá)水平,利用SPSS18.0統(tǒng)計學(xué)軟件, 分析LAPTM5在兒童ALL中的意義。 結(jié)果:初診患兒LAPTM5mRNA的相對表達(dá)水平高于對照組,且差異有統(tǒng)計學(xué)意義(P0.001);在ALL患者中,初診組和復(fù)發(fā)組LAPTM5mRNA的表達(dá)水平均明顯高于緩解組(P0.001,P=0.006),復(fù)發(fā)組與初診組間沒有差異(P=0.171),復(fù)發(fā)組高于對照組,差異有統(tǒng)計學(xué)意義(P=0.033),緩解組與對照組之間無差異(P=0.985)。初診B-ALL中LAPTM5的表達(dá)明顯高于兒童初診T-ALL患者。LAPTM5的表達(dá)與骨髓原始細(xì)胞比例呈正相關(guān)(P=0.034, r=0.303);與年齡、性別、初診白細(xì)胞計數(shù)(WBC)、血紅蛋白(HB)、血小板(PLT)、C反應(yīng)蛋白(CRP)、乳酸脫氫酶(LDH)、外周血幼稚細(xì)胞比例沒有相關(guān)性,與兒童ALL的早期治療反應(yīng)及危險度分級也沒有相關(guān)性;與誘導(dǎo)緩解治療33天時MRD的表達(dá)水平無相關(guān)性(P=0.695,r=-0.055)。 結(jié)論:兒童初診ALL高表達(dá)LAPTM5基因,在B-ALL中的表達(dá)高于T-ALL,與骨髓中白血病細(xì)胞數(shù)具有正相關(guān)性,但與疾病的預(yù)后指標(biāo)沒有相關(guān)性。 第三部分溶酶體五次跨膜蛋白基因的慢病毒載體的構(gòu)建及在K562細(xì)胞中的表達(dá) 目的:構(gòu)建溶酶體相關(guān)五次跨膜蛋白(lysosomal-associated protein transmembrane5,LAPTM5)基因的慢病毒表達(dá)載體,為研究該基因在白血病細(xì)胞中的功能奠定基礎(chǔ)。 方法:以NB4細(xì)胞的cDNA為克隆模板,通過Primer Premier5軟件設(shè)計含有EcoR Ⅰ和BamH Ⅰ酶切位點(diǎn)的基因克隆引物,將LAPTM5CDS區(qū)域克隆入pLVX-IRES-Puro慢病毒表達(dá)載體。利用pLVX、pLP-VSVG、pLP1、pLP2慢病毒質(zhì)粒包裝系統(tǒng),在293T細(xì)胞中采用磷酸鈣沉淀法包裝LAPTM5過表達(dá)慢病毒后侵染K562細(xì)胞,并對LAPTM5過表達(dá)慢病毒進(jìn)行一系列驗證。 結(jié)果:經(jīng)過PCR方法,有效擴(kuò)增了LAPTM5基因編碼區(qū),構(gòu)建了pLVX/LAPTM5慢病毒表達(dá)載體,測序分析表明所克隆的LAPTM5基因編碼區(qū)序列無誤。DNA水平鑒定表明LAPTM5基因已成功插入到K562細(xì)胞基因組中,且在mRNA和蛋白水平較親本株和轉(zhuǎn)空載體細(xì)胞高表達(dá)。 結(jié)論:成功地構(gòu)建了人LAPTM5的慢病毒表達(dá)載體pLVX/LAPTM5,,為進(jìn)一步研究LAPTM5在白血病細(xì)胞中的功能奠定了實驗基礎(chǔ)。 第四部分LAPTM5基因?qū)562細(xì)胞自噬及凋亡的影響 目的:LAPTM5是溶酶體的重要組成部分,溶酶體是介導(dǎo)自噬的重要器官,本研究通過觀察過表達(dá)LAPTM5基因的K562細(xì)胞自噬及凋亡,探討LAPTM5基因在K562細(xì)胞中的可能作用。 方法:1.用HBSS代替1640完全培養(yǎng)基分別對轉(zhuǎn)空載體pLVX的K562細(xì)胞和轉(zhuǎn)LAPTM5基因的K562細(xì)胞進(jìn)行饑餓處理,于處理后0h、3h、6h收集細(xì)胞,提取蛋白后蛋白印跡檢測LC3-II、LC3-I的表達(dá),并比較其比值。2.使用攜帶FITC的LC3抗體標(biāo)記轉(zhuǎn)空載體pLVX的K562細(xì)胞和轉(zhuǎn)LAPTM5基因的K562細(xì)胞后用成像流式細(xì)胞儀檢測帶熒光斑點(diǎn)的細(xì)胞。3.使用LysoSensor Green DND-189標(biāo)記溶酶體,流式細(xì)胞儀檢測轉(zhuǎn)空載體pLVX的K562細(xì)胞和轉(zhuǎn)LAPTM5基因的K562細(xì)胞,根據(jù)熒光強(qiáng)度判斷溶酶體的酸性程度。4.使用Annexin V-FITC/PI標(biāo)記轉(zhuǎn)空載體pLVX的K562細(xì)胞和轉(zhuǎn)LAPTM5基因的K562細(xì)胞后,流式細(xì)胞儀檢測細(xì)胞的凋亡。 結(jié)果:1.細(xì)胞于饑餓處理0h、3h、6h后,轉(zhuǎn)LAPTM5基因的K562細(xì)胞LC3-II/LC3-I比值均低于轉(zhuǎn)空載體pLVX的K562細(xì)胞。2.轉(zhuǎn)空載體的K562細(xì)胞的多數(shù)量熒光斑點(diǎn)的細(xì)胞比率占83.1%,轉(zhuǎn)LAPTM5基因細(xì)胞的多數(shù)量熒光斑點(diǎn)的細(xì)胞比率占57%。3.轉(zhuǎn)空載體的K562細(xì)胞的熒光強(qiáng)度明顯強(qiáng)于轉(zhuǎn)LAPTM5基因細(xì)胞熒光強(qiáng)度。4.轉(zhuǎn)LAPTM5基因細(xì)胞的凋亡率為33.1%,.轉(zhuǎn)空載體的K562細(xì)胞凋亡率為34.2%。 結(jié)論:LAPTM5基因能夠抑制K562細(xì)胞的自噬而不影響其凋亡。
[Abstract]:......
【學(xué)位授予單位】:蘇州大學(xué)
【學(xué)位級別】:碩士
【學(xué)位授予年份】:2014
【分類號】:R733.7

【參考文獻(xiàn)】

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本文編號:2329151

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