本文選題：手足口病 + 地理信息系統(tǒng)　； 參考：《吉林大學(xué)》2015年博士論文

【摘要】：手足口病是5歲以下兒童常見的傳染病，近些年在亞洲多地暴發(fā)，可以導(dǎo)致不可逆的神經(jīng)損傷甚至死亡。目前，手足口病既沒有可靠的疫苗，也沒有特效的藥物治療。因此，流行病學(xué)監(jiān)測(cè)以及采取積極有效的公共衛(wèi)生干預(yù)措施去預(yù)防其暴發(fā)具有重要意義。手足口病暴發(fā)的早期預(yù)警可以提早采取干預(yù)措施，有效提高控制措施的時(shí)效性，降低疾病的發(fā)病率及病死率，從而減輕疾病對(duì)健康的影響。目的： 了解長(zhǎng)春市手足口病發(fā)病情況及其時(shí)空分布特征，分析手足口病社會(huì)環(huán)境、地理以及氣候方面影響因素，并將有意義影響因素納入季節(jié)模型，比較該復(fù)合模型與單一模型的擬合性及預(yù)測(cè)效力的差別，同時(shí)，結(jié)合實(shí)驗(yàn)室研究，全面了解長(zhǎng)春地區(qū)手足口病病原體類型及主要病毒基因亞型特征，從而為手足口病的預(yù)測(cè)以及防控提供理論依據(jù)。 方法： ①收集長(zhǎng)春市2008-2011年手足口病病例，按照性別、年齡、職業(yè)、居住地對(duì)手足口病進(jìn)病例進(jìn)行分層，利用spss16.0分析手足口病的患病率以及人群分布特征；繪制手足口病時(shí)間序列圖，尋找其發(fā)病高峰；使用ArcGIS9.3軟件，將手足口病個(gè)案數(shù)據(jù)和人口數(shù)據(jù)與地理位置相關(guān)聯(lián)，在鄉(xiāng)鎮(zhèn)尺度上建立2008-2011年分年度手足口病發(fā)病率地圖，動(dòng)態(tài)顯示和分析長(zhǎng)春市手足口病的空間分布特征，并進(jìn)行手足口病時(shí)空聚集性分析，篩選手足口病一類聚集區(qū)。②使用R軟件，應(yīng)用泊松回歸分析方法探討人口密度、兒童密度、居住地類型、交通路線的遠(yuǎn)近、GDP、托幼機(jī)構(gòu)和醫(yī)療機(jī)構(gòu)的密度與手足口病發(fā)病的關(guān)系；交叉相關(guān)分析用于探索手足口病與氣候因素的關(guān)系以及其滯后效應(yīng)。③利用單一SARIMA模型進(jìn)行手足口病發(fā)病預(yù)測(cè)，并觀察添加了方法②中篩選的有意義的影響因素后的模型預(yù)測(cè)效力是否增強(qiáng)。均方根誤差（RMSE）用來衡量預(yù)測(cè)值和實(shí)際值的偏差，以及評(píng)估模型預(yù)測(cè)的效力。④采用RT-PCR方法對(duì)疑似手足口病病例標(biāo)本進(jìn)行核酸檢測(cè)，用人橫紋肌瘤（RD）細(xì)胞對(duì)EV71陽性標(biāo)本進(jìn)行病毒分離，對(duì)獲取16株病毒分離株進(jìn)行VP1區(qū)基因擴(kuò)增與測(cè)序，并與標(biāo)準(zhǔn)株進(jìn)行同源性比對(duì)及進(jìn)化關(guān)系分析。 結(jié)果： ①長(zhǎng)春市2008-2011年共計(jì)報(bào)告手足口病病例17646例，5歲以下兒童數(shù)占報(bào)告病例總數(shù)的86.8%，不同年齡組手足口病發(fā)病率不同，2歲組兒童發(fā)病率最高，為4630/10萬。散居兒童占報(bào)告病例總數(shù)的65.4%，男孩的發(fā)病率高于女孩(χ2=130.03, P 0.001)；重癥病例兒童的平均年齡小于普通病例兒童的平均年齡(t=5.4, P 0.001)。每年手足口病發(fā)病高峰期大約在7、8月份。數(shù)字地圖顯示，手足口病發(fā)病率市區(qū)最高，手足口病發(fā)病和交通密度有關(guān)，道路交叉匯合處手足口病發(fā)病率最高。時(shí)空聚集性分析結(jié)果顯示，長(zhǎng)春市共檢測(cè)一類聚集區(qū)11個(gè)，疫情持續(xù)期間為4-6月，二類聚集區(qū)3個(gè)，疫情持續(xù)時(shí)間為4-9月，一二類聚集區(qū)緊密相接。②手足口病發(fā)病率與鄉(xiāng)鎮(zhèn)類型、和高速公路的距離、GDP有關(guān)。城市（Adjusted PC=62.17，95%CI:21.16-117.08），和高速公路越（AdjustedPC=-14.70，95%CI:-19.31--9.83）近，，GDP越高（Adjusted PC=3.98，95%CI:1.47-6.55），手足口病發(fā)病率越高。在眾多氣象因素中，手足口病發(fā)病率和風(fēng)速呈負(fù)相關(guān)關(guān)系，與降雨量、平均氣溫、日照時(shí)數(shù)和平均水汽壓呈正相關(guān)。手足口病發(fā)病數(shù)與平均氣溫和降雨量分別存在2周和1周的滯后效應(yīng)。③加入上述有意義的影響因素后的復(fù)合SARIMA(2,1,2)(1,1,1)12模型預(yù)測(cè)效果更佳。平穩(wěn)的R2值為0.485，大于單一模型SARIMA(1,1,1)(1,1,0)12的平穩(wěn)R2值（0.436），BIC值11.352，小于單一SARIMA(1,1,1)(1,1,0)12模型BIC值（11.445）。RMSE值為301.134，小于單一模型RMSE值。外推預(yù)測(cè)結(jié)果顯示，復(fù)合SARIMA(2,1,2)(1,1,1)12模型預(yù)測(cè)值與實(shí)際值的平均誤差19.46%，小于單一SARIMA(1,1,1)(1,1,0)12模型預(yù)測(cè)平均誤差20.80%，尤其是高峰期4-8月份，預(yù)測(cè)誤差僅為2.44%，小于單一模型SARIMA(1,1,1)(1,1,0)12同期預(yù)測(cè)誤差4.08%。④2008-2011年，實(shí)驗(yàn)室共計(jì)進(jìn)行手足口病病原學(xué)檢測(cè)標(biāo)本952份，咽拭子標(biāo)本陽性率70.3%，糞便標(biāo)本陽性率67.8%，肛拭子標(biāo)本陽性率87.0%，肺部灌洗液及皰疹液標(biāo)本陽性率66.7%。長(zhǎng)春市2008-2011年手足口病的主要病原體為腸道病毒EV71。從2009-2011年手足口病EV71陽性標(biāo)本中隨機(jī)選取60份進(jìn)行病毒分離，共分離到毒株16份，分離率26.67%。對(duì)該16株毒株VP1區(qū)進(jìn)行基因測(cè)序，用DNAstar軟件對(duì)以上序列的核苷酸和氨基酸序列的同源性進(jìn)行分析，16株EV71分離株之間具有較高的核苷酸及氨基酸同源性，核苷酸同源性高達(dá)96.2%～100.0%，氨基酸同源性高達(dá)98.7%～100%。16株分離株中除JL/CC/10-2、JL/CC/10-3、JL/CC/09-4外的13株分離株親緣性最近，核苷酸同源性在98.7～100％，氨基酸同源性100.0%。在NCBI GenBank中搜索腸道病毒EV71各亞型標(biāo)準(zhǔn)株，將16株毒株VP1區(qū)序列與上述標(biāo)準(zhǔn)株該區(qū)序列進(jìn)行比對(duì)分析，結(jié)果顯示，它們與C4a亞型代表株具有最高的核苷酸序列和氨基酸序列同源性。核苷酸序列同源性為96.0％～99.8％，氨基酸序列同源性為98.0％～100％；進(jìn)化樹分析結(jié)果顯示，，16株EV71分離株與C4a亞型代表株處于密切相關(guān)的一簇，同時(shí)它們又分別處于3個(gè)相對(duì)獨(dú)立的小的進(jìn)化分支。其中的13株在進(jìn)化樹中形成緊密相關(guān)的一個(gè)小分支（Clade1），呈單源性的進(jìn)化發(fā)生關(guān)系；JL/CC/10-2、JL/CC/10-3分離株形成了第2個(gè)分支（Clade2），與Clade1之間核苷酸同源性為96.9％～99.1％，親緣關(guān)系相對(duì)稍遠(yuǎn)；JL/CC/09-4分離株與Clade1、Clade2之間核苷酸同源性為95.4％～97.0％，親緣關(guān)系較遠(yuǎn)，形成第3個(gè)小分支（Clade3） 結(jié)論： ①長(zhǎng)春地區(qū)手足口病不同年齡組發(fā)病率不同，2歲組發(fā)病率最高，男孩的發(fā)病率高于女孩，重癥病例兒童的平均年齡小于普通病例兒童的平均年齡。數(shù)字地圖顯示城市手足口病發(fā)病率高，尤其是道路交叉匯合處手足口病發(fā)病率最高。②長(zhǎng)春市共檢測(cè)手足口病一類聚集區(qū)11個(gè)，持續(xù)間為4-6月；二類聚集區(qū)3個(gè)，持續(xù)時(shí)間為4-9月；一二類聚集區(qū)緊密相接。③城市、和高速公路距離越近、GDP越高，手足口病發(fā)病率越高；手足口病發(fā)病率和風(fēng)速呈負(fù)相關(guān)關(guān)系，與降雨量、平均氣溫、日照時(shí)數(shù)和平均水汽壓呈正相關(guān)。手足口病發(fā)病數(shù)與平均氣溫和降雨量分別存在2周和1周的滯后關(guān)系。④多因素復(fù)合模型的擬合性和預(yù)測(cè)效果優(yōu)于單一模型SARIMA(1,1,1)(1,1,0)12。⑤長(zhǎng)春市2009年-2011年手足口病的主要病原體為腸道病毒EV71，肛拭子陽性率較高；16株EV71分離株之間具有較高的核苷酸及氨基酸同源性，與C4a亞型代表株具有最高的核苷酸序列和氨基酸序列同源性，親緣關(guān)系樹分析顯示，16株分離株在進(jìn)化中形成3個(gè)分支。
[Abstract]:Hand - foot - mouth disease is a common infectious disease among children under the age of 5 . In recent years , the outbreak in Asia has caused irreversible nerve injury or even death . At present , hand - foot - mouth disease has no reliable vaccine and has no special effect . Therefore , epidemiological monitoring and active and effective public health interventions are important to prevent its outbreak . Early warning of hand - foot - mouth disease outbreak can take early intervention measures to effectively improve the timeliness of control measures , reduce the morbidity and mortality of the disease , and thus reduce the effect of disease on health .

To understand the incidence of hand - foot - mouth disease in Changchun city and its spatial - temporal distribution characteristics , analyze the social environment , geography and climatic influence factors of hand - foot - mouth disease , and integrate the influential factors into seasonal model , compare the difference between the fitting property and the forecasting effect of the single model and compare the characteristics of the pathogen type and main virus gene subtype of the hand - foot - mouth disease in Changchun area , so as to provide theoretical basis for the prediction of hand - foot - mouth disease and prevention and control .

Method :

( 1 ) To collect the cases of hand - foot - mouth disease in Changchun from 2008 to 2011 , stratified by sex , age , occupation and place of residence , to analyze the prevalence of hand - foot - mouth disease and population distribution characteristics by spss16 . 0 .
Draw hand - foot - mouth disease time sequence chart , look for the peak of the disease ;
Using the software of ArcGIS 9.3 , the data and population data of hand - foot - mouth disease were correlated with geographical position , and the spatial distribution characteristics of hand - foot - mouth disease in Changchun city were established on the scale of villages and towns , and the spatial distribution characteristics of hand - foot - mouth disease were analyzed and analyzed .
A cross correlation analysis was used to explore the relationship between hand - foot - mouth disease and climate factors and its hysteresis effect . 鈶

本文編號(hào)：1834545