本文選題：人巨細(xì)胞病毒 + 生物信息學(xué)　； 參考：《醫(yī)學(xué)研究生學(xué)報(bào)》2017年10期

【摘要】：目的 UL141基因的結(jié)構(gòu)特征及多態(tài)性對(duì)發(fā)現(xiàn)人巨細(xì)胞病毒(HCMV)感染致病性機(jī)制具有指導(dǎo)意義。文中旨在研究廣州地區(qū)HCMV臨床低傳代株UL141基因的序列特征。方法選取2016年3月至2017年3月在廣州醫(yī)科大學(xué)附屬廣東省婦兒醫(yī)院兒科就診的10例HCMV患兒,收集患兒尿液標(biāo)本,從中分離低傳代臨床病毒株,應(yīng)用多重PCR方法鑒定,對(duì)其進(jìn)行HCMV UL141基因全序列擴(kuò)增、克隆、鑒定、測序,并在Gen Bank搜索HCMV UL141同源序列,行序列分析。結(jié)果UL141基因存在UL141a及UL141b 2處開放閱讀框架(ORF),分別由315及1017個(gè)核苷酸構(gòu)成,Gen Bank登記號(hào)分別為DQl80372和DQl80371。UL141基因全長1277 bp,編碼蛋白由338個(gè)氨基酸殘基組成,UL141a及UL141b開放閱讀框架ORF分別為315、1017 bp,其DNA序列比較保守,存在46處位點(diǎn)變異,變異皆為堿基替換,無插入或缺失。HCMV UL141編碼蛋白翻譯后修飾位點(diǎn)在所有分離株中均比較保守,所有分離株UL141蛋白的等電點(diǎn)均在8.36~8.68之間。結(jié)論廣州地區(qū)HCMV臨床低傳代分離株UL141基因及其編碼的氨基酸序列比較保守,但仍存在一定的多態(tài)性,為進(jìn)一步揭示ULl41蛋白的功能及HCMV感染的致病機(jī)制奠定了基礎(chǔ)。
[Abstract]:Objective to explore the pathogenicity of human cytomegalovirus (HCMV) infection by structural characteristics and polymorphism of UL141 gene.The purpose of this study was to study the sequence characteristics of UL141 gene of HCMV clinical low passage strain in Guangzhou.Methods Ten children with HCMV were selected from March 2016 to March 2017 in Guangdong Provincial Hospital for Women and Children of Guangzhou Medical University. Urine samples were collected and low passage clinical virus strains were isolated and identified by multiple PCR method.The whole sequence of HCMV UL141 gene was amplified, cloned, identified and sequenced. The homologous sequence of HCMV UL141 was searched by Gen Bank, and the sequence analysis was carried out.The ORF of the frame was 315 ~ 1017 BP, and its DNA sequence was conserved.There were 46 loci of mutation, all of which were base substitution. The post-translational modification sites of HCMV-encoding protein were conserved in all isolates. The isoelectric point of UL141 protein of all isolates was between 8.36 and 8.68.Conclusion the UL141 gene and its encoded amino acid sequence of the low passage HCMV isolates in Guangzhou are conserved, but there are still some polymorphisms, which lays a foundation for further revealing the function of ULl41 protein and the pathogenesis of HCMV infection.
【作者單位】： 廣州醫(yī)科大學(xué)附屬廣東省婦兒醫(yī)院/廣東省婦幼保健院兒科;
【基金】：國家自然科學(xué)基金(81070516) 廣東省自然科學(xué)基金(9151008901000085、2015A030313726、2016A030313788) 廣東省醫(yī)學(xué)科研基金(A2015133)
【分類號(hào)】：R725.1

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