本文關(guān)鍵詞： 結(jié)核分枝桿菌 esxA fbpB Rvc 基因多態(tài)性　出處：《第三軍醫(yī)大學(xué)學(xué)報(bào)》2017年17期 　論文類型：期刊論文

【摘要】：目的對(duì)抗原編碼基因esxA、fbpB、Rv2660c進(jìn)行測(cè)序,了解esxA、fbpB、Rv2660c的基因多態(tài)性。方法選取135株結(jié)核分枝桿菌(Mycobacterium tuberculosis,MTB)臨床分離株,運(yùn)用PCR方法擴(kuò)增目的基因esx A、fbp B、Rv2660c并進(jìn)行測(cè)序,與結(jié)核標(biāo)準(zhǔn)株H37Rv基因序列以及從免疫表位數(shù)據(jù)庫(kù)(immune epitope database,IEDB)中查詢到的表位序列進(jìn)行對(duì)比,分析esx A、fbp B、Rv2660c基因序列中的變異特征。結(jié)果在135株菌株中,esx A、Rv2660c序列暫未發(fā)現(xiàn)基因變異。fbpB共66株(48.89%)發(fā)現(xiàn)了基因變異,5個(gè)單核苷酸多態(tài)性(single nucleotide polymorphism,SNP)位點(diǎn)共造成8個(gè)(14.81%)T細(xì)胞抗原表位以及9個(gè)(24.32%)B細(xì)胞抗原表位序列的多態(tài)性。fbpB基因的d N值為0.000 120,d S為0.002 126,其中T細(xì)胞表位區(qū)與非T細(xì)胞表位區(qū)的d N值分別為0.000 067和0.000 408,d S分別為0.002 382和0.000 470,B細(xì)胞表位區(qū)dN和dS值分別為0.000 063和0.002 380,非B細(xì)胞表位區(qū)dN和dS均為0。結(jié)論 esxA、Rv2660c基因序列較保守,fbp B存在基因多態(tài)性,預(yù)測(cè)會(huì)對(duì)蛋白Ag85B的免疫功能造成影響,從而影響H56的免疫有效性。
[Abstract]:Objective to sequence the antigen-coding gene esxAmfbpBnrv2660c and to understand the expression of esxAfbpB. Methods 135 clinical isolates of Mycobacterium tuberculosisus were selected. The target gene esx AfBP BV2660c was amplified by PCR and sequenced. The results were compared with the H37Rv gene sequence of TB standard strain and the epitope sequence obtained from immune epitope database (immune epitope database IEDB). The variation characteristics of esx AfBP rv2660c gene were analyzed. Gene mutation was not found in Rv2660c sequence. 66 strains of FBpB were found. Five single nucleotide polymorphisms (SNP) single nucleotide polymorphism. SNPs cause 8 T cell epitopes and 9 T cell epitopes. The polymorphism of B cell epitope sequence. The dN value of fbpB gene was 0.000120. D S was 0.002 126, and the N values of T cell epitope and non T cell epitope were 0.000067 and 0.000408, respectively. DS values were 0.002 382 and 0.000 470 B cell epitopes, respectively. The values of DN and DS were 0.000 063 and 0.002 380, respectively. The number of dN and DS in non-B cell epitope was 0.Conclusion the sequence of esxAcon-Rv2660c gene is more conserved than that of conserved FBP B gene. Prediction will affect the immune function of protein Ag85B, thus affecting the immune effectiveness of H56.
【作者單位】： 重慶醫(yī)科大學(xué)附屬兒童醫(yī)院感染科兒童發(fā)育疾病研究教育部重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室兒童發(fā)育重大疾病國(guó)家國(guó)際科技合作基地 兒科學(xué)重慶市重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室;Department
【分類號(hào)】：R529.9
【正文快照】： 部重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室,兒童發(fā)育重大疾病國(guó)家國(guó)際科技合作基地,兒科學(xué)重慶市重點(diǎn)實(shí)驗(yàn)室1;2Department of Epidemiology,School of Public Health,University of Michigan,1415 Washington Heights,Ann Arbor,MI 48109-2029,USA)結(jié)核病(tuberculosis,TB)作為威脅全人類健康的慢性傳染病

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本文編號(hào)：1480647