本文關(guān)鍵詞：基于轉(zhuǎn)錄組測(cè)序技術(shù)的重癥手足口病差異表達(dá)基因研究　出處：《南華大學(xué)》2016年碩士論文　論文類(lèi)型：學(xué)位論文

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【摘要】：目的:應(yīng)用轉(zhuǎn)錄組測(cè)序技術(shù)(RNA-sequencing,RNA-seq)分析重癥手足口病(sever hand,foot and mouth disease,SHFMD)患兒外周血單個(gè)核細(xì)胞(peripheral blood mononuclear cell,PBMC)轉(zhuǎn)錄組情況,篩選SHFMD顯著差異表達(dá)基因(differently express genes,DEGs),為SHFMD的早期識(shí)別、及時(shí)治療提供理論依據(jù),為減少疾病死亡率、改善疾病愈后提供幫助。方法:收集2014年5月-2014年8月深圳市第三人民醫(yī)院收治的重癥和普通型手足口病(mild hand,foot and mouth disease,MHFMD)患兒各5例,以及5例健康體檢兒童的外周靜脈血5ml,分離PBMC并提取總RNA,采用RNA-seq技術(shù)篩選DEGs,并通過(guò)實(shí)時(shí)熒光定量PCR(quantitative real-time PCR,qRT-PCR)及酶聯(lián)免疫吸附測(cè)定法(enzyme-linked immunosorbent assay,ELISA)從轉(zhuǎn)錄組和蛋白組水平分別對(duì)RNA-seq篩選所得DEGs結(jié)果進(jìn)行再次檢測(cè)。結(jié)果:RNA-seq分析示SHFMD相對(duì)健康對(duì)照組(healthy control,HC組)共117個(gè)DEGs,其中108個(gè)基因上調(diào),9個(gè)基因下調(diào);SHFMD相對(duì)MHFMD組共26個(gè)DEGs,其中14個(gè)基因上調(diào),12個(gè)基因下調(diào);兩組DEGs中共有8個(gè)相同表達(dá)基因,其中S100A8、S100A12、IL-8和IL-1β表達(dá)上調(diào),TNFRSF13C、IL-7R、THBS1和VEGFA表達(dá)下調(diào)。進(jìn)一步qRT-PCR及ELISA檢測(cè)結(jié)果均與RNA-seq結(jié)果一致(P0.05)。結(jié)論:1.RNA-seq技術(shù)初步建立了HFMD差異基因表達(dá)譜。2.表達(dá)上調(diào)的S100A8、S100A12、IL-8、IL-1β和表達(dá)下調(diào)的TNFRSF13C、IL-7R、THBS1、VEGFA是SHFMD差異表達(dá)基因,有望成為HFMD重癥化的預(yù)測(cè)指標(biāo)。
【學(xué)位授予單位】：南華大學(xué)
【學(xué)位級(jí)別】：碩士
【學(xué)位授予年份】：2016
【分類(lèi)號(hào)】：R725.1

【參考文獻(xiàn)】

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本文編號(hào)：1335655