本文關(guān)鍵詞：上海地區(qū)兒童腹瀉病毒的分子流行病學(xué)研究

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【摘要】：目的監(jiān)測(cè)并分析上海地區(qū)住院和門(mén)診腹瀉兒童四種腹瀉病毒的分子流行病學(xué)特點(diǎn),以全面了解及客觀(guān)評(píng)估腹瀉病毒在兒童腹瀉發(fā)病中的作用,為腹瀉的防治和相關(guān)疫苗的開(kāi)發(fā)應(yīng)用提供基本數(shù)據(jù)和理論依據(jù)。 方法收集2006年1月至2011年12月在復(fù)旦大學(xué)附屬兒科醫(yī)院住院的腹瀉兒童(年齡≤5歲)糞便標(biāo)本674份,并收集2010年7月至2011年12月在復(fù)旦大學(xué)附屬兒科醫(yī)院門(mén)診就診的腹瀉兒童(年齡≤5歲)糞便標(biāo)本436份。采用RT-PCR方法檢測(cè)糞便標(biāo)本中的輪狀病毒(Rotavirus, RV)、杯狀病毒(Human calicivirus, HuCV)、星狀病毒(Human astro virus, HAstV)及腺病毒(Adeno virus,AdV)。采用引物分型的方法確定RV的基因型別,采用基因測(cè)序和進(jìn)化樹(shù)分析的方法確定諾如病毒(Norovirus, NV)、札幌病毒(Sapovirus, SaV)、HAstV和AdV的基因型別。采用SPSS16.0統(tǒng)計(jì)分析軟件對(duì)研究結(jié)果和臨床資料進(jìn)行統(tǒng)計(jì)分析。 結(jié)果一、2006-2011年住院腹瀉兒童腹瀉病毒的分子流行病學(xué)研究結(jié)果如下：1.腹瀉病毒的總檢出情況：四種腹瀉病毒的總檢出率為92.1%(621/674),RV、HuCV、HAstV及AdV的總檢出率分別為89.2%(601/674)、30.6%(206/674)、30.1%(203/674)及4.7%(32/674)。腹瀉兒童單一病毒感染的總檢出率為43.5%(293/674),并以RV的單獨(dú)感染為主,其他三種病毒單獨(dú)感染的總檢出率均2%。腹瀉兒童多重病毒感染的總檢出率為48.6%(328/674),2006-2011年病毒混合感染的檢出率呈下降趨勢(shì),2011年降為11.7%。多重混合感染中,以RV+HAstV、RV+HuCV及RV+HuCV+HAstV混合感染的檢出為主。2.院內(nèi)和非院內(nèi)感染腹瀉兒童腹瀉病毒的檢出：院內(nèi)感染引起腹瀉者占50.8%(302/626),以2009年(60.6%)和2008年(60.5%)最多,2011年降至24.5%。非院內(nèi)感染腹瀉者單一病毒的總檢出率(47.8%,147/308)顯著高于院內(nèi)感染腹瀉者(38.1%,121/318)(P0.05),單一病毒的感染均以RV為主。院內(nèi)感染腹瀉者感染多重腹瀉病毒的總檢出率(56.9%,181/318)顯著高于非院內(nèi)感染者(42.9%,132/308)(P0.05),且均以RV+HAstV及RV+HuCV的混合感染為主。3.RV基因型：①G基因型：雖2006-2011年G基因型以G3型為主,但G3型的流行呈波動(dòng)性下降趨勢(shì),由2006年的64.6%降為2011年的12.8%,而G9和G1型的流行呈上升趨勢(shì),且G9型(51.1%)成為2011年最主要的流行型別,G1型(19.1%)為當(dāng)年的次要流行型別。2006-2011年G混合基因型所占比例為10.3%(62/601),混合的G基因型種類(lèi)較多,以G1、G3及G9型的兩兩混合為主。②P基因型：2006-2011年P(guān)基因型以P[4]、P[8]及P混合型的流行為主,而每年P(guān)基因型的流行又處于波動(dòng)性變化中。P混合型以P[4]+P[8]型為主,其次為P[8]+P[10]型。③組合型別：P[8]G3型(27.5%)是上海地區(qū)2006-2011年間最主要的RV流行株,其次為PmG3及P[4]G3型。2011年P(guān)[8]G9型躍升為當(dāng)年最主要的流行型別(40.5%)。院內(nèi)感染和非院內(nèi)感染腹瀉兒童中檢出的RV基因型相似。4. HuCV基因型：檢出的206例HuCV陽(yáng)性標(biāo)本均屬NV屬且均為GⅡ型。以GⅡ.4型(75.7%,156/206)為主,其次為GⅡ.12型(22.3%,46/206)。GⅡ.4型中以2006b亞型(73.3%,151/206)的流行為主,同時(shí)還分別檢出2例GⅡ.7型及GⅡ.b型。院內(nèi)感染和非院內(nèi)感染腹瀉兒童中檢出的HuCV基因型無(wú)明顯差異。5. HAstV基因型：住院腹瀉兒童感染HAstV的基因型別單一,均為HAstV-1型。6.AdV基因型：AdV陽(yáng)性標(biāo)本的基因型別以Ad-41型為主,占50.0%(16/32),其次為Ad-3型(25.0%,8/32)。每年各種基因型的流行又有不同。院內(nèi)感染和非院內(nèi)感染腹瀉兒童檢出的AdV基因型無(wú)異。 二、2010-2011年門(mén)診腹瀉兒童的分子流行病學(xué)研究結(jié)果如下：1.總檢出情況：四種病毒的總檢出率為66.7%(291/436)。RV檢出率最高,為43.3%(189/436),其次為HuCV (29.4%,128/436), AdV (7.1%,31/436)及HAstV (1.8%,8/436)。門(mén)診腹瀉兒童以單一病毒的感染為主(51.8%,226/436),而RV感染的比例最高(30.0%,131/436),其次為HuCV (16.0%,72/436)。腹瀉病毒混合感染的比例為14.9%(65/436),混合感染中均為兩種病毒的混合感染,以RV+HuCV的雙重感染為主。2.RV的流行特點(diǎn)：①流行季節(jié)和年齡分布：2010-2011年門(mén)診RV性腹瀉以9-11月份為高峰,10月檢出率最高(70.0%),0-11月齡者(49.7%)所占比例最高,96.3%的患兒年齡在0-3歲之間。②基因型：G基因型以G1、G3和G9型的流行為主,檢出率分別為31.2%、28.6%和27.0%。P基因型以P[8]型為主(91.0%,172/189),其次為P[4]型(5.3%,10/189)。G混合基因型以G1+G9型(60.0%,12/20)為主。P混合基因型檢出較少(2.6%),主要是P[8]+P[4]型。P[8]G3、P[8]G1和P[8]G9型是主要流行的三種組合型別,所占比例分別為27.5%(52/189)、26.9%(51/189)和25.4%(48/189)。3. HuCV的流行特點(diǎn)：①流行季節(jié)和年齡分布：9-10月為門(mén)診腹瀉兒童HuCV性腹瀉的流行高峰,9月份(66.7%)的檢出率最高,6月的檢出率也高達(dá)60.0%,0-11月齡者最多(56.7%,72/128),97.6%的腹瀉患兒在0-3歲之間。②HuCV基因型：檢出的128例HuCV陽(yáng)性標(biāo)本中,126例屬NV屬,2例為SaV屬。所有NV株均為GⅡ型,并以GⅡ.4型(71.8%,92/126)為主,其次為GⅡ.b型(15.6%,20/126),尚檢出少量GⅡ.12、GⅡ.7及GⅡ.2型。GⅡ.4型中以2006b亞型(65.6%)為主,同時(shí)檢出8例2006a亞型。檢出的2例SaV分別是GI.2型及GⅡ.1型。4. HAstV基因型：門(mén)診腹瀉兒童HAstV陽(yáng)性者型別均為HAstV-1型。5.AdV基因型：以Ad-41型為主(45.2%,14/31),其次為Ad-3型(22.6%,7/31)及Ad-40型(16.1%,5/31)。此外還檢出2例Ad-12型及各1例Ad-2、5及19型。 結(jié)論上海地區(qū)無(wú)論是住院還是門(mén)診引起兒童腹瀉的主要病毒均為輪狀病毒和諾如病毒。相比以往上海地區(qū)的監(jiān)測(cè)資料,輪狀病毒和諾如病毒的流行型別又出現(xiàn)了新的變化。院內(nèi)感染與非院內(nèi)感染腹瀉患兒的臨床癥狀、多重感染比例均存在差異,但各病毒流行的主要基因型別相似。門(mén)診腹瀉兒童腺病毒的檢出率高于住院腹瀉兒童。住院與門(mén)診腹瀉兒童杯狀病毒、腺病毒的流行型別存在一定的差異。
【學(xué)位授予單位】：復(fù)旦大學(xué)
【學(xué)位級(jí)別】：碩士
【學(xué)位授予年份】：2013
【分類(lèi)號(hào)】：R725.1

【參考文獻(xiàn)】

中國(guó)期刊全文數(shù)據(jù)庫(kù) 前2條

1 林謙;金玉;周進(jìn)蘇;陸芬;李曉樂(lè);李玫;段招軍;;2009至2010年南京兒童醫(yī)院5歲以下兒童病毒性腹瀉分子流行病學(xué)特點(diǎn)[J];中國(guó)循證兒科雜志;2012年01期

2 Anita Chakravarti;Manisha Jain;Mayank Singh Chauhan;Anju Sharma;Sayani Tewari;;Nosocomial diarrhea in children:is astrovirus the leading pathogen?[J];Asian Pacific Journal of Tropical Medicine;2010年05期

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本文編號(hào)：1284740