孤兒受體RORγ的配體小分子的發(fā)現(xiàn)
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更多相關(guān)文章: 維甲酸受體相關(guān)孤兒受體 藥物設(shè)計(jì) 蛋白質(zhì)結(jié)晶
【摘要】:維甲酸受體相關(guān)孤兒受體RORγ是一類受配體調(diào)控的重要轉(zhuǎn)錄因子,在Th17細(xì)胞分泌IL-17等一系列促炎因子過(guò)程中扮演著重要的角色。通過(guò)抑制Th17活性,下調(diào)IL-17的表達(dá),調(diào)節(jié)Th17細(xì)胞與Treg細(xì)胞的平衡,從而減少炎癥反應(yīng)的發(fā)生,這使得RORγ成為一個(gè)非常具有研究?jī)r(jià)值的藥物靶點(diǎn)。針對(duì)RORγ開(kāi)展藥物發(fā)現(xiàn)研究有望為治療類風(fēng)濕性關(guān)節(jié)炎、多發(fā)性硬化癥等自身免疫相關(guān)疾病找到新的突破。 由于RORγ在疾病發(fā)展過(guò)程中的重要性,其配體的發(fā)現(xiàn)一直廣受關(guān)注。但到目前為止,還未有針對(duì)RORγ的上市藥物。針對(duì)當(dāng)前研究現(xiàn)狀,我們開(kāi)展了針對(duì)該孤兒受體為靶標(biāo)的藥物發(fā)現(xiàn)與設(shè)計(jì)研究,本課題主要進(jìn)行的工作分以下幾個(gè)方面: 一、使用計(jì)算機(jī)輔助藥物設(shè)計(jì)方法進(jìn)行先導(dǎo)化合物的篩選 首先針對(duì)現(xiàn)有的小分子化合物庫(kù)(約30萬(wàn)個(gè)),使用基于蛋白結(jié)構(gòu)的分子對(duì)接方法篩選。通過(guò)此方法挑選出可能作為目的蛋白配體的24個(gè)結(jié)構(gòu)不同的小分子化合物并購(gòu)買,用于活性測(cè)試。 二、目的蛋白R(shí)ORγ-LBD(Ligand binding domain)表達(dá)與純化 本課題采用原核表達(dá)方法:大腸埃希氏菌BL21(DE3)大量表達(dá)目的蛋白,再對(duì)菌株進(jìn)行高壓破碎處理,然后通過(guò)鎳柱親和層析、凝膠過(guò)濾層析等蛋白純化方法,獲得高純度目的蛋白。 三、小分子化合物抑制活性的測(cè)試 本課題使用AlphaScreen高通量篩選法和Luciferase雙報(bào)告基因檢測(cè)法等較為成熟的測(cè)活方法,,從通過(guò)虛擬篩選得到的24個(gè)小分子化合物中找到了一個(gè)表現(xiàn)最為良好的化合物S4(AlphaScreen IC50=13.83μM,Luciferase IC50=11.84μM)。以S4為先導(dǎo)化合物,對(duì)其進(jìn)行修飾改造獲得一系列結(jié)構(gòu)相似的小分子化合物(約120個(gè),由本組薛曉纖同學(xué)完成),采用同樣方法測(cè)試抑制活性,有四個(gè)化合物表現(xiàn)較為突出。這四個(gè)化合物分別命名為Cmpd1,Cmpd2,Cmpd3,Cmpd4。其中Cmpd1(AlphaScreen IC50=3.83μM,LuciferaseIC50=0.14μM)和Cmpd4(AlphaScreen IC50=5.88μM,Luciferase IC50=0.09μM)的IC50值接近或優(yōu)于報(bào)道過(guò)的陽(yáng)性化合物T1317的IC50值(AlphaScreen IC50=2.01μM,LuciferaseIC50=0.53μM)。 四、蛋白質(zhì)的結(jié)晶實(shí)驗(yàn) 本課題通過(guò)使用本實(shí)驗(yàn)組晶體篩選條件,采用坐滴法對(duì)目的蛋白和篩選出的小分子化合物進(jìn)行復(fù)合物的共結(jié)晶,目的是得到復(fù)合物晶體。但由于此蛋白結(jié)構(gòu)的性質(zhì)獨(dú)特,暫未得到符合X射線衍射標(biāo)準(zhǔn)的蛋白質(zhì)晶體。因此,我們嘗試通過(guò)蛋白熱穩(wěn)定實(shí)驗(yàn)(TSA)來(lái)分析目的蛋白的熱穩(wěn)定性及蛋白結(jié)晶條件。目前已取得一定的實(shí)驗(yàn)依據(jù),為今后的結(jié)晶工作提供了寶貴的實(shí)驗(yàn)依據(jù)。 綜上,本課題已成功獲得了陽(yáng)性化合物Digoxin和UA的衍射數(shù)據(jù);同時(shí)成功地通過(guò)計(jì)算機(jī)輔助設(shè)計(jì)篩選獲得了有效的先導(dǎo)化合物。在此基礎(chǔ)上對(duì)先導(dǎo)化合物的進(jìn)一步修飾改造,得到了抑制效果更好的小分子化合物;通過(guò)分子模擬方法獲得的化合物與RORγ的結(jié)合模式預(yù)測(cè)和分析,獲得了重要的構(gòu)效關(guān)系信息。該研究為今后針對(duì)RORγ的藥物篩選提供了有效的實(shí)驗(yàn)依據(jù)。
【學(xué)位授予單位】:吉林大學(xué)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【學(xué)位授予年份】:2014
【分類號(hào)】:R593.2
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本文編號(hào):1201204
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