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亳州市手足口病流行特點(diǎn)及腸道病毒71型VP1基因特征分析

發(fā)布時(shí)間:2017-10-27 04:00

  本文關(guān)鍵詞:亳州市手足口病流行特點(diǎn)及腸道病毒71型VP1基因特征分析


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【摘要】:手足口病(Hand-foot-mouth disease,HFMD)是由不同種腸道病毒引起的常見傳染病,以嬰幼兒發(fā)病為主。我國安徽省阜陽市2008年3月份開始流行的手足口病,經(jīng)中國疾病預(yù)防控制中心(Chinese Center for Disease Control and Prevention,China CDC)檢查確認(rèn)主要病原體是EV71,2008年5月手足口病被衛(wèi)生部按照丙類傳染病進(jìn)行管理。時(shí)隔多年手足口病發(fā)病形勢(shì)依然嚴(yán)峻,亳州市作為當(dāng)年較為嚴(yán)重的疫情地阜陽市的緊鄰,該市手足口病病原體的流行情況及腸道病毒71型分子流行病學(xué)情況如何?本課題就擬對(duì)亳州市手足口病病原體情況以及該市腸道病毒71型分子分型和進(jìn)化情況的進(jìn)行研究,以滿足臨床診治與流行病學(xué)研究需要,更有效的對(duì)HFMD進(jìn)行實(shí)驗(yàn)室診斷與監(jiān)測(cè)。目的:通過對(duì)2012年5月至2013年4月住院的疑似手足口病患兒的咽拭子提取病毒RNA的方法,應(yīng)用實(shí)時(shí)熒光RT-PCR技術(shù)檢測(cè)病原體類別,收集相關(guān)病歷資料,并對(duì)EV71感染情況進(jìn)行統(tǒng)計(jì)及應(yīng)用聚合酶鏈反應(yīng)技術(shù)與生物信息學(xué)方法對(duì)EV71VP1片段進(jìn)行分析,研究該市手足口病流行病學(xué)特征、EV71感染者臨床特點(diǎn)及EV71基因分型和分子進(jìn)化情況,為HFMD的診斷治療、預(yù)防監(jiān)測(cè)提供可靠的科學(xué)依據(jù)結(jié)果:1、1175例疑似手足口病的住院患者的咽拭子標(biāo)本中,男782例,女393例,共檢出腸道病毒陽性患者562例。不同性別間腸道病毒感染差異無統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(χ2=3.434,P=0.064),不同性別間EV71感染和非EV71非Cox-A16腸道病毒感染差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(χ2=4.765,P=0.029)。不同年齡組間感染腸道病毒的差異無統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(χ2=1.603,P=0.449),但已感染腸道病毒者在不同年齡組間EV71感染和非EV71非Cox-A16腸道病毒感染差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(χ2=8.422,P=0.015)。在196例ev71感染病例中,男124例,女72例,男女比例為1.72:1,年齡范圍為4個(gè)月~6歲,平均年齡1.8歲,其中0歲~1歲的患者96人,1歲~3歲的患者88人,3歲以上的患者12人,ev71感染病例以3歲以下兒童為主,占本次ev71感患者的93.9%;在6例cox-a16感染病例中,男5例,女1例,男女比例為5:1,年齡范圍為1歲~4歲,平均年齡1.68歲,其中0歲~1歲的患者4人,2歲~3歲的患者1人,3歲以上的患者1人,cox-a16感染病例也以3歲以下兒童為主,占83.3%;360例非ev71非cox-a16腸道病毒感染者中,男260例,女100例,男女比例為2.6:1,年齡范圍為1歲~9歲,平均年齡1.58歲,其中0歲~1歲的患者222人,2歲~3歲的患者123人,3歲以上的患者15人,非ev71非cox-a16腸道病毒病例也以3歲以下兒童為主,占95.8%。腸道病毒的感染在各月份的差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(χ2=72.324,p0.05),呈現(xiàn)以春夏季多發(fā)態(tài)勢(shì)。在不同月份ev71和非ev71非cox-a16腸道病毒感染差異有統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(χ2=42.992,p0.05)。196例ev71感染者的月份分布也以春夏季發(fā)病為主,4月份為高峰期。三型患者的發(fā)病年齡段分布差異型無統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(χ2=1.038,p=0.904),不同臨床分型ev71感染病例在各月份的分布差異無統(tǒng)計(jì)學(xué)意義(χ2=18.479,p=0.425)。2、6株來源于不同疾病程度的樣本測(cè)序成功,6株ev71vp1基因間的核苷酸相似性為96.0%~99.7%,氨基酸相似性為94.6%~100%,來源不同疾病程度的ev71vp1基因未發(fā)現(xiàn)特異性核苷酸變異。在系統(tǒng)進(jìn)化樹上,存在多個(gè)傳播鏈,均與c4a亞型代表株處于同一分支,核苷酸相似性為96.0%~98.6%,氨基酸相似性為98.0~99.6%。結(jié)論:1、2012年5月至2013年4月亳州市1175例疑似hfmd的患者咽拭子標(biāo)本中共檢出腸道病毒陽性患者562例,以非ev71非cox-a16型腸道病毒感染者為主。2、2012年5月至2013年4月亳州市手足口病腸道病毒感染在年齡段、別等人群分布特點(diǎn)上無統(tǒng)計(jì)學(xué)差異;腸道病毒核酸陽性人群不同種腸道病毒感染在性別與年齡上有統(tǒng)計(jì)學(xué)差異,不同性別和年齡段間易感非ev71非cox-a16腸道病毒感染者。3、2012年5月至2013年4月亳州市手足口病發(fā)病集中在4月份-6月份,呈現(xiàn)春夏季多發(fā)態(tài)勢(shì)。非EV71非COX-A16型腸道病毒是研究期間的主要病原體。4、2012年5月至2013年4月間EV71是亳州市手足口病患者危、重癥患者主要病原體。非EV71非COX-A16型腸道病毒和COX-A16型腸道病毒以普通型病例為主。5、2012年5月至2013年4月亳州市EV71流行株為C4a亞型,存在多個(gè)傳播鏈,存在地區(qū)性差異,各毒株核苷酸與氨基酸變異相似,與周邊省市的流行株為同一進(jìn)化分支。6、2012年5月至2013年4月亳州市EV71感染者不同疾病分型的病毒核苷酸與氨基酸變異相似。
【關(guān)鍵詞】:手足口病 流行病學(xué) 亳州市 腸道病毒71型 基因型
【學(xué)位授予單位】:安徽醫(yī)科大學(xué)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【學(xué)位授予年份】:2015
【分類號(hào)】:R725.1
【目錄】:
  • 縮略語表7-8
  • 摘要8-11
  • Abstract11-15
  • 前言15-19
  • 第一部分 手足.病病原體檢測(cè)及流行病學(xué)特征分析19-31
  • 引言19
  • 1 材料與方法19-24
  • 1.1 材料19-21
  • 1.1.1 樣本來源19-20
  • 1.1.2 診斷標(biāo)準(zhǔn)20
  • 1.1.3 樣本的采集和處理20-21
  • 1.1.4 試劑使用21
  • 1.1.5 儀器與耗材21
  • 1.2 方法21-24
  • 1.2.1 核酸提取21-22
  • 1.2.2 熒光定量RT-PCR檢測(cè)樣本22-23
  • 1.2.3 結(jié)果判讀23-24
  • 1.2.4 質(zhì)量控制24
  • 1.2.5 統(tǒng)計(jì)學(xué)處理24
  • 2 結(jié)果24-28
  • 3 討論28-29
  • 4 結(jié)論29-31
  • 第二部分EV71 VP1區(qū)核酸檢測(cè)及基因序列分析31-43
  • 引言31
  • 1 材料與方法31-35
  • 1.1 材料31-33
  • 1.1.1 標(biāo)本來源31
  • 1.1.2 標(biāo)本選取和保存31
  • 1.1.3 試劑使用31-32
  • 1.1.4 儀器與耗材32-33
  • 1.2 方法33-35
  • 1.2.1 病毒RNA的提取33
  • 1.2.2 EV71 VP1區(qū)引物設(shè)計(jì)33-34
  • 1.2.3 VP1區(qū)RT-PCR34
  • 1.2.4 擴(kuò)增產(chǎn)物電泳檢測(cè)與序列測(cè)定34-35
  • 1.2.5 核苷酸序列拼接與比對(duì)分析35
  • 1.2.6 EV71VP1同源性分析與系統(tǒng)進(jìn)化樹的構(gòu)建35
  • 2 結(jié)果35-40
  • 2.1 亳州市EV71流行株VP1區(qū)PCR擴(kuò)增產(chǎn)物瓊脂糖電泳35-36
  • 2.2 亳州市EV71流行株核苷酸測(cè)序與比對(duì)分型結(jié)果36-37
  • 2.3 EV71流行株與其他EV71毒株的核苷酸與氨基酸同源性與相似性分析37-39
  • 2.4 亳州市EV71流行株與其他EV71毒株核苷酸系統(tǒng)進(jìn)化樹分析 .. 3339-40
  • 3 討論40-42
  • 4 結(jié)論42-43
  • 參考文獻(xiàn)43-48
  • 本人簡(jiǎn)歷48
  • 碩士在讀期間發(fā)表的論文目錄48-49
  • 致謝49-50
  • 綜述50-56
  • 參考文獻(xiàn)54-56

【參考文獻(xiàn)】

中國期刊全文數(shù)據(jù)庫 前5條

1 陳賢豐;鄧列華;;廣州天河區(qū)手足口病流行病學(xué)和臨床上的某些特點(diǎn)[J];暨南大學(xué)學(xué)報(bào)(自然科學(xué)與醫(yī)學(xué)版);1990年04期

2 范凱;張旭;宋穎;莫曉艷;張新巖;;2008-2011年遼寧省錦州市手足口病病原監(jiān)測(cè)結(jié)果分析[J];疾病監(jiān)測(cè);2012年02期

3 許一玲;李棟;;淄博市張店區(qū)手足口病流行與氣象因素的關(guān)系研究[J];熱帶醫(yī)學(xué)雜志;2010年10期

4 王祥英;錢樹生;石秀芳;敖家富;;亳州地區(qū)384例手足口病患兒腸道病毒實(shí)時(shí)RT-PCR檢測(cè)結(jié)果分析[J];熱帶醫(yī)學(xué)雜志;2012年11期

5 朱冰;鐘家禹;鄺璐;華亮;肖密絲;陳翊;謝嘉慧;張瑩瑩;;2010年廣州地區(qū)兒童腸道病毒71型感染的分子流行病學(xué)研究[J];中華醫(yī)院感染學(xué)雜志;2011年12期

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本文編號(hào):1101793

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