本文關(guān)鍵詞：DNA條形碼技術(shù)鑒定中國地方雞品種的重新評估

  更多相關(guān)文章： 線粒體COI基因 DNA條形碼 地方雞種 品種鑒定 遺傳多樣性

【摘要】：【目的】探討COI基因作為標(biāo)準(zhǔn)DNA條形碼技術(shù)鑒定外形差異較小的地方雞品種的可行性�！痉椒ā恳匀A南地區(qū)9種優(yōu)質(zhì)地方雞(懷鄉(xiāng)雞、清遠(yuǎn)麻雞、惠陽胡須雞、中山沙欄雞、陽山雞、杏花雞、五華三黃雞、文昌雞和廣西三黃雞)和國外引進(jìn)品種隱性白羽雞為試驗(yàn)材料,測定標(biāo)準(zhǔn)的DNA條形碼技術(shù)的線粒體細(xì)胞色素C氧化酶亞基I(cytochrome C oxidase subunit I,COI),同時(shí)下載已發(fā)表的31條家雞和原雞及綠頭鴨的COI基因序列,分析品種遺傳多樣性與遺傳距離,構(gòu)建單倍型中介網(wǎng)絡(luò)圖和系統(tǒng)發(fā)生鄰接樹,界定區(qū)分品種特異的單倍型�！窘Y(jié)果】除去PCR引物序列,獲得了695 bp COI基因片段。根據(jù)標(biāo)準(zhǔn)的DNA條形碼序列,截取648 bp線粒體COI基因序列進(jìn)行分析。10個(gè)雞品種203個(gè)個(gè)體共檢測到110個(gè)變異位點(diǎn),占分析位點(diǎn)的16.98%,其中90個(gè)單一位點(diǎn)突變,20個(gè)簡約信息位點(diǎn)。平均核苷酸多樣性為0.00394(0.00349—0.00560),平均單倍型多樣性為0.832(0.763—0.905),其中五華三黃雞最高,中山沙欄雞次之,文昌雞最低。定義了84種單倍型,單倍型1為9個(gè)地方雞種所共享,出現(xiàn)頻率為64次;單倍型9和5為家雞和隱性白羽雞共享,出現(xiàn)頻率分別為29次和19次;每個(gè)雞品種均有品種特異的單倍型。廣西三黃雞、五華三黃雞與中山沙欄雞的單倍型數(shù)最多,為13個(gè),隱性白羽雞與清遠(yuǎn)麻雞的最少,為8個(gè)。不同品種的單倍型分布差異較大,如杏花雞的單倍型主要分布在1,清遠(yuǎn)麻雞主要分布在1和9,惠陽胡須雞主要分布在1、5和9,隱性白羽雞主要分布在9和79。10個(gè)雞種品種間遺傳距離范圍為0.003—0.006,凈遺傳距離為0—0.003;雞品種間的遺傳距離一般大于雞品種內(nèi)的遺傳距離;綠頭鴨與雞品種間的遺傳距離大于0.2。中介網(wǎng)絡(luò)圖將84個(gè)單倍型分為3條進(jìn)化枝,呈現(xiàn)出一定的品種特異性,如以單倍型9為起點(diǎn)的進(jìn)化枝沒有廣西三黃雞和文昌雞分布,但另外兩枝未表現(xiàn)出此特征;1為祖先單倍型,由此逐漸衍生出其他單倍型。鄰接樹顯示中國家雞與紅原雞聚為一簇,與黑尾原雞、灰原雞和綠原雞分開;中國地方雞聚為同一簇,且存在明顯的交叉現(xiàn)象,無顯著的品種特異性�！窘Y(jié)論】COI基因可作為研究雞品種遺傳多樣性的候選分子標(biāo)記。僅依靠標(biāo)準(zhǔn)的DNA條形碼技術(shù)無法有效區(qū)分差異外形較小的地方雞種,需要聯(lián)合多種分子標(biāo)記如COI基因、細(xì)胞色素b、AFLP指紋技術(shù)、微衛(wèi)星位點(diǎn)LEI0258、基因組SNP和品種特異的外貌特征。
【作者單位】： 嘉應(yīng)學(xué)院生命科學(xué)學(xué)院;華南農(nóng)業(yè)大學(xué)動(dòng)物科學(xué)學(xué)院;
【關(guān)鍵詞】： 線粒體COI基因 DNA條形碼 地方雞種 品種鑒定 遺傳多樣性
【基金】：廣東省自然科學(xué)基金(2014A030307018) 嘉應(yīng)學(xué)院“創(chuàng)新強(qiáng)校工程”項(xiàng)目(CQX019) 廣東省公益研究與能力建設(shè)項(xiàng)目(2015A020208020)
【分類號】：S831
【正文快照】： 件,其中條形碼研究3 881 860,物種數(shù)為235 994[9]。0引言KERR等[10]通過研究643種北美鳥類COI基因,發(fā)現(xiàn)【研究意義】作為分布最廣泛的家禽,家雞94%的種類擁有明顯的條形碼分支,剩余的6%大部分(Gallus gallus domesticus)在人類生產(chǎn)生活中扮演著是有規(guī)律雜交的物種。WARD[11]總

【相似文獻(xiàn)】

中國期刊全文數(shù)據(jù)庫 前10條

1 ;加快地方雞種開發(fā)推動(dòng)產(chǎn)業(yè)優(yōu)化升級——記江蘇省家禽科學(xué)研究所地方雞種開發(fā)中心[J];中國禽業(yè)導(dǎo)刊;2001年09期

2 張學(xué)余,沈曉鵬;發(fā)展地方雞種生產(chǎn)的途徑[J];內(nèi)蒙古畜牧科學(xué);2002年02期

3 王文華;譚正富;周玲;鄧富遠(yuǎn);;論我國地方雞種的保護(hù)和利用[J];現(xiàn)代農(nóng)業(yè)科技;2010年01期

4 ;矮小型基因簡介[J];當(dāng)代畜牧;1985年03期

5 顧志良，黃凡美;我國地方雞種研究和利用現(xiàn)狀[J];當(dāng)代畜牧;1994年04期

6 李朝國;湖北省地方雞種的利用簡況及打算[J];中國家禽;1998年07期

7 李朝國;我國地方雞種的保護(hù)與利用[J];中國牧業(yè)通訊;1998年06期

8 徐國慶;王長青;韓書英;;地方雞生態(tài)規(guī)�；B(yǎng)殖技術(shù)[J];安徽農(nóng)業(yè)科學(xué);2014年06期

9 簡承松,朱文適,張永亮,李敬丹,金深遜,陶宇航,顧永芬;貴州部分地方雞品種的血漿酯酶多態(tài)性研究[J];中國家禽;2000年08期

10 魏彩藩;我國地方雞種資源及開發(fā)利用前景[J];中國家禽;2001年21期

中國重要會(huì)議論文全文數(shù)據(jù)庫 前10條

1 王克華;王志躍;王勇;竇套存;張學(xué)余;陳寬維;;地方雞保種技術(shù)方案[A];中國家禽科學(xué)研究進(jìn)展——第十四次全國家禽科學(xué)學(xué)術(shù)討論會(huì)論文集[C];2009年

2 鄒劍敏;;我國地方雞種的保護(hù)與開發(fā)利用[A];中國禽業(yè)發(fā)展大會(huì)暨中國畜牧業(yè)協(xié)會(huì)禽業(yè)分會(huì)第二屆會(huì)員代表大會(huì)論文集[C];2007年

3 沙文鋒;朱娟;顧擁建;戴暉;陳啟康;;我國地方雞肉質(zhì)風(fēng)味的研究進(jìn)展[A];第三屆（2012）中國黃羽肉雞行業(yè)發(fā)展大會(huì)會(huì)刊[C];2012年

4 陳蓉;秦玉蓉;陳國宏;戴有理;常國斌;;地方雞種小分子RNA在性腺中表達(dá)形式的初步研究[A];中國家禽科學(xué)研究進(jìn)展——第十四次全國家禽科學(xué)學(xué)術(shù)討論會(huì)論文集[C];2009年

5 扶國才;竇套存;劉偉平;王克華;;地方雞種在仿土蛋雞配套中的應(yīng)用初探[A];中國家禽業(yè)——機(jī)遇與挑戰(zhàn)——第十三次全國家禽學(xué)術(shù)討論會(huì)論文集[C];2007年

6 武艷平;霍俊宏;林秀;康昭風(fēng);季華員;謝明貴;謝金防;;江西地方雞種的系統(tǒng)關(guān)系研究[A];安全優(yōu)質(zhì)的家禽生產(chǎn)——第十五次全國家禽學(xué)術(shù)討論會(huì)論文集[C];2011年

7 雷秋霞;周艷;曹頂國;韓海霞;李福偉;李桂明;逯巖;;山東省地方雞種質(zhì)資源保存與創(chuàng)新利用[A];中國家禽科學(xué)研究進(jìn)展——第十四次全國家禽科學(xué)學(xué)術(shù)討論會(huì)論文集[C];2009年

8 張學(xué)余;嵇寶華;韓威;陳國宏;;2個(gè)地方雞種染色體核型分析[A];中國家禽業(yè)——機(jī)遇與挑戰(zhàn)——第十三次全國家禽學(xué)術(shù)討論會(huì)論文集[C];2007年

9 湯青萍;俞亞波;屠云潔;陳寬維;章雙杰;趙東偉;;閩粵文化區(qū)12個(gè)地方雞品種遺傳多樣性檢測分析[A];中國家禽業(yè)——機(jī)遇與挑戰(zhàn)——第十三次全國家禽學(xué)術(shù)討論會(huì)論文集[C];2007年

10 陳國宏;王得前;吳信生;張學(xué)余;王克華;成榮;劉博;徐琪;周群蘭;;運(yùn)用微衛(wèi)星技術(shù)分析中國地方雞品種的親緣關(guān)系[A];家禽研究最新進(jìn)展——第十一次全國家禽學(xué)術(shù)討論會(huì)論文集[C];2003年

中國重要報(bào)紙全文數(shù)據(jù)庫 前6條

1 王道坤;怎樣做好地方雞種保護(hù)工作[N];河南科技報(bào);2008年

2 姜長春　張晨;國家地方雞種基因庫在江都建成[N];新華日報(bào);2010年

3 本報(bào)記者 雷莉云 實(shí)習(xí)記者 龍夢晴;土雞也能變“鳳凰”[N];湖南科技報(bào);2002年

4 本報(bào)記者 馮梓劍 通訊員 陳秀清;南寧建成西南地方雞活體基因庫[N];南寧日報(bào);2014年

5 全國畜牧總站體系建設(shè)與推廣處;畜禽養(yǎng)殖技術(shù)推廣專題[N];中國畜牧獸醫(yī)報(bào);2014年

6 記者 余方覺 孫吉晶 寧海記者站 陳云松;“振寧黃雞”榮冠 全省首個(gè)“國字號”[N];寧波日報(bào);2012年

中國博士學(xué)位論文全文數(shù)據(jù)庫 前4條

1 吳信生;利用微衛(wèi)星技術(shù)分析中國部分地方雞品種遺傳多樣性及其與生產(chǎn)性能的關(guān)系[D];揚(yáng)州大學(xué);2004年

2 曲魯江;中國地方雞種分子遺傳多樣性研究[D];中國農(nóng)業(yè)大學(xué);2004年

3 徐日福;中國部分地方雞種MHC B-LBⅡ、B-G基因變異及其群體遺傳結(jié)構(gòu)研究[D];華中農(nóng)業(yè)大學(xué);2005年

4 季從亮;雞肉IMP含量相關(guān)候選基因SNP篩查及其用于地方雞種群體遺傳結(jié)構(gòu)分析的研究[D];揚(yáng)州大學(xué);2005年

中國碩士學(xué)位論文全文數(shù)據(jù)庫 前10條

1 王德前;運(yùn)用微衛(wèi)星標(biāo)記分析地方雞親緣關(guān)系[D];揚(yáng)州大學(xué);2003年

2 沈見成;利用微衛(wèi)星標(biāo)記研究9個(gè)地方雞種的遺傳多樣性[D];揚(yáng)州大學(xué);2004年

3 劉博;利用血液蛋白質(zhì)（酶）多態(tài)性分析我國部分地方雞種的親緣關(guān)系[D];揚(yáng)州大學(xué);2004年

4 宋春紅;中國6個(gè)地方雞品種的母系起源及其遺傳多樣性[D];山東農(nóng)業(yè)大學(xué);2007年

5 馮文華;中國地方雞品種生態(tài)系統(tǒng)多樣性及其對生產(chǎn)性能的影響[D];河北農(nóng)業(yè)大學(xué);2014年

6 鄧呈遜;利用微衛(wèi)星標(biāo)記對六個(gè)湖北省地方雞群遺傳多樣性的研究[D];華中農(nóng)業(yè)大學(xué);2005年

7 陳紅菊;利用微衛(wèi)星標(biāo)記分析山東地方雞品種的遺傳多樣性[D];山東農(nóng)業(yè)大學(xué);2002年

8 童海兵;地方雞種類型對優(yōu)質(zhì)雞配套系肉用性能及肉品質(zhì)的影響[D];中國農(nóng)業(yè)大學(xué);2004年

9 趙生國;中國地方雞種線粒體DNA（mtDNA）遺傳多樣性研究[D];甘肅農(nóng)業(yè)大學(xué);2006年

10 牛巖;河南省地方雞遺傳資源調(diào)查及種質(zhì)特性比較研究[D];河南農(nóng)業(yè)大學(xué);2008年

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本文編號：951680