安徽東流水牛線粒體D-Loop區(qū)遺傳多樣性與系統(tǒng)進(jìn)化分析
發(fā)布時間:2017-09-27 21:40
本文關(guān)鍵詞:安徽東流水牛線粒體D-Loop區(qū)遺傳多樣性與系統(tǒng)進(jìn)化分析
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【摘要】:【目的】分析安徽東流水牛群體的分子遺傳特性,為今后開展我國地方水牛品種研究提供科學(xué)依據(jù)!痉椒ā坎捎脺y序技術(shù)測定安徽東至縣31頭東流水牛線粒體DNA(mtDNA)D-Loop序列,結(jié)合GenBank數(shù)據(jù)庫中已報道的22個群體的471條中國水牛D-Loop序列進(jìn)行聯(lián)合分析,利用DnaSP 5.1軟件統(tǒng)計核苷酸多樣性和單倍型多樣性,利用MEGA 5.10軟件構(gòu)建N-J系統(tǒng)發(fā)生樹,利用Network 4.60軟件構(gòu)建單倍型的media-joining網(wǎng)絡(luò)!窘Y(jié)果】在22個中國水牛群體中發(fā)現(xiàn)163個變異位點,180個單倍型,其核苷酸多樣性為0.018 23±0.002 21,單倍型多樣性為0.877 40±0.013 80,其中在東流水牛D-Loop序列中發(fā)現(xiàn)70個變異位點,構(gòu)成35種單倍型,其核苷酸多樣性為0.013 31±0.002 08,單倍型多樣性為0.944 00±0.023 00,群體變異性水平與中國其他水牛群體接近。N-J系統(tǒng)發(fā)生樹和media-joining進(jìn)化網(wǎng)絡(luò)顯示,中國水牛分為沼澤型和江河型,前者又分為A和B支系,B支系包括b1和b22個亞支系,東流水牛分布于A和B支系中。【結(jié)論】東流水牛群體遺傳多樣性豐富,且線粒體具有2個母系來源。
【作者單位】: 安徽省農(nóng)業(yè)科學(xué)院畜牧獸醫(yī)研究所;
【關(guān)鍵詞】: 水牛 線粒體DNA 遺傳多樣性 單倍型
【基金】:國家肉牛牦牛產(chǎn)業(yè)技術(shù)體系項目-合肥綜合試驗站(CARS-38) 安徽省農(nóng)業(yè)科學(xué)院院長青年創(chuàng)新基金項目(14B0428)
【分類號】:S823.83
【正文快照】: 水牛是我國南方的傳統(tǒng)家畜,主要分布于北緯36°以南,東經(jīng)97°以東的廣大地區(qū)[1],是我國熱帶、亞熱帶水稻區(qū)的主要役畜,在農(nóng)業(yè)生產(chǎn)和畜牧業(yè)生產(chǎn)中具有重要的經(jīng)濟(jì)價值。據(jù)2013年聯(lián)合國糧農(nóng)組織FAO統(tǒng)計(http://faostat.fao.org),我國水牛存欄數(shù)2 300多萬頭,居世界第3位。在系統(tǒng)分
【相似文獻(xiàn)】
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1 楊東英;;德州驢線粒體DNA D-loop多態(tài)性分析[J];廣東農(nóng)業(yè)科學(xué);2008年09期
2 雷初朝,陳宏,王德解,楊公社,孫維斌;關(guān)中驢線粒體DNA D-loop多態(tài)性分析[J];中國畜牧雜志;2004年04期
3 ;[J];;年期
,本文編號:932057
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