可樂(lè)豬乳頭數(shù)性狀全基因組關(guān)聯(lián)分析
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【摘要】:乳頭數(shù)性狀是豬最重要的繁殖性狀之一,與養(yǎng)豬業(yè)的經(jīng)濟(jì)效益密切相關(guān)。本試驗(yàn)以Illunima Porcine SNP60K芯片對(duì)22頭可樂(lè)豬進(jìn)行基因分型,通過(guò)Plink 1.07軟件,基于混合線性模型對(duì)左乳頭數(shù)、右乳頭數(shù)和總?cè)轭^數(shù)性狀進(jìn)行全基因組關(guān)聯(lián)分析。經(jīng)過(guò)嚴(yán)格的質(zhì)量控制和多重檢驗(yàn)之后,共鑒定出全基因組水平潛在關(guān)聯(lián)的SNPs位點(diǎn)4個(gè)(P2.06E-5);染色體水平顯著關(guān)聯(lián)位點(diǎn)3個(gè),潛在關(guān)聯(lián)位點(diǎn)18個(gè);在關(guān)聯(lián)SNP位點(diǎn)可能連鎖的上、下游1cM區(qū)間內(nèi)檢索到304個(gè)基因,其中Wnt及Fgf信號(hào)通路中的候選基因BTRC、FGF5、FGF8和BMP3、RASGEF1B、HMGB3可能影響豬的乳頭數(shù)性狀或繁殖性狀。通過(guò)全基因組關(guān)聯(lián)分析策略發(fā)掘出的關(guān)聯(lián)SNP位點(diǎn)及潛在候選基因,將為可樂(lè)豬的選育保種奠定基礎(chǔ)。
【作者單位】: 貴州大學(xué)生命科學(xué)學(xué)院;貴州大學(xué)農(nóng)業(yè)生物工程研究院;貴州大學(xué)動(dòng)物科學(xué)學(xué)院;銅仁學(xué)院;
【關(guān)鍵詞】: SNP芯片 全基因組關(guān)聯(lián)分析 乳頭數(shù)
【基金】:國(guó)家高技術(shù)研究發(fā)展計(jì)劃(863計(jì)劃)課題(2013AA102503) 貴州大學(xué)創(chuàng)新基金(2015009);貴州大學(xué)“本科教學(xué)工程”項(xiàng)目(BKJX2012007) 貴州省農(nóng)業(yè)攻關(guān)項(xiàng)目(黔科合NY[2013]3073號(hào)) 貴州省科技創(chuàng)新人才團(tuán)隊(duì)建設(shè)專項(xiàng)(黔科合人才團(tuán)隊(duì)2009-4006)
【分類號(hào)】:S828
【正文快照】: 繁殖性狀不僅影響母豬的繁殖力,而且直接影響?zhàn)B豬業(yè)的經(jīng)濟(jì)效益。乳頭數(shù)是一個(gè)具有中等遺傳力的復(fù)雜性狀,有相對(duì)穩(wěn)定的遺傳特性,是衡量母豬哺育能力的非常重要的指標(biāo)之一,其遺傳力評(píng)估值大多為0.22h20.41,母豬的乳頭數(shù)與產(chǎn)仔數(shù)、產(chǎn)活仔數(shù)、斷奶體重等有著較強(qiáng)的相關(guān)性[1]。全
【相似文獻(xiàn)】
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本文編號(hào):923438
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