本文關(guān)鍵詞：中國家養(yǎng)雙峰駝Y染色體SNP、STR、CNV與父系起源研究

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【摘要】：利用Y染色體分子標(biāo)記探究中國家養(yǎng)雙峰駝父系的起源與系統(tǒng)進(jìn)化,可以為雙峰駝種質(zhì)資源的保護(hù)和合理利用提供科學(xué)依據(jù)。本試驗(yàn)以中國河西駱駝、青海駱駝、阿拉善駱駝、蘇尼特駱駝、南疆駱駝、北疆駱駝和東疆駱駝4個(gè)省區(qū)7個(gè)家養(yǎng)雙峰駝群體雄性個(gè)體為研究對(duì)象,通過對(duì)Y染色體USP9Y、UTY、DBY、SRY基因的部分序列測序,篩選Y-SNP多態(tài)標(biāo)記,以明確不同中國家養(yǎng)雙峰駝群體間的系統(tǒng)進(jìn)化關(guān)系和父系結(jié)構(gòu);運(yùn)用熒光標(biāo)記引物測序法篩選Y染色體特異的微衛(wèi)星多態(tài)位點(diǎn),以揭示中國家養(yǎng)雙峰駝父系起源進(jìn)化問題;運(yùn)用實(shí)時(shí)熒光定量PCR技術(shù)檢測HSFY和SRY基因的拷貝數(shù),以期探究家養(yǎng)雙峰駝個(gè)體間拷貝數(shù)的變異,為之后起源進(jìn)化關(guān)系以及與雄性個(gè)體繁殖性能相關(guān)性的研究奠定基礎(chǔ)。結(jié)果如下:1.中國家養(yǎng)雙峰駝Y-SNP與父系起源的研究Y染色體特異區(qū)的USP9Y、UTY、DBY、SRY 4個(gè)基因的部分序列測序結(jié)果顯示:共篩選到29對(duì)Y染色體特異的引物,除SRY基因的引物外,其它28對(duì)引物的擴(kuò)增序列比對(duì)結(jié)果顯示所選基因攜帶有相同的單倍型,群體間分化程度較小,由此表明中國家養(yǎng)雙峰駝的父系起源較為單一。本試驗(yàn)首次發(fā)現(xiàn)SRY基因在中國家養(yǎng)雙峰駝Y染色體上是以多拷貝的形式存在,不能用于中國家養(yǎng)雙峰駝Y染色體遺傳多樣性的研究。2.中國家養(yǎng)雙峰駝Y-STR與父系起源的研究本試驗(yàn)首次利用熒光標(biāo)記引物測序法篩選雙峰駝Y染色體特異的微衛(wèi)星,并且在USP9Y基因內(nèi)發(fā)現(xiàn)一段微衛(wèi)星序列。通過對(duì)所研究個(gè)體進(jìn)行比較,結(jié)果顯示該微衛(wèi)星位點(diǎn)等位基因的大小分別為241 bp,243 bp和247 bp,存在明顯的多態(tài)性。在本試驗(yàn)所研究的四個(gè)地區(qū)中國家養(yǎng)雙峰駝中,243 bp等位基因頻率為79.0%,高于其它兩個(gè)等位基因的頻率,則說明該等位基因在所研究群體中占優(yōu)勢(shì)。該微衛(wèi)星各等位基因在不同的群體間的分布不同。南疆駝、河西駝以及阿拉善雙峰駝群體只檢測到243 bp等位基因,蘇尼特雙峰駝群體共檢測到241 bp、243 bp和247 bp3個(gè)等位基因,等位基因頻率依次為17.4%、52.2%和30.4%,而其它群體檢測到241 bp和243 bp的等位基因。在所采集的新疆地區(qū)駝群中,243 bp等位基因占優(yōu)勢(shì),其等位基因頻率為79.5%,而241 bp等位基因頻率為20.5%。內(nèi)蒙古駝群中,241 bp、243 bp和247 bp等位基因頻率依次為13.3%、63.3%和23.3%。3.中國家養(yǎng)雙峰駝HSFY和SRY基因拷貝數(shù)與父系起源的研究本試驗(yàn)運(yùn)用實(shí)時(shí)熒光定量PCR技術(shù)對(duì)中國家養(yǎng)雙峰駝的HSFY和SRY基因的拷貝數(shù)進(jìn)行研究,結(jié)果顯示HSFY基因拷貝數(shù)范圍為1~3,SRY基因拷貝數(shù)范圍為1~9,均屬于多拷貝基因。4.本試驗(yàn)所篩選的Y染色體特異的引物均可以用于家養(yǎng)雙峰駝的性別鑒定。
【關(guān)鍵詞】：雙峰駝 Y染色體 Y-SNP Y-STR 多拷貝基因
【學(xué)位授予單位】：西北農(nóng)林科技大學(xué)
【學(xué)位級(jí)別】：碩士
【學(xué)位授予年份】：2016
【分類號(hào)】：S824
【目錄】：

• 摘要6-8
• ABSTRACT8-12
• 第一章 文獻(xiàn)綜述12-28
• 1.1 Y染色體結(jié)構(gòu)與功能12-19
• 1.1.1 Y染色體的結(jié)構(gòu)13-15
• 1.1.2 Y染色體的功能15-17
• 1.1.3 不同哺乳動(dòng)物Y染色體特征17-19
• 1.2 Y染色體的起源與進(jìn)化19-23
• 1.2.1 Y染色體起源與進(jìn)化19-20
• 1.2.2 Y染色體進(jìn)化的驅(qū)動(dòng)力20-23
• 1.3 Y染色體分子標(biāo)記以及拷貝數(shù)的研究進(jìn)展23-26
• 1.3.1 Y染色體分子標(biāo)記的研究進(jìn)展23-24
• 1.3.2 Y染色體拷貝數(shù)的研究進(jìn)展24-26
• 1.4 駱駝起源進(jìn)化的研究進(jìn)展26-27
• 1.5 本研究的目的和意義27-28
• 第二章 中國家養(yǎng)雙峰駝Y-SNP的研究28-38
• 2.1 材料與方法28-32
• 2.1.1 試驗(yàn)材料28-29
• 2.1.2 試驗(yàn)方法29-32
• 2.2 結(jié)果與分析32-35
• 2.2.1 基因組DNA的提取與檢測32
• 2.2.2 Y-SNP特異性引物的檢測32-33
• 2.2.3 Y-SNP特異性引物的擴(kuò)增與測序33
• 2.2.4 測序結(jié)果分析33-35
• 2.3 討論35-37
• 2.3.1 中國家養(yǎng)雙峰駝父系起源問題35-37
• 2.3.2 SRY基因多拷貝檢測問題37
• 2.4 小結(jié)37-38
• 第三章 中國家養(yǎng)雙峰駝Y染色體微衛(wèi)星的研究38-49
• 3.1 材料與方法38-42
• 3.1.1 試驗(yàn)材料38
• 3.1.2 試驗(yàn)方法38-42
• 3.2 結(jié)果與分析42-46
• 3.2.1 Y染色體微衛(wèi)星引物的特異性檢測42-43
• 3.2.2 克隆測序結(jié)果43-44
• 3.2.3 熒光標(biāo)記引物測序結(jié)果44-45
• 3.2.4 等位基因大小及其分布頻率45-46
• 3.2.5 聚類分析46
• 3.3 討論46-48
• 3.4 小結(jié)48-49
• 第四章 中國家養(yǎng)雙峰駝HSFY與SRY基因拷貝數(shù)的研究49-59
• 4.1 材料與方法49-51
• 4.1.1 試驗(yàn)材料49-50
• 4.1.2 試驗(yàn)方法50-51
• 4.2 結(jié)果與分析51-56
• 4.2.1 引物特異性的檢測51-52
• 4.2.2 標(biāo)準(zhǔn)曲線52-53
• 4.2.3 待測樣本基因拷貝數(shù)的計(jì)算與分析53-56
• 4.2.4 聚類分析56
• 4.3 討論56-58
• 4.4 小結(jié)58-59
• 第五章 結(jié)論與創(chuàng)新點(diǎn)59-60
• 5.1 結(jié)論59
• 5.2 創(chuàng)新點(diǎn)59-60
• 參考文獻(xiàn)60-69
• 附錄69-71
• 致謝71-72
• 作者簡介72

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中國碩士學(xué)位論文全文數(shù)據(jù)庫 前1條

1 陳慧玲;中國家養(yǎng)雙峰駝Y染色體SNP、STR、CNV與父系起源研究[D];西北農(nóng)林科技大學(xué);2016年

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本文編號(hào)：908701