蒙古馬和純血馬腸道真菌多樣性初步研究及分析
本文關(guān)鍵詞:蒙古馬和純血馬腸道真菌多樣性初步研究及分析
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【摘要】:近年來(lái)賽馬和馬術(shù)表演等已成為世界新興產(chǎn)業(yè),但馬胃腸疾病的發(fā)生嚴(yán)重影響了馬匹性能,而蒙古馬生活在惡劣的蒙古高原上,本身具有卓越的優(yōu)良特性,很少發(fā)生腸道疾病,這可能與腸道微生物的作用密不可分。為了了解馬腸道真菌生物多樣性,本研究以蒙古馬和純血馬腸道真菌微生物為研究對(duì)象,運(yùn)用糞便總DNA提取技術(shù)、PCR-DGGE結(jié)合克隆測(cè)序技術(shù),對(duì)相同飼養(yǎng)條件下的蒙古馬和純血馬、不同飼養(yǎng)條件下的蒙古馬腸道真菌微生物進(jìn)行了生物多樣性的研究和分析,結(jié)果為:1試驗(yàn)采用經(jīng)典試劑盒對(duì)糞便中真菌總DNA進(jìn)行提取,總DNA在質(zhì)量和濃度上均很好;PCR過(guò)程中采用巢式與降式兩種方法結(jié)合的方式,并在PCR體系中加入BSA,增強(qiáng)了目的DNA的特異性。2 DGGE指紋圖譜顯示,每條泳道均含有豐富的條帶數(shù),初步證明蒙古馬和純血馬腸道內(nèi)均含有豐富的真菌微生物。利用Quantity One軟件初步分析得到了DGGE模型分析圖并對(duì)條帶進(jìn)行主成分分析,證明蒙古馬和純血馬腸道真菌存在一定差異,但大部分是相同種屬。UPGMA聚類(lèi)圖分析證明,種內(nèi)相似性大于品種間相似性,純血馬種內(nèi)相似性大于蒙古馬種內(nèi)相似性;不同飼養(yǎng)條件下的蒙古馬相似性低于相同飼養(yǎng)條件下的。通過(guò)對(duì)微生物指數(shù)進(jìn)行t檢驗(yàn)分析,證明蒙古馬和純血馬以及不同飼養(yǎng)條件下的蒙古馬腸道真菌微生物在多樣性、豐富度和均勻度指數(shù)上均無(wú)顯著差異。3蒙古馬和純血馬測(cè)序結(jié)果證明:菌種幾乎分別屬于子囊菌門(mén)、擔(dān)子菌門(mén)和新麗鞭毛菌門(mén),以子囊菌門(mén)含量最多。蒙古馬共檢測(cè)到39個(gè)真菌,比對(duì)后相似度97%以上的占60%,未知真菌占40%;純血馬共檢測(cè)到31個(gè)真菌,相似度97%以上的占54.8%,未知真菌占45.2%;青草放牧蒙古馬共檢測(cè)到31個(gè)真菌,相似度97%以上的占42%,未知真菌占58%;證明馬腸道真菌微生物部分是未知真菌。4蒙古馬和純血馬共有菌屬:胃梨囊霉屬、盲腸菌屬、牛糞盤(pán)菌、細(xì)齒糞盤(pán)菌、庫(kù)德里阿茲威畢赤酵母、黃灰青霉菌和一些外源性真菌;蒙古馬特有菌屬為腸霉屬、群生球根瘤胃真菌、小紅酵母和一些外源性真菌;純血馬特有真菌為糞盤(pán)菌屬和瘤胃真菌。青草放牧條件下特有真菌主要集中在外源性真菌;干草舍飼新檢測(cè)到了鎖擲孢酵母屬、擴(kuò)展青霉菌、瘤胃真菌。
【關(guān)鍵詞】:蒙古馬 純血馬 腸道真菌 多樣性 PCR-DGGE
【學(xué)位授予單位】:內(nèi)蒙古農(nóng)業(yè)大學(xué)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【學(xué)位授予年份】:2016
【分類(lèi)號(hào)】:S821
【目錄】:
- 摘要3-4
- Abstract4-10
- 縮略語(yǔ)表10-11
- 1 引言11-25
- 1.1 馬的介紹11-12
- 1.1.1 蒙古馬介紹11-12
- 1.1.2 蒙古馬的保護(hù)12
- 1.1.3 純血馬介紹12
- 1.2 馬業(yè)的發(fā)展12-14
- 1.2.1 中國(guó)馬業(yè)的發(fā)展12-13
- 1.2.2 世界馬業(yè)發(fā)展現(xiàn)狀13
- 1.2.3 馬業(yè)的重要性及問(wèn)題13-14
- 1.3 腸道微生物介紹14-16
- 1.3.1 真菌的介紹14-15
- 1.3.2 馬屬動(dòng)物腸道微生物的研究15-16
- 1.4 腸道真菌微生物研究方法16-23
- 1.4.1 研究微生物主要技術(shù)方法16-20
- 1.4.2 變性梯度凝膠電泳技術(shù)20-23
- 1.5 選題目的與意義23-24
- 1.6 技術(shù)路線(xiàn)24-25
- 2 試驗(yàn)材料與方法25-33
- 2.1 試驗(yàn)材料25-26
- 2.1.1 采樣25
- 2.1.2 主要實(shí)驗(yàn)儀器與試劑25-26
- 2.2 試驗(yàn)方法26-33
- 2.2.1 樣品總DNA的提取26-27
- 2.2.2 糞便中真菌PCR擴(kuò)增27-29
- 2.2.3 變性梯度凝膠電泳29-30
- 2.2.4 切膠回收30-31
- 2.2.5 酶切鑒定31-33
- 3 試驗(yàn)結(jié)果與討論33-62
- 3.1 蒙古馬與純血馬腸道真菌多樣性比較分析33-49
- 3.1.1 糞便真菌總DNA的提取33
- 3.1.2 真菌PCR擴(kuò)增33-34
- 3.1.3 DGGE電泳34
- 3.1.4 DGGE電泳分析34-38
- 3.1.5 微生物多樣性指數(shù)分析38-40
- 3.1.6 質(zhì)粒的酶切鑒定40
- 3.1.7 序列測(cè)序與比對(duì)分析40-43
- 3.1.8 討論43-49
- 3.2 不同飼養(yǎng)條件下蒙古馬腸道真菌微生物多樣性比較分析49-62
- 3.2.1 糞便總DNA的提取49
- 3.2.2 真菌PCR擴(kuò)增49
- 3.2.3 DGGE電泳49-50
- 3.2.4 DGGE電泳分析50-54
- 3.2.5 微生物多樣性指數(shù)分析54-55
- 3.2.6 質(zhì)粒的酶切鑒定55-56
- 3.2.7 序列測(cè)序與比對(duì)分析56-60
- 3.2.8 討論60-62
- 4 結(jié)論62-63
- 5 展望63-64
- 致謝64-65
- 參考文獻(xiàn)65-75
- 作者簡(jiǎn)介75
【相似文獻(xiàn)】
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,本文編號(hào):896197
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