本文關(guān)鍵詞：長(zhǎng)江下游地區(qū)地方鴨種全基因組序列測(cè)定及遺傳多樣性分析

  更多相關(guān)文章： 鴨 全基因組 重測(cè)序 系統(tǒng)進(jìn)化樹 拷貝數(shù)變異

【摘要】：為全面了解長(zhǎng)江下游地區(qū)兼用型鴨的遺傳多樣性,對(duì)該地區(qū)婁門鴨、昆山麻鴨、巢湖鴨和高郵鴨的血液進(jìn)行了全基因組重測(cè)序分析。4個(gè)樣本平均測(cè)序深度和覆蓋率分別為11.7×和97.19%;通過(guò)與北京鴨基因組進(jìn)行比對(duì),婁門鴨、昆山麻鴨、巢湖鴨和高郵鴨分別檢測(cè)到7 711 254、8 137 855、7 299 539和7 962 102個(gè)SNP,1 145 846、1 239 348、958 379和1 121 697個(gè)Indel以及1 777、1 949、1 556和1 088個(gè)CNV,這些變異大部分分布在基因間或者是基因內(nèi)的內(nèi)含子區(qū);通過(guò)群體系統(tǒng)進(jìn)化樹分析和CNV交集分析發(fā)現(xiàn)婁門鴨和昆山麻鴨為一類,巢湖鴨和高郵鴨為一類。測(cè)序分析結(jié)果真實(shí)反映了各鴨種在遺傳上的差異,與其地理分布基本一致。
【作者單位】： 江蘇省家禽科學(xué)研究所;昆山麻鴨原種場(chǎng);昆山市畜牧獸醫(yī)站;
【關(guān)鍵詞】： 鴨 全基因組 重測(cè)序 系統(tǒng)進(jìn)化樹 拷貝數(shù)變異
【基金】：江蘇省農(nóng)業(yè)三新工程項(xiàng)目(Sxgc(2016)096) 江蘇省農(nóng)業(yè)科技自主創(chuàng)新項(xiàng)目(CX(15)1010-03)
【分類號(hào)】：S834.2
【正文快照】： 當(dāng)前,全球畜禽遺傳資源的多樣性正日益減少,而我國(guó)地方種資源的保種狀況也不容樂(lè)觀[1]。地方鴨種質(zhì)資源是鴨育種和生產(chǎn)的物質(zhì)基礎(chǔ),開展地方鴨品種資源評(píng)價(jià)和種質(zhì)特性研究等工作,不但保護(hù)了品種的遺傳多樣性,還可以保證鴨育種工作能對(duì)環(huán)境、疾病和市場(chǎng)需求的變化作出及時(shí)和有效

【相似文獻(xiàn)】

中國(guó)期刊全文數(shù)據(jù)庫(kù) 前10條

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本文編號(hào)：872249