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我國部分地區(qū)PRRS分子流行病學及病毒遺傳變異研究

發(fā)布時間:2017-09-16 15:06

  本文關鍵詞:我國部分地區(qū)PRRS分子流行病學及病毒遺傳變異研究


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【摘要】:豬繁殖與呼吸綜合征(porcine reproductive and respiratory syndrome,PRRS)是一種廣泛流行且嚴重影響?zhàn)B豬業(yè)健康發(fā)展的豬的繁殖與呼吸障礙性傳染病。豬繁殖與呼吸綜合征病毒(PRRS virus,PRRSV)是單股、正鏈RNA病毒。在自然界和免疫壓力下,PRRSV不斷變異,不斷出現(xiàn)新的病毒株,給PRRS的防治帶來了巨大的挑戰(zhàn)和嚴峻的考驗。為了解2013~2014年我國PRRS分子流行病學及病毒遺傳變異情況,本研究對我國部分地區(qū)(以東北地區(qū)為主)401份樣品進行了RT-PCR檢測,并對51份陽性樣品的GP5和部分NSP2基因進行了遺傳進化及序列比對分析。結果表明:所檢測的樣品中PRRSV陽性率為20.2%,GP5和NSP2遺傳進化分析表明51個病毒株均為北美洲型毒株,且以HP-PRRSV為主,經(jīng)典株與變異株共存。其中JL580毒株的GP5和NSP2不同于國內(nèi)的經(jīng)典和高致病性毒株,與美國NADC30毒株屬于同一個新的亞群。GP5氨基酸序列分析表明,大多數(shù)毒株在氨基酸高變區(qū)、中和抗原表位和誘導表位發(fā)生了一定的變異。NSP2部分氨基酸序列分析表明,與CH-1a相比大多數(shù)PRRS病毒株的NSP2在基因高變區(qū)缺失30個氨基酸,1株缺失34個氨基酸,1株缺失20個氨基酸。GP5和NSP2遺傳進化及氨基酸序列分析結果表明我國PRRSV表現(xiàn)為更為復雜的遺傳多樣性。鑒于JL580株的特殊性,本研究對該病毒進行了全基因組序列的測定與分析。結果表明:JL580株是一個自然重組毒株,由美國NADC30毒株與國內(nèi)高致病性毒株重組而成,且不同于中國現(xiàn)流行的其它毒株,屬于一個新的亞群。同源性分析表明,JL580與中國經(jīng)典毒株CH-1a的核苷酸同源性是84.9%,與HP-PRRSV代表株JXA1、HuN4、TJ的核苷酸同源性分別是84.8%、84.9%、85%。對基因組的進一步分析表明,JL580病毒株GP5蛋白與CH-1a、VR-2332、HuN4相比,信號肽和跨膜區(qū)的氨基酸發(fā)生了顯著變異,且NSP2存在3處共131個氨基酸的缺失,與HP-PRRSV的30個氨基酸的缺失有明顯的不同。仔豬致病性分析表明JL580毒株對仔豬具有較高的致病性。我們的研究表明NADC30類毒株已經(jīng)在我國部分省份出現(xiàn),這給當前的預防和治療措施帶來了一定的難度。因此我們有必要更新監(jiān)測數(shù)據(jù)和疫苗策略,以防止疾病的繼續(xù)蔓延。本研究將為PRRS流行病學調(diào)查研究提供必要的實驗數(shù)據(jù),為制定切實有效的預防和治療措施提供科學依據(jù)。
【關鍵詞】:豬繁殖與呼吸綜合征 分子流行病學 JL580 基因重組
【學位授予單位】:吉林農(nóng)業(yè)大學
【學位級別】:碩士
【學位授予年份】:2016
【分類號】:S852.65
【目錄】:
  • 摘要3-4
  • Abstract4-8
  • 前言8-9
  • 第一篇 文獻綜述9-16
  • 第一章 豬繁殖與呼吸綜合征概述9-16
  • 1.1 病原及病毒特性9-10
  • 1.2 基因組結構特征10
  • 1.3 主要的結構蛋白和非結構蛋白10-12
  • 1.4 生態(tài)學特征12
  • 1.5 PRRSV致病機理12-13
  • 1.6 臨床癥狀及病理組織變化13
  • 1.7 PRRSV遺傳變異13-14
  • 1.8 PRRSV疫苗研發(fā)的科學制約14-15
  • 1.9 預防和治療15-16
  • 第二篇 研究內(nèi)容16-46
  • 第一章 我國部分地區(qū)PRRS流行病學16-31
  • 1.1 材料和方法16-21
  • 1.2 結果21-29
  • 1.3 討論29-30
  • 1.4 小結30-31
  • 第二章 特異性毒株JL580的分離鑒定、遺傳變異及致病性分析31-46
  • 2.1 材料和方法31-35
  • 2.2 結果35-44
  • 2.3 討論44
  • 2.4 小結44-46
  • 結論46-47
  • 參考文獻47-53
  • 附錄53-54
  • 作者簡介54-55
  • 致謝55

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