我國部分地區(qū)PRRS分子流行病學及病毒遺傳變異研究
本文關鍵詞:我國部分地區(qū)PRRS分子流行病學及病毒遺傳變異研究
更多相關文章: 豬繁殖與呼吸綜合征 分子流行病學 JL580 基因重組
【摘要】:豬繁殖與呼吸綜合征(porcine reproductive and respiratory syndrome,PRRS)是一種廣泛流行且嚴重影響?zhàn)B豬業(yè)健康發(fā)展的豬的繁殖與呼吸障礙性傳染病。豬繁殖與呼吸綜合征病毒(PRRS virus,PRRSV)是單股、正鏈RNA病毒。在自然界和免疫壓力下,PRRSV不斷變異,不斷出現(xiàn)新的病毒株,給PRRS的防治帶來了巨大的挑戰(zhàn)和嚴峻的考驗。為了解2013~2014年我國PRRS分子流行病學及病毒遺傳變異情況,本研究對我國部分地區(qū)(以東北地區(qū)為主)401份樣品進行了RT-PCR檢測,并對51份陽性樣品的GP5和部分NSP2基因進行了遺傳進化及序列比對分析。結果表明:所檢測的樣品中PRRSV陽性率為20.2%,GP5和NSP2遺傳進化分析表明51個病毒株均為北美洲型毒株,且以HP-PRRSV為主,經(jīng)典株與變異株共存。其中JL580毒株的GP5和NSP2不同于國內(nèi)的經(jīng)典和高致病性毒株,與美國NADC30毒株屬于同一個新的亞群。GP5氨基酸序列分析表明,大多數(shù)毒株在氨基酸高變區(qū)、中和抗原表位和誘導表位發(fā)生了一定的變異。NSP2部分氨基酸序列分析表明,與CH-1a相比大多數(shù)PRRS病毒株的NSP2在基因高變區(qū)缺失30個氨基酸,1株缺失34個氨基酸,1株缺失20個氨基酸。GP5和NSP2遺傳進化及氨基酸序列分析結果表明我國PRRSV表現(xiàn)為更為復雜的遺傳多樣性。鑒于JL580株的特殊性,本研究對該病毒進行了全基因組序列的測定與分析。結果表明:JL580株是一個自然重組毒株,由美國NADC30毒株與國內(nèi)高致病性毒株重組而成,且不同于中國現(xiàn)流行的其它毒株,屬于一個新的亞群。同源性分析表明,JL580與中國經(jīng)典毒株CH-1a的核苷酸同源性是84.9%,與HP-PRRSV代表株JXA1、HuN4、TJ的核苷酸同源性分別是84.8%、84.9%、85%。對基因組的進一步分析表明,JL580病毒株GP5蛋白與CH-1a、VR-2332、HuN4相比,信號肽和跨膜區(qū)的氨基酸發(fā)生了顯著變異,且NSP2存在3處共131個氨基酸的缺失,與HP-PRRSV的30個氨基酸的缺失有明顯的不同。仔豬致病性分析表明JL580毒株對仔豬具有較高的致病性。我們的研究表明NADC30類毒株已經(jīng)在我國部分省份出現(xiàn),這給當前的預防和治療措施帶來了一定的難度。因此我們有必要更新監(jiān)測數(shù)據(jù)和疫苗策略,以防止疾病的繼續(xù)蔓延。本研究將為PRRS流行病學調(diào)查研究提供必要的實驗數(shù)據(jù),為制定切實有效的預防和治療措施提供科學依據(jù)。
【關鍵詞】:豬繁殖與呼吸綜合征 分子流行病學 JL580 基因重組
【學位授予單位】:吉林農(nóng)業(yè)大學
【學位級別】:碩士
【學位授予年份】:2016
【分類號】:S852.65
【目錄】:
- 摘要3-4
- Abstract4-8
- 前言8-9
- 第一篇 文獻綜述9-16
- 第一章 豬繁殖與呼吸綜合征概述9-16
- 1.1 病原及病毒特性9-10
- 1.2 基因組結構特征10
- 1.3 主要的結構蛋白和非結構蛋白10-12
- 1.4 生態(tài)學特征12
- 1.5 PRRSV致病機理12-13
- 1.6 臨床癥狀及病理組織變化13
- 1.7 PRRSV遺傳變異13-14
- 1.8 PRRSV疫苗研發(fā)的科學制約14-15
- 1.9 預防和治療15-16
- 第二篇 研究內(nèi)容16-46
- 第一章 我國部分地區(qū)PRRS流行病學16-31
- 1.1 材料和方法16-21
- 1.2 結果21-29
- 1.3 討論29-30
- 1.4 小結30-31
- 第二章 特異性毒株JL580的分離鑒定、遺傳變異及致病性分析31-46
- 2.1 材料和方法31-35
- 2.2 結果35-44
- 2.3 討論44
- 2.4 小結44-46
- 結論46-47
- 參考文獻47-53
- 附錄53-54
- 作者簡介54-55
- 致謝55
【相似文獻】
中國期刊全文數(shù)據(jù)庫 前10條
1 程紹堯;分子流行病學概述[J];解放軍預防醫(yī)學雜志;1990年01期
2 黃勇;邱華士;;分子流行病學在沙門氏菌研究中的應用[J];國外醫(yī)學(流行病學傳染病學分冊);1991年01期
3 俞乃勝;動物分子流行病學的研究及其應用概況[J];云南大學學報(自然科學版);1999年03期
4 李艷;劉長庭;王德龍;康春燕;張智健;;嗜麥芽窄食單胞菌耐藥現(xiàn)狀及分子流行病學特征[J];中國感染與化療雜志;2007年06期
5 盧仙娥;;分子流行病學研究的概況與前景[J];預防醫(yī)學情報雜志;1993年S1期
6 張杰;丁崢嶸;田炳均;趙智嫻;湯晶晶;;云南省人類?刹《19型的分子流行病學分析[J];中國病毒病雜志;2014年02期
7 鄧巍;鮑琳琳;Nicole Vidal;符鵬;何啟亞;方華;秦川;盧葳;;海南省及云南西雙版納州HIV-1的分子流行病學比較研究[J];中國比較醫(yī)學雜志;2009年06期
8 董曉楠;應劍;陳應華;;1970~2004年全球腸道病毒71型分離株的分子流行病學分析[J];科學通報;2007年09期
9 高大威,馬佳毓,郭曉奎,高景倫;一種細菌分子流行病學及系統(tǒng)發(fā)生學研究的新方法—隨機引物PCR[J];哈爾濱醫(yī)科大學學報;1997年05期
10 檀曉娟;許文波;;腸道病毒71型的分子流行病學現(xiàn)況[J];中國疫苗和免疫;2008年04期
中國重要會議論文全文數(shù)據(jù)庫 前10條
1 李衛(wèi)民;王u&民;端木宏謹;劉宇紅;李傳友;姜廣路;丁北川;;2000年中國結核病流行病學抽樣調(diào)查菌株分子流行病學特征[A];中國防癆雜志2003第25卷增刊——2003年中國防癆協(xié)會全國學術會議論文集[C];2003年
2 張?zhí)烀?;結核病分子流行病學的概況和進展[A];中華醫(yī)學會第六屆全國結核病學術大會論文匯編[C];2000年
3 劉丁;;醫(yī)院感染分子流行病學的分析方法[A];中國醫(yī)院協(xié)會第十六屆全國醫(yī)院感染管理學術年會資料匯編[C];2009年
4 吳霞;嚴秀峰;王愛敏;何磊燕;王傳清;糜祖煌;俞蕙;;兒童耐甲氧西林金黃色葡萄球菌感染臨床及分子流行病學特征研究[A];中華醫(yī)學會第十七次全國兒科學術大會論文匯編(上冊)[C];2012年
5 吳霞;嚴秀峰;俞蕙;王愛敏;何磊燕;王傳清;糜祖煌;;兒童耐甲氧西林金黃色葡萄球菌感染臨床及分子流行病學特征研究[A];2012年江浙滬兒科學術年會暨浙江省醫(yī)學會兒科學分會學術年會、兒內(nèi)科疾病診治新進展國家級學習班論文匯編[C];2012年
6 屈勇剛;金寧一;程安春;金擴世;朱光澤;孫中鋒;夏咸柱;;動物戊型肝炎病毒血清流行病學及分子流行病學初步研究[A];中國畜牧獸醫(yī)學會動物傳染病學分會第十二次學術研討會論文集[C];2007年
7 季劍蘋;陸敏;張泓;;兒童耐甲氧西林的金黃色葡萄球菌的分子流行病學及耐藥性分析[A];中華醫(yī)學會第十七次全國兒科學術大會論文匯編(下冊)[C];2012年
8 季劍蘋;陸敏;張泓;;兒童耐甲氧西林的金黃色葡萄球菌的分子流行病學及耐藥性分析[A];2012年江浙滬兒科學術年會暨浙江省醫(yī)學會兒科學分會學術年會、兒內(nèi)科疾病診治新進展國家級學習班論文匯編[C];2012年
9 呂雪蓮;M.J.NAJAFZADEH;冉玉平;沈永年;C.KLAASSEN;李春陽;李若瑜;席麗艷;郝飛;章強強;呂桂霞;胡志敏;占城;宋順鵬;劉維達;J.F.G.M.MEIS;S.de HOOG;;不規(guī)則毛霉(多變根毛霉)生物學與分子流行病學特征分析[A];中國菌物學會第五屆會員代表大會暨2011年學術年會論文摘要集[C];2011年
10 瞿佳;;Leber病的基礎和臨床研究[A];中華醫(yī)學會第十二屆全國眼科學術大會論文匯編[C];2007年
中國重要報紙全文數(shù)據(jù)庫 前2條
1 記者 高加平邋通訊員 盧大成;泰州建設中國人“健康數(shù)據(jù)庫”[N];泰州日報;2007年
2 記者 朱敏麗 實習生 朱艷萍;泰州建成10萬人份“健康數(shù)據(jù)庫”[N];泰州日報;2009年
中國博士學位論文全文數(shù)據(jù)庫 前2條
1 蘇擘;華中地區(qū)I型人類免疫缺陷病毒(HIV-1)分子流行病學及耐藥基因型的研究[D];武漢大學;2005年
2 楊東靖;天津地區(qū)漢坦病毒的分子流行病學分析及其GP多表位抗原基因的構建與表達的研究[D];天津醫(yī)科大學;2009年
中國碩士學位論文全文數(shù)據(jù)庫 前9條
1 李穎婷;2009~2014年福建省甲型H1N1流感病毒分子流行病學特征研究[D];福建醫(yī)科大學;2015年
2 常曉博;我國部分地區(qū)PRRS分子流行病學及病毒遺傳變異研究[D];吉林農(nóng)業(yè)大學;2016年
3 林冬玲;耐亞胺培南銅綠假單胞菌耐藥表型、基因型和分子流行病學的研究[D];廣州中醫(yī)藥大學;2011年
4 舒敏;住院小兒金黃色葡萄球菌感染的臨床特征和分子流行病學分析[D];四川大學;2007年
5 張樹敬;青霉素耐藥肺炎鏈球菌的分子流行病學與適應性研究[D];復旦大學;2012年
6 王顏歌;2009年深圳地區(qū)杯狀病毒感染的分子流行病學特征[D];南方醫(yī)科大學;2011年
7 熊祝嘉;我國多中心耐甲氧西林金黃色葡萄球菌(MRSA)的分子流行病學及耐藥性研究[D];北京協(xié)和醫(yī)學院;2012年
8 金東;我國部分地區(qū)志賀和小腸結腸炎耶爾森菌分離株的分子流行病學分析[D];大連醫(yī)科大學;2005年
9 梁明輝;河南省嚙齒類動物流行性出血熱病毒的分子流行病學研究[D];山東大學;2005年
,本文編號:863761
本文鏈接:http://sikaile.net/yixuelunwen/dongwuyixue/863761.html