我國部分地區(qū)PRRS分子流行病學(xué)及病毒遺傳變異研究
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更多相關(guān)文章: 豬繁殖與呼吸綜合征 分子流行病學(xué) JL580 基因重組
【摘要】:豬繁殖與呼吸綜合征(porcine reproductive and respiratory syndrome,PRRS)是一種廣泛流行且嚴(yán)重影響?zhàn)B豬業(yè)健康發(fā)展的豬的繁殖與呼吸障礙性傳染病。豬繁殖與呼吸綜合征病毒(PRRS virus,PRRSV)是單股、正鏈RNA病毒。在自然界和免疫壓力下,PRRSV不斷變異,不斷出現(xiàn)新的病毒株,給PRRS的防治帶來了巨大的挑戰(zhàn)和嚴(yán)峻的考驗(yàn)。為了解2013~2014年我國PRRS分子流行病學(xué)及病毒遺傳變異情況,本研究對(duì)我國部分地區(qū)(以東北地區(qū)為主)401份樣品進(jìn)行了RT-PCR檢測(cè),并對(duì)51份陽性樣品的GP5和部分NSP2基因進(jìn)行了遺傳進(jìn)化及序列比對(duì)分析。結(jié)果表明:所檢測(cè)的樣品中PRRSV陽性率為20.2%,GP5和NSP2遺傳進(jìn)化分析表明51個(gè)病毒株均為北美洲型毒株,且以HP-PRRSV為主,經(jīng)典株與變異株共存。其中JL580毒株的GP5和NSP2不同于國內(nèi)的經(jīng)典和高致病性毒株,與美國NADC30毒株屬于同一個(gè)新的亞群。GP5氨基酸序列分析表明,大多數(shù)毒株在氨基酸高變區(qū)、中和抗原表位和誘導(dǎo)表位發(fā)生了一定的變異。NSP2部分氨基酸序列分析表明,與CH-1a相比大多數(shù)PRRS病毒株的NSP2在基因高變區(qū)缺失30個(gè)氨基酸,1株缺失34個(gè)氨基酸,1株缺失20個(gè)氨基酸。GP5和NSP2遺傳進(jìn)化及氨基酸序列分析結(jié)果表明我國PRRSV表現(xiàn)為更為復(fù)雜的遺傳多樣性。鑒于JL580株的特殊性,本研究對(duì)該病毒進(jìn)行了全基因組序列的測(cè)定與分析。結(jié)果表明:JL580株是一個(gè)自然重組毒株,由美國NADC30毒株與國內(nèi)高致病性毒株重組而成,且不同于中國現(xiàn)流行的其它毒株,屬于一個(gè)新的亞群。同源性分析表明,JL580與中國經(jīng)典毒株CH-1a的核苷酸同源性是84.9%,與HP-PRRSV代表株JXA1、HuN4、TJ的核苷酸同源性分別是84.8%、84.9%、85%。對(duì)基因組的進(jìn)一步分析表明,JL580病毒株GP5蛋白與CH-1a、VR-2332、HuN4相比,信號(hào)肽和跨膜區(qū)的氨基酸發(fā)生了顯著變異,且NSP2存在3處共131個(gè)氨基酸的缺失,與HP-PRRSV的30個(gè)氨基酸的缺失有明顯的不同。仔豬致病性分析表明JL580毒株對(duì)仔豬具有較高的致病性。我們的研究表明NADC30類毒株已經(jīng)在我國部分省份出現(xiàn),這給當(dāng)前的預(yù)防和治療措施帶來了一定的難度。因此我們有必要更新監(jiān)測(cè)數(shù)據(jù)和疫苗策略,以防止疾病的繼續(xù)蔓延。本研究將為PRRS流行病學(xué)調(diào)查研究提供必要的實(shí)驗(yàn)數(shù)據(jù),為制定切實(shí)有效的預(yù)防和治療措施提供科學(xué)依據(jù)。
【關(guān)鍵詞】:豬繁殖與呼吸綜合征 分子流行病學(xué) JL580 基因重組
【學(xué)位授予單位】:吉林農(nóng)業(yè)大學(xué)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【學(xué)位授予年份】:2016
【分類號(hào)】:S852.65
【目錄】:
- 摘要3-4
- Abstract4-8
- 前言8-9
- 第一篇 文獻(xiàn)綜述9-16
- 第一章 豬繁殖與呼吸綜合征概述9-16
- 1.1 病原及病毒特性9-10
- 1.2 基因組結(jié)構(gòu)特征10
- 1.3 主要的結(jié)構(gòu)蛋白和非結(jié)構(gòu)蛋白10-12
- 1.4 生態(tài)學(xué)特征12
- 1.5 PRRSV致病機(jī)理12-13
- 1.6 臨床癥狀及病理組織變化13
- 1.7 PRRSV遺傳變異13-14
- 1.8 PRRSV疫苗研發(fā)的科學(xué)制約14-15
- 1.9 預(yù)防和治療15-16
- 第二篇 研究?jī)?nèi)容16-46
- 第一章 我國部分地區(qū)PRRS流行病學(xué)16-31
- 1.1 材料和方法16-21
- 1.2 結(jié)果21-29
- 1.3 討論29-30
- 1.4 小結(jié)30-31
- 第二章 特異性毒株JL580的分離鑒定、遺傳變異及致病性分析31-46
- 2.1 材料和方法31-35
- 2.2 結(jié)果35-44
- 2.3 討論44
- 2.4 小結(jié)44-46
- 結(jié)論46-47
- 參考文獻(xiàn)47-53
- 附錄53-54
- 作者簡(jiǎn)介54-55
- 致謝55
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