本文關(guān)鍵詞：2014-2015年黑龍江三個地區(qū)犬博卡病毒的PCR檢測及遺傳變異分析

  更多相關(guān)文章： 犬博卡病毒 遺傳多樣性 混合感染

【摘要】：犬博卡病毒(Canine bocavirus,CBoV)與犬腸炎密切相關(guān),為了探索CBoV在黑龍江地區(qū)的流行情況及遺傳演化,于2014年5月份至2015年4月份,在黑龍江哈爾濱、大慶、牡丹江三個地區(qū)采集201份具有腹瀉癥狀的犬糞便拭子,利用PCR擴(kuò)增CBoV NS1基因片段(440 bp),進(jìn)一步對CBoV陽性樣品的VP2基因進(jìn)行擴(kuò)增,測序后進(jìn)行進(jìn)化樹分析,從而對黑龍江地區(qū)CBoV病毒株的進(jìn)化性進(jìn)行分析。同時(shí),利用PCR方法對CBoV陽性病料中犬細(xì)小病毒(CPV-2)、犬冠狀病毒(CCoV)、犬嵴病毒(CaKV)進(jìn)行檢測。PCR檢測結(jié)果顯示,在201份樣品中,15份樣品為CBoV陽性(7.5%,15/201)。序列分析結(jié)果顯示,15株CBoV的NS1片段在核苷酸水平的同源性為83.1%~100%,推導(dǎo)的氨基酸水平的同源性為75.8%~100%;5株CBoV VP2基因在核苷酸水平的同源性為82.9%~96.8%,推導(dǎo)的氨基酸水平的同源性為90.4%~99.1%。NS1基因的進(jìn)化樹分析顯示,與韓國、美國、德國和中國香港的CBoV-2毒株相比,15個中國CBoV病毒株被分在CBoV-2毒株的不同亞群中;VP2基因的進(jìn)化樹分析表明,5個中國CBoV病毒株被分成三個不同的CBoV-2型種群,即CBoV-2HK群、CBoV-2C群和CBoV-2B群。對VP2基因重組分析顯示,本研究選擇的5個病毒株發(fā)生潛在的三個重組事件。在15個CBoV陽性樣品中,CBoV與CPV-2、CCoV和Ca KV的混合感染率高達(dá)20%~40%。上述結(jié)果表明,CBoV在中國黑龍江三個地區(qū)犬腹瀉樣品中陽性率為7.5%,并且CBoV毒株表現(xiàn)出遺傳多樣性、可能的重組事件和混合感染情況。
【關(guān)鍵詞】：犬博卡病毒 遺傳多樣性 混合感染
【學(xué)位授予單位】：黑龍江八一農(nóng)墾大學(xué)
【學(xué)位級別】：碩士
【學(xué)位授予年份】：2016
【分類號】：S852.65
【目錄】：

• 摘要3-4
• Abstract4-7
• 第一章 文獻(xiàn)綜述7-17
• 1.1 博卡病毒概述7-10
• 1.1.1 人博卡病毒的發(fā)現(xiàn)8
• 1.1.2 豬博卡病毒的發(fā)現(xiàn)8-9
• 1.1.3 犬博卡病毒的發(fā)現(xiàn)9-10
• 1.2 博卡病毒病的病原學(xué)10-12
• 1.2.1 博卡病毒分類10-11
• 1.2.2 博卡病毒病毒粒子結(jié)構(gòu)11
• 1.2.3 博卡病毒基因組結(jié)構(gòu)11-12
• 1.3 博卡病毒的診斷方法12-13
• 1.4 博卡病毒的致病性13-14
• 1.5 博卡病毒病的臨床癥狀14-15
• 1.6 犬博卡病毒病的流行病學(xué)15
• 1.7 研究的目的與意義15-17
• 第二章 犬博卡病毒的PCR檢測及遺傳變異分析17-33
• 2.1 試驗(yàn)材料17-18
• 2.1.1 主要生化試劑17
• 2.1.2 主要培養(yǎng)基及試劑配制17-18
• 2.1.3 儀器設(shè)備18
• 2.2 方法18-23
• 2.2.1 樣品采集18
• 2.2.2 NS1基因擴(kuò)增與測序18-21
• 2.2.3 其他犬腸道病原體的檢測21
• 2.2.4 VP2基因的擴(kuò)增與測序21-23
• 2.2.5 重組分析23
• 2.3 結(jié)果23-33
• 2.3.1 CBoV的NS1基因PCR擴(kuò)增23-25
• 2.3.2 CBoV的NS1基因陽性測序結(jié)果25-26
• 2.3.3 CBoV的NS1基因分子進(jìn)化樹分析26-27
• 2.3.4 與其他犬腸道病原體的混合感染檢測27-29
• 2.3.5 CBoV的VP2基因PCR擴(kuò)增29-30
• 2.3.6 CBoV的VP2基因菌落PCR30
• 2.3.7 CBoV的VP2基因分子進(jìn)化樹分析30-31
• 2.3.8 CBoV的VP2基因重組分析31-33
• 第三章 討論33-35
• 第四章 結(jié)論35-37
• 參考文獻(xiàn)37-45
• 致謝45-47
• 作者簡歷47

【參考文獻(xiàn)】

中國期刊全文數(shù)據(jù)庫 前10條

1 盧艷;李丹地;金玉;段招軍;;博卡病毒的檢測方法概述[J];病毒學(xué)報(bào);2014年03期

2 毛世香;劉波;毛曉琴;;豬博卡病毒病的防治淺談[J];畜禽業(yè);2014年03期

3 蔡雨函;朱玲;周遠(yuǎn)成;楊文宇;徐志文;;豬博卡病毒雙重PCR檢測方法的建立及其應(yīng)用[J];中國獸醫(yī)科學(xué);2013年08期

4 李建寧;姚青;孫玉寧;;博卡病毒屬基因組特征與致病的分子機(jī)制[J];微生物學(xué)報(bào);2013年05期

5 熊永忠;郭太杰;;豬博卡病毒[J];黑龍江畜牧獸醫(yī);2012年22期

6 郝飛;湯德元;李春燕;羅險(xiǎn)峰;張華;馬萍;曾智勇;洪尼寧;劉霞;;豬博卡病毒流行病學(xué)研究[J];畜牧獸醫(yī)學(xué)報(bào);2012年10期

7 楊晚竹;黃燦平;段招軍;;豬博卡病毒環(huán)狀附加體的發(fā)現(xiàn)與鑒定[J];病毒學(xué)報(bào);2012年04期

8 林峰;滕靈方;鄭美云;鄭昌華;吳鋒;李樺;鄭敏巧;曾愛平;黃恩佩;莫一涵;侯建毅;;利用人支氣管上皮細(xì)胞系分離和培養(yǎng)人博卡病毒[J];中華實(shí)驗(yàn)和臨床病毒學(xué)雜志;2009年06期

9 伍嚴(yán)安;曾秀雅;周建林;付希;陳發(fā)林;陳發(fā)文;;急性呼吸道感染患兒人類博卡病毒檢測與分析[J];福建醫(yī)科大學(xué)學(xué)報(bào);2009年02期

10 何慧;劉新;;新發(fā)現(xiàn)的呼吸道感染病原——人博卡病毒[J];醫(yī)學(xué)綜述;2008年21期

中國博士學(xué)位論文全文數(shù)據(jù)庫 前1條

1 王雅英;北京地區(qū)人博卡病毒流行率調(diào)查及表位研究[D];北京協(xié)和醫(yī)學(xué)院;2011年

中國碩士學(xué)位論文全文數(shù)據(jù)庫 前3條

1 張宏彪;豬博卡病毒在我國部分地區(qū)的分子流行病學(xué)調(diào)查及其熒光定量PCR方法的建立與應(yīng)用[D];南京農(nóng)業(yè)大學(xué);2012年

2 韓虎;人博卡病毒結(jié)構(gòu)蛋白與非結(jié)構(gòu)蛋白功能的初步研究[D];華中師范大學(xué);2012年

3 張菲;多重實(shí)時(shí)熒光定量PCR檢測人博卡病毒的價(jià)值[D];南華大學(xué);2012年

，

本文編號：833739