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2014-2015年黑龍江三個地區(qū)犬細小病毒2型的PCR檢測及其VP2基因序列分析

發(fā)布時間:2017-09-08 22:28

  本文關鍵詞:2014-2015年黑龍江三個地區(qū)犬細小病毒2型的PCR檢測及其VP2基因序列分析


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【摘要】:犬細小病毒(Canine parvovirus,CPV)是引起犬腹瀉的主要病原,它屬于細小病毒科,細小病毒屬成員,是一類無囊膜、單股DNA病毒。犬細小病毒病在1978年成為全球性疾病,并在世界各地呈地方性流行。犬細小病毒病為一種烈性傳染病,其發(fā)病率和死亡率均很高,是目前影響我國寵物犬、觀賞犬、軍犬、警犬等健康的主要傳染病之一,給人們帶來了嚴重經(jīng)濟損失。為了分析黑龍江三個地區(qū)CPV-2流行毒株遺傳演化的規(guī)律及流行現(xiàn)狀,本研究以VP2(568 bp)為目的基因,對2014年5月份至2015年4月份黑龍江三個地區(qū)有腹瀉癥狀的201份犬糞便拭子樣品進行PCR檢測。研究結果表明,201份犬糞便拭子樣品中有95份樣品呈CPV-2陽性,其陽性率為47.26%,且VP2基因的核苷酸和氨基酸的同源性分別為98.8%~100%和97.6%~100%;在這95份CPV-2陽性樣品中,新CPV-2a型(Ser297Ala)、新CPV-2b型(Ser297Ala)和CPV-2c型的陽性率分別為64.21%、21.05%和14.74%;各類型陽性率的不同主要體現(xiàn)在地域、季節(jié)和年齡之間的差異上;其中CPV-2陽性樣品中接受過免疫的犬占48.42%;此外也發(fā)現(xiàn)了犬冠狀病毒(CCoV)、犬嵴病毒(CaKV)和犬博卡病毒(CBoV)三種病毒混合感染的陽性樣品。進化樹分析結果顯示,新CPV-2a型、新CPV-2b型和CPV-2c型毒株與中國CPV-2毒株關系密切;新CPV-2a型毒株具有較高的變異性,形成三個亞群。95份CPV-2陽性樣品中,Tyr324Ile和Thr440Ala的氨基酸替換率分別為100%和64.21%;所有的新CPV-2b型毒株皆在440位發(fā)生氨基酸(Thr→Ala)替換,且在CPV-2c型毒株中首次發(fā)現(xiàn)370位氨基酸(Gln→Arg)替換的特點。通過本次流行病學調查得出,新CPV-2a型、新CPV-2b型和CPV-2c型在黑龍江三個地區(qū)呈混合流行性,其中以新CPV-2a型和新CPV-2b型為主。
【關鍵詞】:CPV-2 VP2基因 PCR 序列分析 流行病學
【學位授予單位】:黑龍江八一農墾大學
【學位級別】:碩士
【學位授予年份】:2016
【分類號】:S852.65
【目錄】:
  • 摘要3-4
  • Abstract4-7
  • 符號說明7-8
  • 第一章 文獻綜述8-18
  • 1.1 犬細小病毒病原生物學8-11
  • 1.1.1 CPV的形態(tài)及理化特性8
  • 1.1.2 CPV的基因組結構及編碼蛋白8-10
  • 1.1.3 VP2各亞型間氨基酸序列差異10-11
  • 1.2 犬細小病毒的流行病學11-12
  • 1.2.1 CPV的起源與進化11
  • 1.2.2 CPV在我國流行現(xiàn)狀11-12
  • 1.2.3 CPV的感染宿主范圍12
  • 1.3 犬細小病毒致病機理及臨床癥狀12-13
  • 1.3.1 CPV的致病機理12
  • 1.3.2 CPV的臨床癥狀12-13
  • 1.4 犬細小病毒的診斷技術13-15
  • 1.4.1 臨床診斷13
  • 1.4.2 實驗室診斷13-15
  • 1.5 犬細小病毒的防治15
  • 1.6 本研究的目的與意義15-18
  • 第二章 犬細小病毒2型的PCR檢測及其VP2基因序列分析18-32
  • 2.1 試驗材料18
  • 2.1.1 主要試劑18
  • 2.1.2 儀器設備18
  • 2.2 方法18-22
  • 2.2.1 樣品采集18-19
  • 2.2.2 VP2基因擴增與測序19-22
  • 2.2.3 進化樹構建22
  • 2.2.4 其他犬腸道病毒的檢測22
  • 2.3 結果22-32
  • 2.3.1 VP2基因PCR擴增22-23
  • 2.3.2 CPV-2 的VP2基因純化23
  • 2.3.3 CPV-2 的陽性測序結果23-28
  • 2.3.4 分子進化樹分析28-32
  • 第三章 討論32-36
  • 第四章 結論36-38
  • 參考文獻38-48
  • 致謝48-50
  • 附錄50-52
  • 個人簡歷52

【參考文獻】

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本文編號:816686

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