本文關(guān)鍵詞：FLW牛CPT2、ABHD5、ACSL1基因單核苷酸多態(tài)性與生產(chǎn)性狀的關(guān)聯(lián)分析

  更多相關(guān)文章： CPT2 ABHD5 ACSL1 SNP 表達量 關(guān)聯(lián)分析

【摘要】：FLW牛是我國大連雪龍集團成功培育的三元雜交牛(Fuzhou yellow cattle×Limousinex Wagyu),屬于中型肉牛品種,具有較高的生長性能和較好的肉品質(zhì)性狀。本試驗以65頭大連雪龍黑牛為研究對象,采用PCR-RFLP分子標(biāo)記方法結(jié)合DNA測序?qū)PT2、ABHD5和ACSL1基因的多態(tài)性進行分析,目的在于探索CPT2、ABHD5和ACSL1基因?qū)θ馀Ｉa(chǎn)、肉質(zhì)性狀的影響,為我國優(yōu)質(zhì)肉牛的育種提供一定的理論依據(jù)。本研究中共檢測到18個SNP位點,通過分子生物學(xué)和生物信息學(xué)相結(jié)合對這些SNP多態(tài)性位點與12個性狀之間進行了關(guān)聯(lián)分析;同時測定了這3個基因在FLW牛不同等級大理石花紋群體和雙和牛不同組織中的表達差異,得到相關(guān)數(shù)據(jù),結(jié)果如下：1.利用直接測序和PCR-RFLP方法檢測到CPT2基因有9個SNP位點,通過SAS軟件(V9.13)的GLM(General Linear Model)方差分析9個SNP位點多態(tài)性基因型與生產(chǎn)性狀的相關(guān)性,結(jié)果發(fā)現(xiàn)：(1)The 5'upstreamG78T位點GG型個體的脂肪厚、大理石花紋等級和肌內(nèi)脂肪含量極其明顯的高于GT型個體,差異極顯著(P0.01)。該位點GG型個體的脂色等級和鮮肉水分含量明顯高于GT型個體(P0.05)。(2)The Exon1中A8G位點AA型個體的屠殺前重量明顯高于AG型個體(P0.05)。(3)The Intron1中G287A位點GG型個體的屠殺前重量和三角牛腩等級明顯高于GA型個體(P0.05)。(4)The Intron1中A346G位點AA型個體的屠殺前重量明顯高于AG型個體(P0.05)。(5)The Intron1中G369A位點GG型個體的屠殺前重量明顯高于AG型個體(P0.05)。(6)The 5'upstreamG29A和Intron1的G153T、C166T、A302G這4個位點所對應(yīng)的各個性狀均未達到差異顯著。2.利用直接測序和PCR-RFLP方法檢測到ABHD5基因有2個SNP位點,通過SAS軟件(V9.13)的GLM(General Linear Model)方差分析2個SNP位點多態(tài)性基因型與生產(chǎn)性狀的相關(guān)性,結(jié)果發(fā)現(xiàn)：(1)The 5'upstreamA941C位點AA型個體的三角牛腩等級極顯著高于CC型個體(P0.01)。AC型個體的脂肪厚和肌內(nèi)脂肪含量明顯高于CC型個體(P0.05)。CC型個體的鮮肉水分含量明顯高于AC個體(P0.05)。(2)The Intron5中A204G位點AG型個體的屠殺前重量和脂色等級明顯高于AA型個體(P0.05)。3.利用直接測序和PCR-RFLP方法檢測到ACSL1基因有7個SNP位點,通過SAS軟件(V9.13)的GLM(General Linear Model)方差分析7個SNP位點多態(tài)性基因型與生產(chǎn)性狀的相關(guān)性,結(jié)果發(fā)現(xiàn)：(1)The Exon6中C36G位點的CC型個體的屠殺前重量明顯高于CG型個體(P0.05)。CC型個體的上腦蓋極顯著的高于CG型個體(P0.01)(2)The Exon7中T131A、G132A位點AA型個體的上腦蓋明顯高于AB型個體(P0.05)。(3)The Exon7中C167A位點CA型個體的脂肪厚、脂色等級、肉色等級、肌內(nèi)脂肪含量均明顯高于CC型個體(P0.05),CA型個體的大理石花紋等級極顯著高于CC型個體(P0.01)。(4)The Exon7中A168T位點AT型個體的脂肪厚、脂色等級、肉色等級、肌內(nèi)脂肪含量均明顯高于AA型個體(P0.05),AT型個體的大理石花紋等級極顯著高于AA型個體(P0.01)。(5)The Intron5中C52T位點CC型個體的上腦蓋明顯高于CT型個體(P0.05)。(6)The Intron6中G101C位點所對應(yīng)的各個性狀均未達到差異顯著。4.CPT2基因和ABHD5基因在大理石花紋等級差異明顯的兩組個體中表達量均無顯著差異(P0.05);ACSL1基因在大理石花紋等級高的個體相應(yīng)表達量明顯高于等級低的個體(P0.05)。5.CPT2基因在心臟、肝臟、脾臟、肺、腎、肌肉、脂肪7個組織中的mRNA表達量差異極顯著,在肝臟組織中的表達量最高(P0.05);ABHD5基因和ACSL1基因在各個組織中的mRNA表達量均未達到差異顯著(P0.05)。
【關(guān)鍵詞】：CPT2 ABHD5 ACSL1 SNP 表達量 關(guān)聯(lián)分析
【學(xué)位授予單位】：山西農(nóng)業(yè)大學(xué)
【學(xué)位級別】：碩士
【學(xué)位授予年份】：2016
【分類號】：S823
【目錄】：

• 摘要6-8
• 第一章 文獻綜述8-24
• 1 國內(nèi)外肉牛的發(fā)展概況及牛的分子育種8-11
• 1.1 國外肉牛發(fā)展概況8
• 1.2 我國肉牛的發(fā)展概況8-9
• 1.3 FLW牛的概述9-10
• 1.4 雙和牛的概述10-11
• 1.5 牛的分子育種11
• 2 分子遺傳標(biāo)記及其在動物遺傳育種中的應(yīng)用11-15
• 2.1 RFLP標(biāo)記技術(shù)及其應(yīng)用12-13
• 2.2 SSLP標(biāo)記技術(shù)及其應(yīng)用13-14
• 2.3 SNP標(biāo)記技術(shù)及其應(yīng)用14
• 2.4 SSCP標(biāo)記技術(shù)及其應(yīng)用14-15
• 3 熒光定量PCR的概述及其應(yīng)用15-16
• 3.1 熒光定量PCR的概述15-16
• 3.2 熒光定量PCR的應(yīng)用16
• 4 CPT2、ABHD5、ACSL1基因的研究進展16-22
• 4.1 CPT2基因的研究進展16-18
• 4.2 ABHD5基因的研究進展18-20
• 4.3 ACSL1基因的研究進展20-22
• 5 本研究的內(nèi)容和意義22-24
• 第二章 FLW牛CPT2、ABHD5、ACSL1基因的SNP分析24-58
• 1 試驗材料與方法24-36
• 1.1 試驗材料24-27
• 1.2 試驗方法27-36
• 2 試驗結(jié)果與分析36-54
• 2.1 所提取DNA的濃度和純度36
• 2.2 CPT2、ABHD5基因和ACSL1基因DNA部分片段擴增結(jié)果鑒定36-37
• 2.3 測序結(jié)果37
• 2.4 CPT2、ABHD5基因和ACSL1基因SNPs位點的檢測及關(guān)聯(lián)分析37-54
• 3 討論54-56
• 3.1 試驗動物背景討論54
• 3.2 關(guān)于基因組DNA提取的討論54-55
• 3.3 關(guān)于PCR條件選擇的討論55
• 3.4 CPT2、ABHD5基因和ACSL1基因?qū)θ馄焚|(zhì)性狀影響的討論55-56
• 4 結(jié)論56-58
• 第三章 關(guān)于FLW牛CPT2、ABHD5、ACSL1基因個體差異表達的研究58-70
• 1 試驗材料和方法58-63
• 1.1 試驗材料58
• 1.2 試驗方法58-63
• 2 試驗結(jié)果與分析63-68
• 2.1 牛的總RNA檢測63-64
• 2.2 CPT2、ABHD5、ACSL1和β-actin基因cDNA部分片段擴增結(jié)果檢測64-65
• 2.3 CPT2、ABHD5和ACSL1基因在FLW牛不同個體中相對定量的擴增曲線和溶解曲線65-66
• 2.4 CPT2、ABHD5和ACSL1基因在FLW牛不同個體中的相對表達量及相關(guān)分析66-68
• 3 討論68-69
• 3.1 關(guān)于RNA提取的討論68
• 3.2 CPT2、ABHD5、ACSL1基因在FLW牛不同個體中表達差異的討論68-69
• 4 結(jié)論69-70
• 第四章 關(guān)于雙和牛CPT2、ABHD5、ACSL1基因組織差異表達的研究70-76
• 1 試驗材料和方法70-71
• 1.1 試驗材料70
• 1.2 試驗方法70-71
• 2 試驗結(jié)果與分析71-75
• 2.1 牛的總RNA檢測71
• 2.2 CPT2、ABHD5、ACSL1和β-actin基因cDNA部分片段擴增結(jié)果檢測71-72
• 2.3 CPT2、ABHD5和ACSL1基因在雙和牛不同組織中相對定量的擴增曲線和溶解曲線72-73
• 2.4 CPT2、ABHD5和ACSL1基因在雙和牛不同組織中mRNA表達量及相關(guān)分析73-75
• 3 討論75
• 3.1 關(guān)于RNA提取的討論75
• 3.2 CPT2、ABHD5、ACSL1基因在雙和牛不同組織中表達差異的討論75
• 4 結(jié)論75-76
• 全文結(jié)論76-78
• 參考文獻78-82
• Abstract82-84
• 附錄184-86
• 附錄286-87
• 附錄387-88
• 致謝88

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本文編號：811230