本文關(guān)鍵詞：基于DNA池重測序技術(shù)研究細(xì)毛羊LAMB1基因的SNPs分析

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【摘要】：層粘連蛋白β1(laminin-beta-1,LAMB1)作為層粘連蛋白家族成員之一,在生物過程中發(fā)揮極為重要的作用。為了分析細(xì)毛羊(Ovis aries)毛性狀相關(guān)候選基因LAMB1的遺傳效應(yīng),本研究通過DNA池重測序技術(shù)篩選了LAMB1基因外顯子區(qū)的5個單核苷酸多態(tài)性(single nucleotide polymorphisms,SNPs),對其使用聚合酶鏈反應(yīng)-單鏈構(gòu)象多態(tài)性(single strand conformation polymorphism analysis of polymerase chain reaction products,PCR-SSCP)技術(shù)分型,在此基礎(chǔ)上,利用SAS 8.1的GLM程序分析其對新疆鞏乃斯種羊場418只細(xì)毛羊毛性狀的遺傳效應(yīng),利用Haplo View 4.2軟件進(jìn)行連鎖不平衡(linkage disequilibrium,LD)分析。結(jié)果顯示,該細(xì)毛羊群體遺傳變異處于中等水平,LAMB1的5個SNPs發(fā)生錯義突變。SNP2中AA和GA基因型個體鑒定時體重、剪毛后體重極顯著高于GG基因型個體(P0.01);SNP4中CC、TT和TC基因型個體間的自然長度差異極顯著(P0.01),CC基因型個體的剪毛后體重極顯著高于TT和TC基因型的個體(P0.01);而其他SNPs各基因型個體間的部分毛性狀有顯著差異(P0.05)。SNP1和SNP3、SNP2和SNP3處于連鎖不平衡狀態(tài),LAMB1基因可作為具有潛在應(yīng)用價值的細(xì)毛羊毛性狀分子標(biāo)記之一。本研究揭示了LAMB1基因的分子遺傳特征及其與細(xì)毛羊群體的遺傳關(guān)系,為高效選育細(xì)毛羊經(jīng)濟(jì)性狀及對其種質(zhì)資源的保護(hù)與利用提供了分子學(xué)基礎(chǔ)。
【作者單位】： 新疆農(nóng)業(yè)大學(xué)動物科學(xué)學(xué)院;新疆畜牧科學(xué)院;
【關(guān)鍵詞】： DNA池重測序 層粘連蛋白β基因(LAMB) 細(xì)毛羊 遺傳效應(yīng) 關(guān)聯(lián)分析
【基金】：國家自然科學(xué)基金(No.31360543和No.31460593) 國家毛絨羊產(chǎn)業(yè)技術(shù)體系子課題(No.CARS-40) 新疆農(nóng)業(yè)大學(xué)產(chǎn)學(xué)研聯(lián)合培養(yǎng)研究生示范基地項目(No.xjaucxy-yjs-20152012)
【分類號】：S826
【正文快照】： 隨著分子生物技術(shù)的發(fā)展,細(xì)毛羊(Ovis aries)育種過程中分子標(biāo)記技術(shù)逐漸發(fā)揮重要作用,從分子水平研究候選基因與細(xì)毛羊經(jīng)濟(jì)性狀之間的關(guān)聯(lián)性,篩查出具有優(yōu)良基因的種羊,可以提高選擇效率與準(zhǔn)確性,對細(xì)毛羊育種和生產(chǎn)具有重要意義。層粘連蛋白β1基因(laminin-beta-1,LAMB1)是

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本文編號：768847