本文關(guān)鍵詞：基于RNA-Seq篩選禽致病性大腸桿菌損傷雛雞小腸差異表達(dá)基因

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【摘要】：為篩選禽致病性大腸桿菌(APEC)感染雛雞后其小腸損傷的差異表達(dá)基因,本研究利用APEC菌株經(jīng)腿部肌肉途徑接種兩周齡雛雞,對照組雞以相同的途徑注射相同體積的生理鹽水,選取病變嚴(yán)重的腸道與對照組腸道,利用高通量RNA-Seq技術(shù)篩選出雛雞小腸受APEC損傷后的差異表達(dá)基因,對其進(jìn)行生物信息學(xué)GO功能分類和KEGG信號(hào)通路分析,并利用熒光定量PCR驗(yàn)證部分差異表達(dá)基因。結(jié)果顯示差異變化在2倍以上的基因共有131個(gè),其中74個(gè)上調(diào)表達(dá),57個(gè)下調(diào)表達(dá)。GO功能分類結(jié)果顯示,這些基因主要涉及到蛋白結(jié)合、免疫反應(yīng)、轉(zhuǎn)運(yùn)活動(dòng)等功能。KEGG分析表明這些差異表達(dá)基因參與PPAR、新陳代謝、細(xì)胞因子受體相互作用、Jak-STAT、RIG-I-樣受體、吞噬體等信號(hào)通路。本研究為進(jìn)一步研究APEC的致病作用及宿主抗病機(jī)制奠定了基礎(chǔ)。
【作者單位】： 安徽農(nóng)業(yè)大學(xué)動(dòng)物科技學(xué)院;
【關(guān)鍵詞】： 禽致病性大腸桿菌 雛雞小腸 轉(zhuǎn)錄組測序 差異表達(dá)基因
【基金】：國家自然科學(xué)基金項(xiàng)目(31372402) 安徽省自然科學(xué)基金(1508085SQC206)
【分類號(hào)】：S858.31
【正文快照】： RNA-Seq技術(shù)是指針對轉(zhuǎn)錄產(chǎn)物RNA的測序技術(shù),重點(diǎn)在對翻譯蛋白的m RNA進(jìn)行測序研究。有研究利用RNA-Seq獲得感染真菌的利馬豆的全基因組信息,發(fā)現(xiàn)宿主與病原在分子方面的相互作用機(jī)制[1]。Xiang等通過RNA-Seq技術(shù)分析了海鱸魚受哈維氏弧菌攻擊前后的差異表達(dá)基因[2]。RNA-Seq

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本文編號(hào)：742388