豬偽狂犬病毒Fa株侵染對PK-15細胞microRNAs表達譜的影響
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【摘要】:【目的】分析豬偽狂犬病毒Fa株(PRV-Fa)侵染對豬腎傳代細胞PK-15 microRNAs(miRNAs)表達譜的影響!痉椒ā坷肐llumina高通量測序技術(shù),鑒定感染和非感染PRV-Fa的PK-15細胞的miRNAs;篩選并利用實時熒光定量RT-PCR(RT-q PCR)驗證差異表達miRNAs;對差異miRNAs進行靶基因預(yù)測和Gene ontology(GO)分析!窘Y(jié)果】在感染和未感染PK-15細胞中分別檢測到384個和405個miRNAs,其中感染PRV-Fa后差異表達的miRNAs共127個(60個上調(diào),67個下調(diào))。熒光定量結(jié)果顯示差異miRNAs的表達趨勢與高通量測序結(jié)果一致。GO分析顯示,miRNAs廣泛參與信號傳導(dǎo)、細胞代謝、免疫反應(yīng)、基因表達等生物學(xué)進程,其中miR-10b、miR-16、miR-18a、miR-19b、miR-20a、miR-145-5p、miR-146a、miR-181a、miR-499-5p等miRNAs與免疫相關(guān)。在靶基因調(diào)控網(wǎng)絡(luò)圖中,ssc-miR-30a-5p與ssc-miR-30d處于關(guān)鍵位置。研究鑒定出5個新的病毒編碼miRNAs,其中PRV-miR-LLT2與PRV-miR-LLT4靶向PRV早期蛋白基因EPO!窘Y(jié)論】偽狂犬病毒Fa株感染對PK-15細胞編碼miRNAs有顯著影響。
【作者單位】: 四川農(nóng)業(yè)大學(xué)動物生物技術(shù)中心;動物疫病與人類健康四川省重點實驗室;
【關(guān)鍵詞】: 豬偽狂犬病毒 microRNAs 高通量測序 PK-細胞
【正文快照】: 偽狂犬病是由α-皰疹病毒甲亞科的偽狂犬病毒(Pseudorabies virus,PRV)引起,可導(dǎo)致母豬流產(chǎn)或產(chǎn)弱胎、死胎、木乃伊胎,導(dǎo)致公豬睪丸炎等,是危害我國養(yǎng)豬業(yè)的重大疾病之一。自1813年報道發(fā)生以來,目前偽狂犬病已呈世界性分布。我國雖長期采取廣泛的免疫、凈化措施,但該病仍呈局
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,本文編號:740967
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