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轉(zhuǎn)DGAT1基因小鼠與野生型小鼠腓腸肌差異表達基因的篩選與分析

發(fā)布時間:2017-08-13 13:44

  本文關(guān)鍵詞:轉(zhuǎn)DGAT1基因小鼠與野生型小鼠腓腸肌差異表達基因的篩選與分析


  更多相關(guān)文章: 肌內(nèi)脂肪 三酰甘油 肉質(zhì) DGAT1 基因芯片


【摘要】:脂肪是哺乳動物主要的儲能物質(zhì),能夠為機體提供能量,緩解外界對內(nèi)臟器官的壓力,同時還能影響肉的食用價值,特別是對肌內(nèi)脂肪含量、嫩度等有重要影響。脂肪的主要成分是三酰甘油,DGAT1是控制三酰甘油合成的關(guān)鍵酶,研究其作用機制有助于提升肌內(nèi)脂肪的含量,改善肉的品質(zhì)。本實驗以肌肉超表達DGAT1的轉(zhuǎn)基因小鼠和野生型小鼠為實驗動物,采用Affymetrix公司AFF-902462的小鼠基因組芯片,檢測轉(zhuǎn)DGAT1小鼠腓腸肌的差異表達基因,以期能找到DGAT1調(diào)控肌內(nèi)脂肪沉積的新機制。用Expression Console軟件對芯片數(shù)據(jù)進行分析,結(jié)果顯示在轉(zhuǎn)DGAT1基因小鼠的腓腸肌中差異表達倍數(shù)(fold change)大于1.5倍且P0.05的基因有281個,其中有169個上調(diào)表達,112下調(diào)表達。采用PCR技術(shù)對其中10個基因(SREBF1,PDK4,UCP3,DUSP1,FKBP5,ZBTB16,PLAGL1,PPP1R3C,CDC14A和GLUL1)進行驗證,RT-PCR與芯片結(jié)果一致。利用MAS3.0對差異表達基因進行信號通路分析,信號通路主要集中在G蛋白偶聯(lián)受體、信號轉(zhuǎn)導、氧化還原、嗅覺感受器受體活性、蛋白結(jié)合、鋅離子結(jié)合等,本結(jié)果為DGAT1調(diào)控肌內(nèi)脂肪的作用機制提供了理論依據(jù)。
【關(guān)鍵詞】:肌內(nèi)脂肪 三酰甘油 肉質(zhì) DGAT1 基因芯片
【學位授予單位】:華中農(nóng)業(yè)大學
【學位級別】:碩士
【學位授予年份】:2016
【分類號】:S852.2
【目錄】:
  • 摘要6-7
  • ABSTRACT7-8
  • 中英文縮寫對照表8-9
  • 第一章 文獻綜述9-16
  • 1 引言9
  • 2 脂肪形成概述9-10
  • 3 脂肪的分類10
  • 4 影響肌內(nèi)脂肪沉積的因素10-11
  • 4.1 外部因素10-11
  • 4.2 內(nèi)部因素11
  • 5 三酰甘油的合成11-12
  • 6 DGAT1基因的研究進展12-15
  • 6.1 DGAT1對胰島素和瘦素敏感性的影響13
  • 6.2 DGAT1對白色脂肪內(nèi)分泌功能的影響13-14
  • 6.3 DGAT1對采食量和能量代謝的影響14
  • 6.4 DGAT1對器官生理功能的影響14-15
  • 7 本研究的目的和意義15-16
  • 第二章 材料與方法16-24
  • 1 材料16-18
  • 1.1 主要儀器與設(shè)備16-17
  • 1.2 主要試劑及試劑盒17
  • 1.3 常用化學試劑及其配制17
  • 1.4 主要分子生物學軟件及數(shù)據(jù)庫17-18
  • 2 方法18-24
  • 2.1 DNA的提取18
  • 2.2 DGAT1轉(zhuǎn)基因小鼠的鑒定18-19
  • 2.3 組織總RNA的提取19-20
  • 2.4 RNA的反轉(zhuǎn)錄20-21
  • 2.5 芯片數(shù)據(jù)的分析21
  • 2.6 RT-PCR驗證基因芯片21
  • 2.7 RT-PCR的引物的設(shè)計和合成21-23
  • 2.8 基因差異表達分析23
  • 2.9 RT-PCR結(jié)果和基因芯片結(jié)果的相關(guān)系數(shù)和顯著性分析23-24
  • 第三章 結(jié)果與分析24-37
  • 1 部分DGAT1轉(zhuǎn)基因小鼠的PCR鑒定24
  • 2 總RNA的質(zhì)檢結(jié)果24-25
  • 3 芯片信號值分布結(jié)果25
  • 4 各樣品主成分分析結(jié)果25-26
  • 5 差異基因的層次聚類26-27
  • 6 組間差異基因的篩選27-30
  • 7 RT-PCR和基因芯片兩種結(jié)果的相關(guān)性分析30
  • 8 差異表達基因的生物信息學分析30-37
  • 8.1 差異表達基因KEGG Pathway分析30-32
  • 8.2 差異基因之間的相互關(guān)系分析32-33
  • 8.3 差異基因編碼蛋白的互作分析33-34
  • 8.4 差異表達基因Gene ontology(GO)分析34-37
  • 第四章 討論37-41
  • 1 利用基因芯片檢測肌肉超表達DGAT1后基因表達的變化37
  • 2 不同類型差異基因的生物學功能分析37-40
  • 2.1 糖代謝相關(guān)基因37-38
  • 2.2 脂肪合成相關(guān)基因38-39
  • 2.3 脂肪氧化相關(guān)基因39-40
  • 2.4 應激相關(guān)基因40
  • 3 下一步工作計劃40-41
  • 小結(jié)41-42
  • 參考文獻42-53
  • 致謝53

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本文編號:667612

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