藏羊GM-CSF基因的RT-PCR擴增、序列分析及蛋白結(jié)構(gòu)預(yù)測
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【摘要】:為了研究藏羊GM-CSF基因及其編碼蛋白的功能,提取藏羊脾臟總RNA,應(yīng)用RT-PCR技術(shù)對藏羊GM-CSF基因進行擴增及測序,并利用DNA Star軟件進行序列分析及編碼蛋白結(jié)構(gòu)預(yù)測。測試表明,藏羊GM-CSF基因長度為381 bp,編碼127個氨基酸;藏羊GM-CSF基因與參考綿羊、藏羚羊、山羊和水牛的GM-CSF基因的核苷酸序列同源性依次為100%、99.2%、98.7%和92.1%,氨基酸序列同源性依次為100%、97.6%、96.9%和81.0%。蛋白結(jié)構(gòu)預(yù)測表明GM-CSF蛋白具有1個N-糖基化位點、1個N-豆蔻;稽c、1個粒細胞-巨噬細胞集落刺激因子信號、2個蛋白激酶C磷酸化位點、3個酪蛋白激酶Ⅱ磷酸化位點;綜合二、三級結(jié)構(gòu)預(yù)測得出,該蛋白主要由α螺旋組成,其次是β轉(zhuǎn)角和無規(guī)則卷曲,而β折疊相對較少。研究成果可為青海藏羊GM-CSF基因抗病功能的研究提供參考。
【作者單位】: 青海大學(xué)農(nóng)牧學(xué)院省部共建三江源生態(tài)與高原農(nóng)牧業(yè)國家重點實驗室;
【關(guān)鍵詞】: 藏羊 GM-CSF基因 RT-PCR 序列分析 蛋白結(jié)構(gòu)預(yù)測
【基金】:青海省科技廳項目(2016-ZJ-738) 青海大學(xué)“123高層次人才培養(yǎng)工程”項目共同資助
【分類號】:S826
【正文快照】: RT-PCR Amplification and Sequence Analysis of GM-CSF Gene of TibetanSheep and Protein Structure PredictionZhang Xiaofen Ye Guisheng*Ma Yuhua He Xiaolong Kang Ming Han Zhihui Jia Yuening ZhangHongboCollege of Agriculture and Animal Husbandry,Qinghai Unive
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本文編號:641232
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