放牧對布氏田鼠種群遺傳多樣性的影響
本文關鍵詞:放牧對布氏田鼠種群遺傳多樣性的影響
更多相關文章: 草原生態(tài)系統(tǒng) 布氏田鼠 放牧 遺傳多樣性
【摘要】:鼠害給我國畜牧業(yè)和農(nóng)業(yè)生產(chǎn)帶來嚴重危害,鼠害的發(fā)生具有一定的時空特異性,研究害鼠的種群數(shù)量波動機制有利于有效預防和控制鼠害的發(fā)生。布氏田鼠(Lasiopodomys brandtii)是我國北方草原地區(qū)害鼠的優(yōu)勢種之一,其嚴重破壞草原植被,影響我國農(nóng)業(yè)和畜牧業(yè)生產(chǎn)。影響草原鼠害的因素較多,放牧是影響草原鼠害的主要原因之一,但放牧對內(nèi)蒙古草原主要害鼠布氏田鼠種群數(shù)量的調(diào)控效應還不清楚,放牧是否會影響害鼠種群的遺傳結(jié)構(gòu)等一系列問題還未見報道。本研究以內(nèi)蒙古草原動物生態(tài)研究站(Joint Research Station of Animal Ecology in Inner Mongolia Grassland,JRSAEIMG)中度放牧處理圍欄的布氏田鼠種群為實驗材料,對照圍欄的布氏田鼠種群作為對照,篩選10個布氏田鼠微衛(wèi)星標記,檢測中度放牧處理圍欄及對照圍欄中布氏田鼠種群的遺傳多樣性,探究放牧對布氏田鼠種群數(shù)量及遺傳多樣性的影響。以圍欄中布氏田鼠的腳趾為實驗材料,用常規(guī)的酚/氯仿抽提法提取基因組DNA,用瓊脂糖凝膠電泳和分光光度計檢測基因組DNA;以所提取基因組為模板,篩選10個布氏田鼠微衛(wèi)星標記的引物序列進行PCR擴增,對每個個體的每個微衛(wèi)星標記位點進行基因分型,并對純合子進行克隆測序,構(gòu)建數(shù)據(jù)庫,再利用Popgene軟件對每個位點的等位基因數(shù)(Na),有效等位基因數(shù)(Ne),觀測雜合度(Ho),期望雜合度(He),多態(tài)信息含量(PIC)等遺傳多樣性指數(shù)進行統(tǒng)計分析。分析結(jié)果表明,中度放牧處理圍欄在BVM02、BVM03、BVM04、BVM05、BVM06、Mb13n、Mb17n、Mb28n、Mb29n、Mb31n位點檢測到的等位基因數(shù)分別為5,5,3,4,5,6,8,7,6,3;有效等位基因數(shù)分別為2.75,5.40,2.16,2.05,5.23,7.71,6.75,7.36,6.48,2.42;觀測雜合度分別為0.64,0.71,0.54,0.51,0.51,0.67,0.85,0.66,0.65,0.59;期望雜合度分別為0.65,0.84,0.55,0.53,0.83,0.89,0.88,0.89,0.87,0.60;多態(tài)信息含量分別為0.48,0.60,0.47,0.47,0.50,0.54,0.64,0.66,0.63,0.52;10個位點的平均等位基因數(shù)為5.20,平均有效等位基因數(shù)為4.83,平均觀測雜合度為0.63,平均期望雜合度為0.75,平均多態(tài)信息含量為0.55。對照圍欄在BVM02、BVM03、BVM04、BVM05、BVM06、Mb13n、Mb17n、Mb28n、Mb29n、Mb31n位點檢測到的等位基因數(shù)分別為6,7,8,6,5,7,10,9,8,8;有效等位基因數(shù)分別為4.86,6.82,6.98,5.26,3.81,4.69,7.96,6.24,5.88,6.43;觀測雜合度分別為0.74,0.83,0.75,0.73,0.67,0.78,0.86,0.81,0.80,0.76;期望雜合度分別為0.81,0.87,0.87,0.82,0.75,0.80,0.89,0.85,0.84,0.86;多態(tài)信息含量分別為0.69,0.81,0.72,0.71,0.65,0.75,0.84,0.80,0.81,0.74;10個位點的平均等位基因數(shù)為7.40,平均有效等位基因數(shù)為5.89,平均觀測雜合度為0.77,平均期望雜合度為0.84,平均多態(tài)信息含量為0.75。將中度放牧處理圍欄的布氏田鼠種群數(shù)量與對照圍欄的布氏田鼠種群數(shù)量進行差異性比較,差異顯著(P0.05);將中度放牧處理圍欄布氏田鼠種群的遺傳多樣性指標與對照圍欄布氏田鼠種群的遺傳多樣性指標進行差異顯著性比較,差異顯著(P0.05)。由本研究檢測結(jié)果可知,放牧可使布氏田鼠種群數(shù)量顯著降低,種群的遺傳多樣性顯著降低,說明放牧在控制草原鼠害方面具有一定的作用。
【關鍵詞】:草原生態(tài)系統(tǒng) 布氏田鼠 放牧 遺傳多樣性
【學位授予單位】:曲阜師范大學
【學位級別】:碩士
【學位授予年份】:2016
【分類號】:S812.6
【目錄】:
- 摘要3-5
- Abstract5-9
- 第1章 文獻綜述9-17
- 1.1 草原生態(tài)系統(tǒng)9-10
- 1.2 草原鼠害的現(xiàn)狀及治理措施10-11
- 1.3 內(nèi)蒙古草原的主要害鼠布氏田鼠11-13
- 1.4 生物的遺傳多樣性13
- 1.5 放牧對草原生態(tài)系統(tǒng)的影響13-14
- 1.6 遺傳標記及種群的遺傳結(jié)構(gòu)14-15
- 1.7 布氏田鼠微衛(wèi)星篩選及遺傳多樣性研究的相關研究15-16
- 1.8 研究目的與意義16-17
- 第2章 材料與方法17-27
- 2.1 實驗材料17-20
- 2.1.1 動物材料處理與取樣17-18
- 2.1.2 實驗儀器18
- 2.1.3 實驗藥品及配制18-19
- 2.1.4 實驗試劑19-20
- 2.2 實驗方法20-26
- 2.2.1 布氏田鼠基因組DNA的提取20
- 2.2.2 瓊脂糖凝膠電泳檢測基因組DNA20-21
- 2.2.3 微衛(wèi)星引物的篩選21-23
- 2.2.4 PCR序列擴增23
- 2.2.5 瓊脂糖凝膠電泳檢測與目的片段的回收23-24
- 2.2.6 感受態(tài)的制備24-25
- 2.2.7 連接25
- 2.2.8 轉(zhuǎn)化與篩選25
- 2.2.9 鑒定陽性克隆與保種25-26
- 2.3 數(shù)據(jù)分析26-27
- 第3章 結(jié)果與分析27-37
- 3.1 布氏田鼠微衛(wèi)星引物的篩選及序列的克隆測序27-32
- 3.1.1 引物篩選結(jié)果27-28
- 3.1.2 不同引物PCR反應的電泳結(jié)果28-32
- 3.1.3 不同引物測序結(jié)果32
- 3.2 微衛(wèi)星座位的遺傳多樣性指標32-34
- 3.2.1 微衛(wèi)星座位的等位基因數(shù)及有效等位基因數(shù)32-33
- 3.2.2 微衛(wèi)星座位的多態(tài)信息含量33
- 3.2.3 微衛(wèi)星座位在各圍欄的雜合度33-34
- 3.3 放牧對種群數(shù)量的影響34-35
- 3.4 放牧對種群遺傳結(jié)構(gòu)的影響35-37
- 第4章 討論37-41
- 4.1 微衛(wèi)星標記37
- 4.2 遺傳多樣性指標37-39
- 4.2.1 等位基因數(shù)及有效等位基因數(shù)37-38
- 4.2.2 多態(tài)信息含量38
- 4.2.3 雜合度分析38-39
- 4.3 放牧對種群數(shù)量、種群遺傳結(jié)構(gòu)的影響39
- 4.4 放牧對草原鼠害控制的效應39-41
- 第5章 結(jié)論41-42
- 參考文獻42-46
- 附錄46-52
- 致謝52
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,本文編號:590853
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