本文關(guān)鍵詞：寧都黃雞BMP15、INHA基因多態(tài)性與生長、繁殖性狀的關(guān)聯(lián)分析，由筆耕文化傳播整理發(fā)布。

【摘要】：寧都黃雞是江西省地方優(yōu)質(zhì)肉用型雞種,具有性成熟時間早、肉質(zhì)鮮嫩等特點。性早熟是由多基因控制的一個復(fù)雜性狀,為了探索寧都黃雞早熟性分子調(diào)控機制并發(fā)現(xiàn)控制早熟性的主效基因,或者與之緊密連鎖的分子標記。本研究以純種寧都黃雞母雞兩個批次群體共195個樣本為試驗材料,測定其生長和繁殖性能指標,并進行各性狀相關(guān)性分析;以骨形態(tài)發(fā)生蛋白15(BMP15)基因和抑制素α(INHA)基因為候選基因,采用直接測序法對寧都黃雞BMP15基因兩外顯子區(qū)域和INHA整個基因進行序列掃描,篩選SNP,并與生長和繁殖性狀進行相關(guān)性分析,主要結(jié)果如下:1.不同日齡生長性狀之間的相關(guān)性多數(shù)均達到了顯著水平,說明寧都黃雞生長發(fā)育狀況良好,符合正常營養(yǎng)水平下的生長規(guī)律,寧都黃雞育成期體重越大,開產(chǎn)日齡越早;開產(chǎn)日齡越晚,開產(chǎn)蛋重就越大。2.通過對BMP15基因外顯子及兩側(cè)翼序列測序,共發(fā)現(xiàn)12個SNP突變位點,其中4個為錯義突變(c.34CT突變使亮氨酸變成苯丙氨酸,c.473GA突變使精氨酸變成組氨酸,c.656TC突變使亮氨酸變成脯氨酸,c.709GA突變使甘氨酸變成絲氨酸),c.473GA和c.656TC為新發(fā)現(xiàn)位點。在INHA基因中共搜尋到突變位點21個,均為SNP。其中1個為錯義突變(c.619CT突變使精氨酸變成半胱氨酸)。3.BMP15基因12個SNP與寧都黃雞兩批次群體生長、繁殖性狀關(guān)聯(lián)分析,結(jié)果表明,存在多個與生長性狀顯著相關(guān)的突變位點,說明BMP15基因與動物機體的生長發(fā)育有緊密聯(lián)系,c.633CT與開產(chǎn)冠高、開產(chǎn)冠長和開產(chǎn)體重極顯著或顯著相關(guān),但未發(fā)現(xiàn)與性早熟緊密關(guān)聯(lián)的突變位點。4.INHA基因內(nèi)c.240TC(Exon1)、g.816TC(Intron1)和外顯子2共10個SNP與寧都黃雞兩批次群體生長、繁殖性狀關(guān)聯(lián)分析。結(jié)果顯示,存在多個與生長性狀顯著相關(guān)的突變位點,說明INHA基因與動物機體的生長發(fā)育有緊密聯(lián)系,其中c.849CT與出雛體重、開產(chǎn)日齡/體重/冠高/脛長、70日齡體重、98日齡體重/冠高/冠長顯著或極顯著相關(guān),但未發(fā)現(xiàn)與性早熟緊密關(guān)聯(lián)的突變位點。
【關(guān)鍵詞】：寧都黃雞 BMP15基因 INHA基因 SNP 生長性狀 繁殖性狀
【學位授予單位】：江西農(nóng)業(yè)大學
【學位級別】：碩士
【學位授予年份】：2016
【分類號】：S831
【目錄】：

• 摘要6-7
• Abstract7-8
• 第一章 文獻綜述8-15
• 1.1 寧都黃雞概述8-9
• 1.1.1 寧都黃雞的生長及屠體性能8-9
• 1.1.2 寧都黃雞的繁殖特性9
• 1.2 性成熟的影響因素9-11
• 1.2.1 環(huán)境因素9-10
• 1.2.2 營養(yǎng)因素10
• 1.2.3 遺傳因素10-11
• 1.3 遺傳標記11
• 1.4 BMP15和INHA基因概述11-14
• 1.4.1 BMP15基因概述13
• 1.4.2 INHA基因概述13-14
• 1.5 本實驗的研究內(nèi)容和意義14-15
• 第二章 寧都黃雞生長和繁殖性狀相關(guān)性分析15-21
• 2.1 材料和方法15
• 2.1.1 試驗材料15
• 2.1.2 試驗方法15
• 2.2 結(jié)果與分析15-19
• 2.2.1 表型性狀簡單統(tǒng)計分析15-16
• 2.2.2 表型性狀相關(guān)性分析16-19
• 2.3 討論19
• 2.3.1 寧都黃雞生長和繁殖性狀數(shù)據(jù)分析19
• 2.3.2 寧都黃雞生長和繁殖性狀相關(guān)性分析19
• 2.4 小結(jié)19-21
• 第三章 寧都黃雞BMP15基因多態(tài)性與生長、繁殖性狀關(guān)聯(lián)性分析21-34
• 3.1 材料和方法21-25
• 3.1.1 試驗材料21-22
• 3.1.1.1 試驗主要儀器21
• 3.1.1.3 試驗主要試劑21
• 3.1.1.4 試劑配制21-22
• 3.1.2 試驗方法22-25
• 3.1.2.1 表型性狀測定22
• 3.1.2.2 血樣采集與基因組DNA的提取22
• 3.1.2.3 引物的設(shè)計與合成22
• 3.1.2.4 PCR擴增體系及產(chǎn)物檢測22-23
• 3.1.2.5 寧都黃雞BMP15基因遺傳多態(tài)性分析23-24
• 3.1.2.6 數(shù)據(jù)統(tǒng)計分析24-25
• 3.2 試驗結(jié)果分析25-32
• 3.2.1 SNPs篩選25
• 3.2.2 BMP15基因多態(tài)位點群體遺傳學分析25-27
• 3.2.3 BMP15基因多態(tài)性與寧都黃雞生長、繁殖性狀的關(guān)聯(lián)分析27-32
• 3.3 討論32-33
• 3.3.1 BMP15基因遺傳多樣性分析32
• 3.3.2 BMP15基因與寧都黃雞生長、繁殖性狀的關(guān)聯(lián)分析32-33
• 3.4 小結(jié)33-34
• 第四章 寧都黃雞INHA基因多態(tài)性與生長、繁殖性狀關(guān)聯(lián)性分析34-44
• 4.1 材料和方法34-35
• 4.1.1 試驗材料34
• 4.1.2 試驗方法34-35
• 4.1.2.1 表型性狀測定34
• 4.1.2.2 血樣采集與基因組DNA的提取34
• 4.1.2.3 引物的設(shè)計與合成34
• 4.1.2.4 PCR擴增體系及產(chǎn)物檢測34
• 4.1.2.5 寧都黃雞INHA基因遺傳多態(tài)性分析34-35
• 4.1.2.6 數(shù)據(jù)統(tǒng)計分析35
• 4.2 試驗結(jié)果及分析35-42
• 4.2.1 SNPs篩選35-36
• 4.2.2 INHA 基因在寧都黃雞群體中的變異位點多態(tài)性的檢測36-37
• 4.2.3 INHA基因多態(tài)位點群體遺傳學分析37-39
• 4.2.4 INHA基因多態(tài)性與寧都黃雞生長、繁殖性狀的關(guān)聯(lián)分析39-42
• 4.3 討論42-43
• 4.3.1 INHA 基因多態(tài)位點鑒別和基本統(tǒng)計分析42
• 4.3.2 INHA基因與寧都黃雞生長、繁殖性狀的關(guān)聯(lián)分析42-43
• 4.4 小結(jié)43-44
• 第五章 全文總結(jié)44-45
• 參考文獻45-50
• 致謝50

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本文編號：493232