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牦牛KAP1家族基因長度多態(tài)研究

發(fā)布時(shí)間:2017-06-27 05:00

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【摘要】:試驗(yàn)旨在研究牦牛角蛋白關(guān)聯(lián)蛋白1(keratin associated protein 1,KAP1)家族基因長度多態(tài)與重復(fù)序列特點(diǎn)。研究對(duì)牦牛和黃牛KAP1家族基因進(jìn)行測序,并與綿羊已知序列進(jìn)行比較分析。結(jié)果發(fā)現(xiàn),牛KAP1家族位于19號(hào)染色體,根據(jù)綿羊KAP1家族基因在染色體上的位置與相似性,重新命名了牛KAP1家族基因B2D、B2A、KAP1-1和B2C為KAP1-4、KAP1-1、KAP1-2、KAP1-3(按照染色體上的基因順序)。KAP1家族基因之間在3′和5′端區(qū)域高度保守,中間有重復(fù)序列長度差異,其中牦牛KAP1-KAP4基因發(fā)現(xiàn)有30bp的長度多態(tài)。研究其蛋白序列發(fā)現(xiàn)5個(gè)氨基酸為基序的重復(fù)序列B(CCQTS)A1(CCQPT),以及一個(gè)新的重復(fù)序列C(SIQTS)。本研究結(jié)果說明重復(fù)序列是KAP1家族基因間和基因內(nèi)的主要差異區(qū)域,這可能與其角蛋白結(jié)合螺旋數(shù)相關(guān)。
【作者單位】: 中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院北京畜牧獸醫(yī)研究所;內(nèi)蒙古國際蒙醫(yī)醫(yī)院;西南大學(xué);中山大學(xué);
【關(guān)鍵詞】KAP家族基因 牦牛 長度多態(tài) 重復(fù)序列
【基金】:"十一五"國家科技支撐計(jì)劃資助項(xiàng)目(2008BADB2B01) 中國農(nóng)業(yè)科學(xué)院對(duì)CAAS-ILRI聯(lián)合實(shí)驗(yàn)室的資助基金
【分類號(hào)】:S823
【正文快照】: 角蛋白關(guān)聯(lián)蛋白(keratin-associated proteins,KAPs)主要是與角蛋白相結(jié)合并共同形成毛發(fā)的主干[1]。基于其蛋白序列的相似性KAPs被分為23個(gè)家族[2]。KAP蛋白根據(jù)氨基酸特點(diǎn)又被分為3類[3-4]:第一類為高甘氨酸酪氨酸蛋白(HGT),由KAP6-8、KAP18-22家族編碼;第二類為高硫蛋白(HS

【相似文獻(xiàn)】

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本文編號(hào):488558

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