豬ARID5B基因多態(tài)性及其與脂肪沉積性狀的相關(guān)性分析
發(fā)布時間:2024-05-27 19:39
為探究豬ARID5B基因多態(tài)性及其與脂肪沉積性狀的相關(guān)性,在DNA水平上對藏豬、大白豬ARID5B(AT-rich interaction domain 5B)基因5′側(cè)翼區(qū)進行了單核苷酸多態(tài)性(Single nucleotide polymorphism,SNP)位點篩選;在mRNA水平上對兩豬種的肝臟、背脂和背最長肌組織中的ARID5B基因表達量進行了RT-qPCR檢測;并對兩豬種的背膘厚和背最長肌組織中IMF(Intramuscular fat)含量進行測定。結(jié)果表明:在ARID5B基因5’側(cè)翼區(qū),存在T-2 216C和In-2 029Del缺失2個連鎖突變位點,藏豬與大白豬呈極顯著差異(P<0.01);在相同組織不同品種間,ARID5B基因在肝臟、背脂和背最長肌中mRNA相對表達量趨勢完全一致,且藏豬ARID5B基因表達量均極顯著低于大白豬(P<0.01);藏豬背膘厚和IMF含量均極顯著高于大白豬(P<0.01);經(jīng)DNA、mRNA水平、背膘厚和IMF含量相關(guān)性分析發(fā)現(xiàn),ARID5B基因mRNA相對表達量與背膘厚和IMF含量呈顯著負相關(guān)(P<0.05)。
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本文編號:3983013
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圖1ARID5B基因突變位點測序峰圖
在5′側(cè)翼區(qū)共發(fā)現(xiàn)2個多態(tài)性位點(圖1),其中在該基因起始密碼子上游2216bp位置發(fā)現(xiàn)T/C突變,記為T-2216C(圖1(a));在起始密碼子上游第2029~2036bp的8個堿基(ATTTATTT)的插入/缺失突變,記為In-2029Del(圖1(b))。在藏豬(....
圖2ARID5B基因在TP和LW兩個品種豬背脂、背最長肌和肝臟中mRNA的相對表達量
由表5可知,180日齡藏豬、大白豬背最長肌IMF含量分別為4.11%和2.28%,藏豬IMF含量極顯著高于大白豬(P<0.01)。2.6ARID5B基因表達量與背膘厚和IMF含量相關(guān)性分析
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