雞作為重要的經(jīng)濟動物,為人類提供雞蛋和雞肉等優(yōu)質(zhì)動物性食品。雞的蛋用性狀包括產(chǎn)蛋性能和蛋品質(zhì),屬于數(shù)量性狀,由微效多基因控制。利用SNP芯片的方法進行全基因組關(guān)聯(lián)分析(Genome-wide association study,GWS)找到大量與蛋用性狀關(guān)聯(lián)的SNPs;然而一些SNPs在應(yīng)用上并不能維持良好的重復性,即應(yīng)用到其它群體或世代中重復不出所期望的效果。近年的研究發(fā)現(xiàn)CNV與SNP對基因組中遺傳變異的解釋是互補的。CNV屬于結(jié)構(gòu)變異,相比于堿基突變的遺傳效應(yīng),結(jié)構(gòu)變異屬于DNA序列的變異,遺傳效應(yīng)更大,因此CNV作為一種新型的分子標記對蛋雞育種具有重要意義。本研究的目的是在雞基因組中篩選與蛋用性狀相關(guān)的CNVs并進一步研究其對蛋用性狀的影響機理。根據(jù)雞蛋用性狀相關(guān)數(shù)量性狀基因座(quantitative trait loci,QTLs)與已發(fā)表的CNV圖譜選擇候選CNVs位點,然后檢測其拷貝數(shù)變化,通過關(guān)聯(lián)分析鑒定影響雞蛋用性狀的CNVs,解釋這些CNVs對雞產(chǎn)蛋過程的影響,主要研究結(jié)果如下:(1)結(jié)合已發(fā)表的雞CNV圖譜及雞QTL數(shù)據(jù)庫選擇候選位點,每個位點設(shè)計兩個探針進行拷...

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【學位級別】：博士

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圖1-1結(jié)構(gòu)變異形成的四種機制（Bickhart&Liu,2014）

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圖1-3與雞CNV有關(guān)的表型（a）豆冠；（b）蝴蝶冠；（c）V型冠；（d）玫瑰冠；（e）黑褐色（尾呈黑色，胸呈褐色型；（f）絲毛烏骨雞。Fig.1-3CNV-relatedphenotypes(a)Peacomb;(b)Buttercupcomb;(c)....

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