為調(diào)查新疆部分地區(qū)規(guī)�；ｐB(yǎng)殖場牛病毒(BVDV)性腹瀉病毒的感染情況,本試驗采用RT-PCR方法對640份牛全血進行牛病毒性腹瀉病毒檢測,并對檢測基因序列進行分析及同源性比較。結(jié)果表明:各地區(qū)牛養(yǎng)殖場BVDV陽性檢出率為22.5%～62.5%,平均總陽性率為40.0%(256/640),不同年齡段牛群感染BVDV的平均陽性率為22.5%(27/120)。將目的片段克隆至T載體,經(jīng)測序獲得5株BVDV部分基因序列,與預(yù)期的大小一致為288 bp。根據(jù)同源性分析表明,本研究的5株克隆毒株序列之間的同源性為98.3%～99.7%。遺傳演化分析可知,本研究獲得的毒株在同一簇,與中國北京株BVDV1a亞型歸為同一簇,親緣關(guān)系比較接近,但與BVDV2型、BVDV3型的遺傳關(guān)系較遠。研究結(jié)果表明,新疆地區(qū)BVDV普遍存在,經(jīng)測序核苷酸序列之間的同源性較高,遺傳關(guān)系較接近,該結(jié)果為新疆地區(qū)牛病毒性腹瀉病毒病的防控工作奠定基礎(chǔ)。

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【部分圖文】：

圖2BVDV病原生態(tài)學(xué)地區(qū)分布

2期王龍等:新疆部分地區(qū)牛病毒性腹瀉病毒的分離、鑒定及分子流行病學(xué)調(diào)查2.3BVDV病原生態(tài)學(xué)地區(qū)分布通過繪制BVDV的病原生態(tài)學(xué)地區(qū)分布圖可知，五家渠、沙灣、奇臺、伊犁地區(qū)、阿克蘇地區(qū)、喀什地區(qū)、克拉瑪依市主要為BVDVⅠ型未知亞型，石河子市周邊為BVDV型未知亞型、BVDV1....

圖1BVDV的PCR檢測結(jié)果

對采集的13個地區(qū)規(guī)模化養(yǎng)牛場640份牛全血樣品進行基因檢測,凝膠電泳結(jié)果表明,陽性條帶大小與預(yù)期目的片段大小一致(288bp),結(jié)果見圖1。此次研究共檢測出BVDV陽性樣品256份,平均總陽性率為40.0%(256/640)。各地區(qū)均檢測到BVDV的存在,檢出率為22.5%～....

圖2BVDV核苷酸序列的同源性分析

測序結(jié)果表明,樣品基因片段大小為288bp。運用DNAMan、MegAlign軟件和NCBI,將本研究得到的5株BVDV核苷酸序列與國內(nèi)外17株BVDV基因序列進行同源性比較,發(fā)現(xiàn)獲得的5株BVDV核苷酸序列之間有較高的同源性為98.3%～99.7%,其中ChangJ-12和K....

圖3BVDV核苷酸序列的遺傳進化樹

運用MEGA6.0軟件將本研究所獲得的5株BVDV基因核苷酸序列與國內(nèi)外17株BVDV基因序列共同建立遺傳進化樹,見圖3。根據(jù)遺傳演化分析可知,本研究獲得的ChangJ-12、KT-02、SHZ-06、ALT-05、AKS-2處在同一分支,與中國株BVDV1a亞型歸為同一簇,....

本文編號：3955420