本試驗(yàn)利用PCR-SSCP技術(shù)分析了永昌甘農(nóng)新品種群羊、小尾寒羊、湖羊3個品種綿羊的MC4R、MRF4和PROP1基因的多態(tài)性突變位點(diǎn)，并運(yùn)用NCBI網(wǎng)站和ExPaSy等生物信息學(xué)在線工具分析各個基因編碼序列及其編碼氨基酸的理化性質(zhì)、結(jié)構(gòu)及功能，從而為綿羊生長發(fā)育性狀的分子標(biāo)記作輔助選擇以及分子育種提供基礎(chǔ)資料。結(jié)果如下： 1、在MC4R基因的3段基因片段中共發(fā)現(xiàn)4個多態(tài)性位點(diǎn)，分別是：C495T、G511A、C732G、G896C，其中C495T和G896C屬于同義突變，分別編碼Ser和Ala。G896C位點(diǎn)上，3個綿羊品種均發(fā)現(xiàn)了2個基因型，CC和CD。3個綿羊品種在該位點(diǎn)均處于低度多態(tài)性和Hardy-weinberg平衡狀態(tài)；C732G屬于種間突變，小尾寒羊?yàn)镚堿基，編碼Met，另外兩個品種均為C堿基，編碼Ile，經(jīng)蛋白質(zhì)的二級結(jié)構(gòu)預(yù)測顯示，該位點(diǎn)的氨基酸不同，導(dǎo)致該基因編碼蛋白質(zhì)的二級結(jié)構(gòu)也略有不同，由原來的51.5%的α螺旋、16.27%的β折疊和32.23%的無規(guī)則卷曲組成變?yōu)橛?1.2%的α螺旋、15.36%的β折疊和33.43%的無規(guī)則卷曲組成。在MC4R-3基因片段中...

【文章頁數(shù)】：71 頁

【學(xué)位級別】：碩士

【文章目錄】：
摘要
Summary
第一章 文獻(xiàn)綜述
    1. 養(yǎng)羊業(yè)概況
    2. 綿羊品種介紹
        2.1 湖羊
        2.2 小尾寒羊
        2.3 永昌甘農(nóng)新品種群羊
    3. 候選基因的研究進(jìn)展
        3.1 MC4R 基因
        3.2 MRF4 基因
        3.3 PROP1 基因
    4. 家畜分子遺傳標(biāo)記技術(shù)
        4.1 直接測序
        4.2 DNA 芯片
        4.3 單鏈構(gòu)象多態(tài)性
    5. 研究目的意義
第二章 實(shí)驗(yàn)研究
    實(shí)驗(yàn)一 MC4R 基因多態(tài)性及生物信息學(xué)分析
        1. 材料與方法
            1.1 試驗(yàn)試劑及藥品
            1.2 試驗(yàn)主要儀器設(shè)備
            1.3 主要試劑和溶液的配制
            1.4 樣本采集
            1.5 血液基因組 DNA 的提取及檢測
            1.6 基因組 DNA 濃度和純度檢測
            1.7 引物
            1.8 PCR 擴(kuò)增
            1.9 SSCP 分析
            1.10. 測序
            1.11. 數(shù)據(jù)統(tǒng)計(jì)及分析
                1.11.1 基因頻率和基因型頻率的計(jì)算
                1.11.2 多態(tài)信息含量
                1.11.3 純合度、雜合度和有效等位基因數(shù)
                1.11.4 Hardy-Weinberg 平衡檢測
                1.11.5 不同基因型在 3 個綿羊群體中分布的差異顯著性檢驗(yàn)
                1.11.6 生物信息學(xué)分析
        2. 結(jié)果
            2.1 DNA 的濃度和純度檢測
            2.2 PCR 擴(kuò)增結(jié)果
            2.3 SSCP 結(jié)果
            2.4 測序結(jié)果
            2.5 MC4R 基因的生物信息學(xué)分析結(jié)果
            2.6 MC4R 同源性比對
        3 討論
    實(shí)驗(yàn)二 PROP1 基因外顯子 1 多態(tài)性及生物信息學(xué)分析
        1. 材料與方法
            1.1 試驗(yàn)試劑及藥品
            1.2 試驗(yàn)主要儀器設(shè)備
            1.3 主要試劑和溶液的配制
            1.4 樣本采集
            1.5 血液基因組 DNA 的提取及檢測
            1.6 引物
            1.7 PCR 擴(kuò)增
            1.8 SSCP 分析
            1.9 生物信息學(xué)分析
        2. 結(jié)果
            2.1 DNA 的濃度和純度檢測
            2.2 PCR 擴(kuò)增結(jié)果
            2.3 SSCP 結(jié)果
            2.4 PROP1 基因的生物信息學(xué)分析結(jié)果
            2.5 PROP1 基因同源性比對
        3 討論
    實(shí)驗(yàn)三 MRF4 基因外顯子 1 多態(tài)性及生物信息學(xué)分析
        1. 材料與方法
            1.1 試驗(yàn)試劑及藥品
            1.2 試驗(yàn)主要儀器設(shè)備
            1.3 主要試劑和溶液的配制
            1.4 樣本采集
            1.5 血液基因組 DNA 的提取及檢測
            1.6 引物
            1.7 PCR 擴(kuò)增
            1.8 SSCP 分析
            1.9 測序
            1.10 數(shù)據(jù)統(tǒng)計(jì)及分析
        2. 結(jié)果與分析
            2.1 DNA 的濃度和純度檢測
            2.2 PCR 擴(kuò)增結(jié)果
            2.3 SSCP 結(jié)果
            2.4 測序結(jié)果
            2.5 MRF4 基因的生物信息學(xué)分析
            2.6 MRF4 同源性比對
        3 討論
結(jié)論
參考文獻(xiàn)
致謝
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本文編號：3870091