試驗(yàn)旨在利用全基因組關(guān)聯(lián)分析(GWAS)定位影響鴨胸肌肉色性狀的候選基因及分子標(biāo)記,探究肉色性狀的遺傳基礎(chǔ)。本研究中,共測(cè)定了555只北京鴨×野鴨F2代資源群體的3種胸肌肉色性狀(包括紅度a^*、黃度b^*、亮度L^*)。利用北京鴨×野鴨F2代資源群體胸肌肉色性狀數(shù)據(jù)并結(jié)合全基因組重測(cè)序數(shù)據(jù)進(jìn)行全基因組關(guān)聯(lián)分析,檢測(cè)影響胸肌肉色性狀的相關(guān)基因及可能的因果變異位點(diǎn)。結(jié)果顯示,肌肉亮度L^*、紅度a^*、黃度b^*均屬于低遺傳力性狀,遺傳力分別為0.23、0.12、0.13,且肌肉黃度b^*變異系數(shù)較大(26.18%)。通過(guò)相關(guān)性分析可知,肌肉黃度與紅度存在較強(qiáng)正表型相關(guān)(r=0.52),肌纖維直徑與肌肉黃度存在弱負(fù)相關(guān)性(r=-0.16)。利用混合線性模型進(jìn)行GWAS,發(fā)現(xiàn)了1個(gè)SNP與肌肉黃度b^*潛在顯著關(guān)聯(lián)(-log₁₀P=8.28)。對(duì)最高效應(yīng)SNP進(jìn)行連鎖不平衡檢驗(yàn),發(fā)現(xiàn)42個(gè)SNPs與最高點(diǎn)SNP...

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【文章目錄】：
1 材料與方法
    1.1 試驗(yàn)動(dòng)物及表型采集
    1.2 DNA、RNA提取及質(zhì)控
        1.2.1 DNA提取及質(zhì)控
        1.2.2 RNA提取及質(zhì)控
    1.3 統(tǒng)計(jì)分析
        1.3.1 相關(guān)性分析和基因表達(dá)熱圖
        1.3.2 遺傳力計(jì)算
        1.3.3 GWAS分析
        1.3.4 表達(dá)量分析
2 結(jié) 果
    2.1 表型值統(tǒng)計(jì)及遺傳力計(jì)算
    2.2 相關(guān)性分析
    2.3 GWAS分析
    2.4 候選基因分析
3 討 論
4 結(jié) 論



本文編號(hào)：3863788