雙峰駝PIGR和FCGRT的基因克
發(fā)布時(shí)間:2023-10-29 09:20
機(jī)體黏膜生態(tài)系統(tǒng)主要由黏膜和其表面的微生態(tài)系統(tǒng)構(gòu)成,是抵抗外界病原微生物入侵的第一道防線。pIgR和FcRn是黏膜生態(tài)系統(tǒng)中參與黏膜免疫應(yīng)答的重要效應(yīng)分子,能夠轉(zhuǎn)運(yùn)相應(yīng)抗體到黏膜表面,并能中和清除病原,以維持黏膜生態(tài)系統(tǒng)中正常的微生物菌群和生理環(huán)境。呼吸道、消化道和泌尿生殖道等器官的多種細(xì)胞能夠合成pIgR和FcRn,并在特定部位參與黏膜免疫應(yīng)答。扁桃體(包括腭扁桃體、咽扁桃體、舌扁桃體、軟腭扁桃體、會(huì)厭扁桃體、咽鼓管扁桃體)在不同動(dòng)物呼吸道中的存在情況不同,并且作為重要的黏膜相關(guān)淋巴組織(Mucosa-associated lymphoid tissues,MALT)在呼吸道黏膜免疫和整個(gè)黏膜免疫系統(tǒng)中發(fā)揮著重要的作用。以上6種扁桃體在雙峰駝中均存在。為了確定pIgR和FcRn在雙峰駝各扁桃體中的表達(dá)和分布特點(diǎn)以及兩種受體在局部黏膜免疫中的生物學(xué)功能,同時(shí)為進(jìn)一步探究?jī)煞N受體在雙峰駝和其他動(dòng)物體內(nèi)的生物學(xué)功能有無物種間差異。本文以6峰健康成年(616歲)阿拉善雙峰駝為研究對(duì)象,借助生物信息學(xué)分析對(duì)雙峰駝pIgR和FcRnα鏈的相關(guān)生物信息學(xué)特性加以分析;克隆得到...
【文章頁數(shù)】:145 頁
【學(xué)位級(jí)別】:博士
【文章目錄】:
摘要
SUMMARY
英文縮略詞表
第一部分 文獻(xiàn)綜述
第一章 黏膜免疫系統(tǒng)概述
1 黏膜免疫系統(tǒng)的構(gòu)成形式
2 黏膜免疫系統(tǒng)的作用機(jī)制
2.1 黏膜免疫系統(tǒng)的抗原攝取和抗原遞呈
2.2 黏膜免疫系統(tǒng)的免疫應(yīng)答機(jī)制
3 黏膜免疫耐受機(jī)制
第二章 pIgR和FcRn在黏膜免疫系統(tǒng)中的作用
1 pIgR和FcRn概述
2 pIgR的生物學(xué)特性
2.1 pIgR的組成結(jié)構(gòu)
2.2 PIGR基因的定位和結(jié)構(gòu)
2.3 pIgR的主要功能
2.4 pIgR的組織表達(dá)特點(diǎn)
2.5 pIgR的表達(dá)調(diào)控
3 FcRn的生物學(xué)特性
3.1 FcRn的組成結(jié)構(gòu)
3.2 FCGRT基因的結(jié)構(gòu)與定位
3.3 FcRn的主要功能
3.4 FcRn的組織表達(dá)特點(diǎn)
3.5 FcRn的表達(dá)調(diào)控
第三章 扁桃體的構(gòu)成和功能
1 扁桃體的種類
1.1 腭扁桃體
1.2 舌扁桃體
1.3 咽扁桃體
1.4 軟腭扁桃體
1.5 會(huì)厭扁桃體
1.6 咽鼓管扁桃體
2 扁桃體對(duì)機(jī)體的重要保護(hù)作用
3 雙峰駝在免疫方面的特殊性及其扁桃體相關(guān)研究
第二部分 實(shí)驗(yàn)研究
第一章 雙峰駝FCGRT和PIGR的基因克隆及相關(guān)生物信息學(xué)分析
1 材料與方法
1.1 材料
1.1.1 主要儀器設(shè)備
1.1.2 主要試劑
1.1.3 引物合成
1.2 方法
1.2.1 總RNA的提取
1.2.2 去除基因組DNA
1.2.3 合成c DNA第一鏈
1.2.4 擴(kuò)增及基因片段的回收
1.2.5 回收片段加A并回收
1.2.6 連接p MD18-T
1.2.7 DH5a感受態(tài)細(xì)胞的制備
1.2.8 轉(zhuǎn)化感受態(tài)細(xì)胞
1.2.9 陽性克隆的鑒定和測(cè)序
1.3 生物信息學(xué)分析
1.3.1 理化性質(zhì)
1.3.2 亞細(xì)胞定位分析
1.3.3 跨膜情況預(yù)測(cè)
1.3.4 信號(hào)肽預(yù)測(cè)
1.3.5 磷酸化位點(diǎn)預(yù)測(cè)
1.3.6 一級(jí)結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè)
1.3.7 二級(jí)結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè)
1.3.8 三維結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè)
1.3.9 序列同源性分析
1.3.10 進(jìn)化分析
2 實(shí)驗(yàn)結(jié)果
2.1 總RNA的抽提
2.2 目的基因的PCR擴(kuò)增
2.3 重組質(zhì)粒的菌液PCR鑒定
2.4 克隆所得雙峰駝FcRn α 鏈和pIgR CDS區(qū)的序列信息
2.4.1 FCGRT α 鏈CDS區(qū)序列
2.4.2 PIGR CDS區(qū)序列
2.5 雙峰駝FcRnα鏈和pIgR的理化性質(zhì)與亞細(xì)胞定位分析
2.6 雙峰駝FcRnα鏈和pIgR跨膜情況預(yù)測(cè)
2.7 雙峰駝FcRnα鏈和pIgR信號(hào)肽預(yù)測(cè)
2.8 雙峰駝FcRnα鏈和pIgR磷酸化位點(diǎn)預(yù)測(cè)
2.9 雙峰駝FcRnα鏈和pIgR一級(jí)結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè)
2.10 雙峰駝FcRnα鏈和pIgR二級(jí)結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè)
2.11 雙峰駝FcRnα鏈和pIgR三維結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè)
2.12 克隆所得雙峰駝FcRnα鏈和pIgR CDS區(qū)的同源性分析
2.13 克隆所得雙峰駝FcRnα鏈和pIgR的進(jìn)化樹構(gòu)建
3 討論
3.1 亞細(xì)胞定位
3.2 一級(jí)結(jié)構(gòu)
3.3 二級(jí)結(jié)構(gòu)
3.4 三級(jí)結(jié)構(gòu)
3.5 同源性分析
4 小結(jié)
第二章 PIGR和FCGRT在雙峰駝扁桃體中的表達(dá)特點(diǎn)及其與黏膜免疫的關(guān)系
1 材料方法
1.1 主要試劑
1.2 主要儀器
1.3 主要耗材
2 實(shí)驗(yàn)方法
2.1 RNA提取
2.2 逆轉(zhuǎn)錄
2.2.1 總RNA中基因組DNA的去除
2.2.2 逆轉(zhuǎn)錄
2.2.3 c DNA的稀釋與保存
2.3 熒光定量PCR檢測(cè)
2.3.1 引物合成
2.3.2 PCR反應(yīng)體系的配制
2.3.3 熒光定量PCR循環(huán)條件
3 結(jié)果
3.1 雙峰駝扁桃體總RNA的提取
3.2 FCGRT在雙峰駝扁桃體中的表達(dá)情況
3.3 PIGR在雙峰駝扁桃體中的表達(dá)情況
4 討論
5 小結(jié)
第三章 成年雙峰駝扁桃體中pIgR和FcRn的細(xì)胞分布及其與黏膜免疫的關(guān)系
實(shí)驗(yàn)一 成年雙峰駝扁桃體中pIgR的細(xì)胞分布及其與黏膜免疫的關(guān)系
1 材料與方法
1.1 材料
1.1.1 實(shí)驗(yàn)動(dòng)物
1.1.2 藥品與試劑
1.1.3 主要儀器設(shè)備
1.2 方法
1.2.1 樣品采集
1.2.2 石蠟切片
1.2.3 間接免疫組織化學(xué)(SABC)染色
1.2.4 數(shù)據(jù)的獲取及分析
2 結(jié)果
2.1 同一器官不同區(qū)域pIgR陽性細(xì)胞密度的比較
2.2 不同器官同一區(qū)域pIgR陽性細(xì)胞密度的比較
2.2.1 濾泡區(qū)
2.2.2 濾泡間區(qū)
2.2.3 上皮下區(qū)
2.2.4 網(wǎng)狀上皮下區(qū)
2.2.5 腺體周圍區(qū)
3 討論
4.小結(jié)
實(shí)驗(yàn)二 成年雙峰駝扁桃體中FcRn的細(xì)胞分布及其與黏膜免疫的關(guān)系
1 材料與方法
2 結(jié)果
2.1 同一器官不同區(qū)域FcRn陽性細(xì)胞密度的比較
2.2 不同器官同一區(qū)域FcRn陽性細(xì)胞密度的比較
2.2.1 濾泡區(qū)
2.2.2 濾泡間區(qū)
2.2.3 網(wǎng)狀上皮下區(qū)
2.2.4 腺體周圍區(qū)
2.2.5 上皮下區(qū)
3 討論
4 小結(jié)
實(shí)驗(yàn)三 成年雙峰駝扁桃體同部位pIgR和FcRn陽性細(xì)胞的分布及其與黏膜免疫的關(guān)系
1 材料與方法
2 結(jié)果
2.1 同器官同區(qū)域pIgR和FcRn陽性細(xì)胞密度比較
2.1.1 腭扁桃體
2.1.2 咽扁桃體
2.1.3 會(huì)厭扁桃體
2.1.4 軟腭扁桃體
2.1.5 咽鼓管扁桃體
2.1.6 舌扁桃體
3 討論
4 小結(jié)
第三部分 全文結(jié)論
參考文獻(xiàn)
致謝
作者簡(jiǎn)介
導(dǎo)師簡(jiǎn)介
本文編號(hào):3857783
【文章頁數(shù)】:145 頁
【學(xué)位級(jí)別】:博士
【文章目錄】:
摘要
SUMMARY
英文縮略詞表
第一部分 文獻(xiàn)綜述
第一章 黏膜免疫系統(tǒng)概述
1 黏膜免疫系統(tǒng)的構(gòu)成形式
2 黏膜免疫系統(tǒng)的作用機(jī)制
2.1 黏膜免疫系統(tǒng)的抗原攝取和抗原遞呈
2.2 黏膜免疫系統(tǒng)的免疫應(yīng)答機(jī)制
3 黏膜免疫耐受機(jī)制
第二章 pIgR和FcRn在黏膜免疫系統(tǒng)中的作用
1 pIgR和FcRn概述
2 pIgR的生物學(xué)特性
2.1 pIgR的組成結(jié)構(gòu)
2.2 PIGR基因的定位和結(jié)構(gòu)
2.3 pIgR的主要功能
2.4 pIgR的組織表達(dá)特點(diǎn)
2.5 pIgR的表達(dá)調(diào)控
3 FcRn的生物學(xué)特性
3.1 FcRn的組成結(jié)構(gòu)
3.2 FCGRT基因的結(jié)構(gòu)與定位
3.3 FcRn的主要功能
3.4 FcRn的組織表達(dá)特點(diǎn)
3.5 FcRn的表達(dá)調(diào)控
第三章 扁桃體的構(gòu)成和功能
1 扁桃體的種類
1.1 腭扁桃體
1.2 舌扁桃體
1.3 咽扁桃體
1.4 軟腭扁桃體
1.5 會(huì)厭扁桃體
1.6 咽鼓管扁桃體
2 扁桃體對(duì)機(jī)體的重要保護(hù)作用
3 雙峰駝在免疫方面的特殊性及其扁桃體相關(guān)研究
第二部分 實(shí)驗(yàn)研究
第一章 雙峰駝FCGRT和PIGR的基因克隆及相關(guān)生物信息學(xué)分析
1 材料與方法
1.1 材料
1.1.1 主要儀器設(shè)備
1.1.2 主要試劑
1.1.3 引物合成
1.2 方法
1.2.1 總RNA的提取
1.2.2 去除基因組DNA
1.2.3 合成c DNA第一鏈
1.2.4 擴(kuò)增及基因片段的回收
1.2.5 回收片段加A并回收
1.2.6 連接p MD18-T
1.2.7 DH5a感受態(tài)細(xì)胞的制備
1.2.8 轉(zhuǎn)化感受態(tài)細(xì)胞
1.2.9 陽性克隆的鑒定和測(cè)序
1.3 生物信息學(xué)分析
1.3.1 理化性質(zhì)
1.3.2 亞細(xì)胞定位分析
1.3.3 跨膜情況預(yù)測(cè)
1.3.4 信號(hào)肽預(yù)測(cè)
1.3.5 磷酸化位點(diǎn)預(yù)測(cè)
1.3.6 一級(jí)結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè)
1.3.7 二級(jí)結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè)
1.3.8 三維結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè)
1.3.9 序列同源性分析
1.3.10 進(jìn)化分析
2 實(shí)驗(yàn)結(jié)果
2.1 總RNA的抽提
2.2 目的基因的PCR擴(kuò)增
2.3 重組質(zhì)粒的菌液PCR鑒定
2.4 克隆所得雙峰駝FcRn α 鏈和pIgR CDS區(qū)的序列信息
2.4.1 FCGRT α 鏈CDS區(qū)序列
2.4.2 PIGR CDS區(qū)序列
2.5 雙峰駝FcRnα鏈和pIgR的理化性質(zhì)與亞細(xì)胞定位分析
2.6 雙峰駝FcRnα鏈和pIgR跨膜情況預(yù)測(cè)
2.7 雙峰駝FcRnα鏈和pIgR信號(hào)肽預(yù)測(cè)
2.8 雙峰駝FcRnα鏈和pIgR磷酸化位點(diǎn)預(yù)測(cè)
2.9 雙峰駝FcRnα鏈和pIgR一級(jí)結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè)
2.10 雙峰駝FcRnα鏈和pIgR二級(jí)結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè)
2.11 雙峰駝FcRnα鏈和pIgR三維結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè)
2.12 克隆所得雙峰駝FcRnα鏈和pIgR CDS區(qū)的同源性分析
2.13 克隆所得雙峰駝FcRnα鏈和pIgR的進(jìn)化樹構(gòu)建
3 討論
3.1 亞細(xì)胞定位
3.2 一級(jí)結(jié)構(gòu)
3.3 二級(jí)結(jié)構(gòu)
3.4 三級(jí)結(jié)構(gòu)
3.5 同源性分析
4 小結(jié)
第二章 PIGR和FCGRT在雙峰駝扁桃體中的表達(dá)特點(diǎn)及其與黏膜免疫的關(guān)系
1 材料方法
1.1 主要試劑
1.2 主要儀器
1.3 主要耗材
2 實(shí)驗(yàn)方法
2.1 RNA提取
2.2 逆轉(zhuǎn)錄
2.2.1 總RNA中基因組DNA的去除
2.2.2 逆轉(zhuǎn)錄
2.2.3 c DNA的稀釋與保存
2.3 熒光定量PCR檢測(cè)
2.3.1 引物合成
2.3.2 PCR反應(yīng)體系的配制
2.3.3 熒光定量PCR循環(huán)條件
3 結(jié)果
3.1 雙峰駝扁桃體總RNA的提取
3.2 FCGRT在雙峰駝扁桃體中的表達(dá)情況
3.3 PIGR在雙峰駝扁桃體中的表達(dá)情況
4 討論
5 小結(jié)
第三章 成年雙峰駝扁桃體中pIgR和FcRn的細(xì)胞分布及其與黏膜免疫的關(guān)系
實(shí)驗(yàn)一 成年雙峰駝扁桃體中pIgR的細(xì)胞分布及其與黏膜免疫的關(guān)系
1 材料與方法
1.1 材料
1.1.1 實(shí)驗(yàn)動(dòng)物
1.1.2 藥品與試劑
1.1.3 主要儀器設(shè)備
1.2 方法
1.2.1 樣品采集
1.2.2 石蠟切片
1.2.3 間接免疫組織化學(xué)(SABC)染色
1.2.4 數(shù)據(jù)的獲取及分析
2 結(jié)果
2.1 同一器官不同區(qū)域pIgR陽性細(xì)胞密度的比較
2.2 不同器官同一區(qū)域pIgR陽性細(xì)胞密度的比較
2.2.1 濾泡區(qū)
2.2.2 濾泡間區(qū)
2.2.3 上皮下區(qū)
2.2.4 網(wǎng)狀上皮下區(qū)
2.2.5 腺體周圍區(qū)
3 討論
4.小結(jié)
實(shí)驗(yàn)二 成年雙峰駝扁桃體中FcRn的細(xì)胞分布及其與黏膜免疫的關(guān)系
1 材料與方法
2 結(jié)果
2.1 同一器官不同區(qū)域FcRn陽性細(xì)胞密度的比較
2.2 不同器官同一區(qū)域FcRn陽性細(xì)胞密度的比較
2.2.1 濾泡區(qū)
2.2.2 濾泡間區(qū)
2.2.3 網(wǎng)狀上皮下區(qū)
2.2.4 腺體周圍區(qū)
2.2.5 上皮下區(qū)
3 討論
4 小結(jié)
實(shí)驗(yàn)三 成年雙峰駝扁桃體同部位pIgR和FcRn陽性細(xì)胞的分布及其與黏膜免疫的關(guān)系
1 材料與方法
2 結(jié)果
2.1 同器官同區(qū)域pIgR和FcRn陽性細(xì)胞密度比較
2.1.1 腭扁桃體
2.1.2 咽扁桃體
2.1.3 會(huì)厭扁桃體
2.1.4 軟腭扁桃體
2.1.5 咽鼓管扁桃體
2.1.6 舌扁桃體
3 討論
4 小結(jié)
第三部分 全文結(jié)論
參考文獻(xiàn)
致謝
作者簡(jiǎn)介
導(dǎo)師簡(jiǎn)介
本文編號(hào):3857783
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