金絲猴毛首線蟲線粒體cox1基因序列分析
發(fā)布時間:2023-10-06 13:36
為闡明金絲猴毛首線蟲線粒體細胞色素c氧化酶Ⅰ亞基(cox1)基因部分(pcox1)序列的遺傳變異情況,以長沙生態(tài)動物園金絲猴體內(nèi)分離的毛首線蟲作為研究對象,根據(jù)cox1序列構(gòu)建其與其他毛首線蟲的進化發(fā)育關(guān)系。使用PCR方法擴增金絲猴毛首線蟲線粒體cox1,然后將所測得的序列應用Clustal X 1.81程序進行比對,最后用Mega 5.0程序NJ法繪制種系發(fā)育樹。結(jié)果顯示,本實驗擴增獲得的6條毛首線蟲分離株cox1序列長度一致,均為411 bp,種內(nèi)變異為0。種系發(fā)育分析結(jié)果表明,這6條毛首線蟲分離株位于同一分支。鑒于金絲猴毛首線蟲的cox1基因種內(nèi)保守,而種間差異大(24.0%~34.1%),因此可以作為種間鑒定檢測研究的遺傳標記。本研究結(jié)果為進一步研究金絲猴毛首線蟲的群體遺傳結(jié)構(gòu)奠定了基礎(chǔ)。
【文章頁數(shù)】:4 頁
【文章目錄】:
1 材料與方法
1.1 蟲體樣品
1.2 主要試劑
1.3 樣品DNA制備
1.4 PCR擴增pcox1基因
1.5 pcox1基因序列測定及系統(tǒng)發(fā)育樹構(gòu)建
2 結(jié)果與分析
2.1 形態(tài)學檢查
2.2 PCR擴增
2.3 測序及分析
2.4 cox1基因序列系統(tǒng)發(fā)生樹
3討論
本文編號:3851798
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1 材料與方法
1.1 蟲體樣品
1.2 主要試劑
1.3 樣品DNA制備
1.4 PCR擴增pcox1基因
1.5 pcox1基因序列測定及系統(tǒng)發(fā)育樹構(gòu)建
2 結(jié)果與分析
2.1 形態(tài)學檢查
2.2 PCR擴增
2.3 測序及分析
2.4 cox1基因序列系統(tǒng)發(fā)生樹
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