肢蹄軟弱一直困擾我國的養(yǎng)豬業(yè)。肢蹄軟弱會(huì)造成豬只跛行、臥地不起，嚴(yán)重地影響豬正常的生長發(fā)育。每年因肢蹄軟弱淘汰的種豬數(shù)目非常大，給養(yǎng)豬業(yè)造成巨大經(jīng)濟(jì)損失，同時(shí)也降低了豬的福利。此外，研究豬肢蹄結(jié)實(shí)度能為人類四肢健康的研究提供借鑒。因此，研究豬肢蹄結(jié)實(shí)度不僅具有經(jīng)濟(jì)價(jià)值，而且具有重要的科學(xué)意義。 國內(nèi)外研究結(jié)果顯示肢蹄結(jié)實(shí)度的發(fā)生病因復(fù)雜多樣，有品種、病原體感染、營養(yǎng)水平、人為選育及環(huán)境因素等，但多數(shù)學(xué)者認(rèn)為肢蹄結(jié)實(shí)度與遺傳密切相關(guān)。目前，對(duì)豬肢蹄結(jié)實(shí)度的遺傳解析還不是很深入，只有幾篇QTL定位及GWAS報(bào)道。本實(shí)驗(yàn)室對(duì)自己構(gòu)建的白色杜洛克×二花臉資源家系進(jìn)行全基因組掃描，定位了16個(gè)基因組1%顯著水平影響肢蹄結(jié)實(shí)度的QTL，其中7號(hào)染色體上的QTL效應(yīng)最強(qiáng)，且影響多個(gè)肢蹄結(jié)實(shí)度相關(guān)的性狀。利用豬60K SNP芯片，對(duì)F2和蘇太群體進(jìn)行基因型檢測，通過全基因組關(guān)聯(lián)分析，把7號(hào)染色體上的QTL精細(xì)定位到一個(gè)2.15Mb的區(qū)域內(nèi)。 本研究在上述研究的基礎(chǔ)上，通過對(duì)7號(hào)染色體上2.15Mb的區(qū)域內(nèi)基因功能的分析，篩選出位于QTL峰值區(qū)域的三個(gè)基因HMGA1、 C6orf106和ENSSSCG0...

【文章頁數(shù)】：51 頁

【學(xué)位級(jí)別】：碩士

【文章目錄】：
摘要
ABSTRACT
第一章 文獻(xiàn)綜述
    1 引言
    2 肢蹄結(jié)實(shí)度
        2.1 肢蹄結(jié)實(shí)度的定義
        2.2 肢蹄軟弱的危害
            2.2.1 肢蹄軟弱給種豬帶來的危害
            2.2.2 肢蹄軟弱給商品豬帶來的危害
        2.3 影響肢蹄結(jié)實(shí)度因素
            2.3.1 品種和人為選育
            2.3.2 疾病
            2.3.3 繁殖因素
            2.3.4 營養(yǎng)因素
            2.3.5 飼養(yǎng)管理方式
            2.3.6 運(yùn)動(dòng)缺乏
        2.4 肢蹄結(jié)實(shí)度的遺傳力
        2.5 肢蹄結(jié)實(shí)度的評(píng)估手段
    3 軟骨病
        3.1 軟骨病的簡介
        3.2 軟骨病的生理生化
        3.3 肢蹄軟弱和軟骨病相關(guān)性研究
        3.4 軟骨病的評(píng)定方法
        3.5 軟骨病的研究進(jìn)展
    4 肢蹄結(jié)實(shí)度的研究進(jìn)展
        4.1 QTL 定位結(jié)果
        4.2 全基因組關(guān)聯(lián)分析的研究結(jié)果
        4.3 候選基因法的研究
    5 基因型填補(bǔ)
        5.1 基因型填補(bǔ)的主要作用
        5.2 基因型填補(bǔ)的主要原理
        5.3 基因型填補(bǔ)的在其他物種中的主要運(yùn)用
    6 候選基因法的原理
    7 軟骨發(fā)育調(diào)節(jié)通路
    8 本研究的前期工作基礎(chǔ)
        8.1 QTL 定位結(jié)果
        8.2 全基因組關(guān)聯(lián)分析結(jié)果
        8.3 2.15 Mb 中的候選基因介紹
            8.3.1 HMGA1 基因的研究進(jìn)展
            8.3.2 C6orf106 基因的研究進(jìn)展
            8.3.3 ENSSSCG00000023160 基因的研究進(jìn)展
    9 本研究的目的
    參考文獻(xiàn)
第二章 實(shí)驗(yàn)內(nèi)容
    1 實(shí)驗(yàn)材料和方法
        1.1 實(shí)驗(yàn)材料
            1.1.1 資源群體
            1.1.2 蘇太群體
            1.1.3 杜長大商業(yè)群體
        1.2 表型性狀測定
        1.3 DNA 的提取
        1.4 候選基因多態(tài)位點(diǎn)的搜尋
            1.4.1 引物設(shè)計(jì)
            1.4.2 PCR 擴(kuò)增
            1.4.3 測序
            1.4.4 多態(tài)位點(diǎn)的鑒別
        1.5 基因多態(tài)位點(diǎn)基因型判定
            1.5.1 C6orf106 基因
            1.5.2 HMGA1 基因
    2 統(tǒng)計(jì)分析方法
        2.1 基因型填補(bǔ)
            2.1.1 ENSSSCG00000023160 基因型填補(bǔ)
            2.1.2 基因型填補(bǔ)準(zhǔn)確性評(píng)估
        2.2 簡單統(tǒng)計(jì)量的計(jì)算
        2.3 關(guān)聯(lián)分析模型的確定
        2.4 關(guān)聯(lián)分析
    3 實(shí)驗(yàn)結(jié)果
        3.1 多態(tài)位點(diǎn)搜尋結(jié)果
            3.1.1 C6orf106 基因
            3.1.2 ENSSSCG00000023160 基因
        3.2 肢蹄結(jié)實(shí)度相關(guān)性狀的簡單統(tǒng)計(jì)量
        3.3 C6orf106 基因與關(guān)節(jié)和蹄趾評(píng)分關(guān)聯(lián)分析結(jié)果
        3.4 11 個(gè)多態(tài)位點(diǎn)與肱二頭肌長度和重量關(guān)聯(lián)分析結(jié)果
        3.5 11 個(gè)多態(tài)位點(diǎn)與肢步態(tài)評(píng)分關(guān)聯(lián)分析結(jié)果
        3.6 11 個(gè)多態(tài)位點(diǎn)與肢蹄評(píng)分關(guān)聯(lián)分析結(jié)果
    4 討論
        4.1 杜長大商品豬表型性狀分析
        4.2 基因型檢測位點(diǎn)的篩選
            4.2.1 HMGA1 基因
            4.2.2 C6orf106 基因
            4.2.3 ENSSSCG00000023160 基因
        4.3 基因填補(bǔ)
            4.3.1 基因填補(bǔ)的準(zhǔn)確性
            4.3.2 基因填補(bǔ)程序的選擇
        4.4 關(guān)聯(lián)分析的臨界值
        4.5 關(guān)聯(lián)分析結(jié)果討論
            4.5.1 HMGA1 基因
            4.5.2 C6orf106 基因
            4.5.3 ENSSSCG00000023160 基因
    小結(jié)
    參考文獻(xiàn)
附錄
論文發(fā)表情況
致謝



本文編號(hào)：3830031