肢蹄軟弱一直困擾我國的養(yǎng)豬業(yè)。肢蹄軟弱會造成豬只跛行、臥地不起，嚴重地影響豬正常的生長發(fā)育。每年因肢蹄軟弱淘汰的種豬數(shù)目非常大，給養(yǎng)豬業(yè)造成巨大經(jīng)濟損失，同時也降低了豬的福利。此外，研究豬肢蹄結(jié)實度能為人類四肢健康的研究提供借鑒。因此，研究豬肢蹄結(jié)實度不僅具有經(jīng)濟價值，而且具有重要的科學意義。 國內(nèi)外研究結(jié)果顯示肢蹄結(jié)實度的發(fā)生病因復雜多樣，有品種、病原體感染、營養(yǎng)水平、人為選育及環(huán)境因素等，但多數(shù)學者認為肢蹄結(jié)實度與遺傳密切相關。目前，對豬肢蹄結(jié)實度的遺傳解析還不是很深入，只有幾篇QTL定位及GWAS報道。本實驗室對自己構(gòu)建的白色杜洛克×二花臉資源家系進行全基因組掃描，定位了16個基因組1%顯著水平影響肢蹄結(jié)實度的QTL，其中7號染色體上的QTL效應最強，且影響多個肢蹄結(jié)實度相關的性狀。利用豬60K SNP芯片，對F2和蘇太群體進行基因型檢測，通過全基因組關聯(lián)分析，把7號染色體上的QTL精細定位到一個2.15Mb的區(qū)域內(nèi)。 本研究在上述研究的基礎上，通過對7號染色體上2.15Mb的區(qū)域內(nèi)基因功能的分析，篩選出位于QTL峰值區(qū)域的三個基因HMGA1、 C6orf106和ENSSSCG0...

【文章頁數(shù)】：51 頁

【學位級別】：碩士

【文章目錄】：
摘要
ABSTRACT
第一章 文獻綜述
    1 引言
    2 肢蹄結(jié)實度
        2.1 肢蹄結(jié)實度的定義
        2.2 肢蹄軟弱的危害
            2.2.1 肢蹄軟弱給種豬帶來的危害
            2.2.2 肢蹄軟弱給商品豬帶來的危害
        2.3 影響肢蹄結(jié)實度因素
            2.3.1 品種和人為選育
            2.3.2 疾病
            2.3.3 繁殖因素
            2.3.4 營養(yǎng)因素
            2.3.5 飼養(yǎng)管理方式
            2.3.6 運動缺乏
        2.4 肢蹄結(jié)實度的遺傳力
        2.5 肢蹄結(jié)實度的評估手段
    3 軟骨病
        3.1 軟骨病的簡介
        3.2 軟骨病的生理生化
        3.3 肢蹄軟弱和軟骨病相關性研究
        3.4 軟骨病的評定方法
        3.5 軟骨病的研究進展
    4 肢蹄結(jié)實度的研究進展
        4.1 QTL 定位結(jié)果
        4.2 全基因組關聯(lián)分析的研究結(jié)果
        4.3 候選基因法的研究
    5 基因型填補
        5.1 基因型填補的主要作用
        5.2 基因型填補的主要原理
        5.3 基因型填補的在其他物種中的主要運用
    6 候選基因法的原理
    7 軟骨發(fā)育調(diào)節(jié)通路
    8 本研究的前期工作基礎
        8.1 QTL 定位結(jié)果
        8.2 全基因組關聯(lián)分析結(jié)果
        8.3 2.15 Mb 中的候選基因介紹
            8.3.1 HMGA1 基因的研究進展
            8.3.2 C6orf106 基因的研究進展
            8.3.3 ENSSSCG00000023160 基因的研究進展
    9 本研究的目的
    參考文獻
第二章 實驗內(nèi)容
    1 實驗材料和方法
        1.1 實驗材料
            1.1.1 資源群體
            1.1.2 蘇太群體
            1.1.3 杜長大商業(yè)群體
        1.2 表型性狀測定
        1.3 DNA 的提取
        1.4 候選基因多態(tài)位點的搜尋
            1.4.1 引物設計
            1.4.2 PCR 擴增
            1.4.3 測序
            1.4.4 多態(tài)位點的鑒別
        1.5 基因多態(tài)位點基因型判定
            1.5.1 C6orf106 基因
            1.5.2 HMGA1 基因
    2 統(tǒng)計分析方法
        2.1 基因型填補
            2.1.1 ENSSSCG00000023160 基因型填補
            2.1.2 基因型填補準確性評估
        2.2 簡單統(tǒng)計量的計算
        2.3 關聯(lián)分析模型的確定
        2.4 關聯(lián)分析
    3 實驗結(jié)果
        3.1 多態(tài)位點搜尋結(jié)果
            3.1.1 C6orf106 基因
            3.1.2 ENSSSCG00000023160 基因
        3.2 肢蹄結(jié)實度相關性狀的簡單統(tǒng)計量
        3.3 C6orf106 基因與關節(jié)和蹄趾評分關聯(lián)分析結(jié)果
        3.4 11 個多態(tài)位點與肱二頭肌長度和重量關聯(lián)分析結(jié)果
        3.5 11 個多態(tài)位點與肢步態(tài)評分關聯(lián)分析結(jié)果
        3.6 11 個多態(tài)位點與肢蹄評分關聯(lián)分析結(jié)果
    4 討論
        4.1 杜長大商品豬表型性狀分析
        4.2 基因型檢測位點的篩選
            4.2.1 HMGA1 基因
            4.2.2 C6orf106 基因
            4.2.3 ENSSSCG00000023160 基因
        4.3 基因填補
            4.3.1 基因填補的準確性
            4.3.2 基因填補程序的選擇
        4.4 關聯(lián)分析的臨界值
        4.5 關聯(lián)分析結(jié)果討論
            4.5.1 HMGA1 基因
            4.5.2 C6orf106 基因
            4.5.3 ENSSSCG00000023160 基因
    小結(jié)
    參考文獻
附錄
論文發(fā)表情況
致謝



本文編號：3830031