復(fù)合抗菌肽“態(tài)康利!睂(duì)山羊瘤胃纖毛蟲種群結(jié)構(gòu)及常見纖毛蟲數(shù)量的影響
發(fā)布時(shí)間:2023-06-01 04:47
抗菌肽由于其廣譜抗菌活性,不易產(chǎn)生耐藥性等特性而倍受關(guān)注,開發(fā)為新型飼料添加劑,已應(yīng)用于豬、禽等動(dòng)物,但在反芻動(dòng)物的應(yīng)用研究還鮮有報(bào)道。本研究運(yùn)用高通量測(cè)序技術(shù)與實(shí)時(shí)熒光定量PCR技術(shù)比較分析復(fù)合抗菌肽“態(tài)康利!睂(duì)山羊瘤胃纖毛蟲群落結(jié)構(gòu)及常見纖毛蟲數(shù)量的影響及其與精料量的關(guān)系,為復(fù)合抗菌肽“態(tài)康利!弊鳛轱暳咸砑觿⿷(yīng)用于反芻動(dòng)物提供理論依據(jù)。試驗(yàn)選取24只4月齡體重相近(16.17±0.72)kg臨床健康雄性川中黑山羊,隨機(jī)分為4組,每組6只。Ⅰ組(正常精料組)飼喂正常量精料300 g·d-1·goat-1,Ⅱ組(正常量精料+抗菌肽組)飼喂正常量精料+態(tài)康利保3 g·d-1·goat-1,Ⅲ組(雙倍精料組)飼喂精料600 g·d-1·goat-1;Ⅳ組(雙倍精料+抗菌肽組)飼喂雙倍精料+態(tài)康利保3g·d-1·goat-1,連續(xù)飼喂60 d。于試驗(yàn)第0 d,20 d和60 d每組隨機(jī)選取3只山羊采集瘤胃液樣品50...
【文章頁數(shù)】:66 頁
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【文章目錄】:
摘要
ABSTRACT
英文縮寫詞表
第一章 文獻(xiàn)綜述
1.1 抗菌肽研究進(jìn)展
1.1.1 抗菌肽簡介
1.1.2 抗菌肽廣譜抗微生物作用
1.1.3 抗菌肽作為飼料添加劑的研究現(xiàn)狀
1.1.4 抗菌肽作為飼料添加劑對(duì)腸道菌群的影響
1.2 瘤胃纖毛蟲研究進(jìn)展
1.2.1 瘤胃纖毛蟲簡介
1.2.2 瘤胃纖毛蟲生物學(xué)意義
1.2.3 瘤胃纖毛蟲種群結(jié)構(gòu)研究進(jìn)展
1.2.4 分子生物學(xué)手段在瘤胃微生物研究中的應(yīng)用
1.3 研究目的及意義
第二章 復(fù)合抗菌肽對(duì)山羊瘤胃纖毛蟲種群結(jié)構(gòu)的影響
2.1 試驗(yàn)材料與動(dòng)物
2.1.1 試驗(yàn)藥品
2.1.2 試驗(yàn)儀器與試劑
2.1.3 試驗(yàn)動(dòng)物
2.2 試驗(yàn)方法
2.2.1 試驗(yàn)動(dòng)物的飼養(yǎng)管理
2.2.2 試驗(yàn)動(dòng)物的分組及處理
2.2.3 瘤胃液的采集和基因組DNA的提取
2.2.4 18S rDNA的擴(kuò)增及MiSeq測(cè)序
2.2.5 數(shù)據(jù)分析
2.3 結(jié)果
2.3.1 瘤胃細(xì)菌總DNA提取結(jié)果
2.3.2 樣品測(cè)序深度
2.3.3 Alpha多樣性分析
2.3.4 Beta多樣性分析
2.3.5 纖毛蟲種群結(jié)構(gòu)分析
2.4 討論
2.4.1 多樣性分析
2.4.2 復(fù)合抗菌肽對(duì)纖毛蟲種群結(jié)構(gòu)的影響
2.5 小結(jié)
第三章 復(fù)合抗菌肽對(duì)山羊瘤胃內(nèi)常見纖毛蟲數(shù)量的影響
3.1 試驗(yàn)材料與動(dòng)物
3.1.1 試驗(yàn)藥品
3.1.2 試驗(yàn)儀器與試劑
3.1.3 試驗(yàn)動(dòng)物
3.2 試驗(yàn)方法
3.2.1 試驗(yàn)動(dòng)物的飼養(yǎng)管理
3.2.2 試驗(yàn)動(dòng)物的分組及處理
3.2.3 瘤胃液的采集和細(xì)菌基因組DNA的提取
3.2.4 測(cè)定指標(biāo)
3.2.5 引物設(shè)計(jì)
3.2.6 目的基因的擴(kuò)增、鑒定及回收
3.2.7 標(biāo)準(zhǔn)品的制備
3.2.8 標(biāo)準(zhǔn)曲線的建立及Real-timePCR擴(kuò)增
3.2.9 數(shù)據(jù)分析
3.3 結(jié)果
3.3.1 纖毛蟲總數(shù)
3.3.2 目的基因片段克隆鑒定
3.3.3 陽性克隆測(cè)序結(jié)果及相似性分析
3.3.4 標(biāo)準(zhǔn)曲線的建立
3.3.5 熒光定量PCR擴(kuò)増與熔解曲線
3.3.6 熒光定量結(jié)果
3.4 討論
3.5 小結(jié)
結(jié)論
參考文獻(xiàn)
致謝
附錄
附錄Ⅰ瘤胃液基因組DNA的提取
附錄Ⅱ PCR產(chǎn)物與載體的連接轉(zhuǎn)化
作者簡歷
本文編號(hào):3826651
【文章頁數(shù)】:66 頁
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【文章目錄】:
摘要
ABSTRACT
英文縮寫詞表
第一章 文獻(xiàn)綜述
1.1 抗菌肽研究進(jìn)展
1.1.1 抗菌肽簡介
1.1.2 抗菌肽廣譜抗微生物作用
1.1.3 抗菌肽作為飼料添加劑的研究現(xiàn)狀
1.1.4 抗菌肽作為飼料添加劑對(duì)腸道菌群的影響
1.2 瘤胃纖毛蟲研究進(jìn)展
1.2.1 瘤胃纖毛蟲簡介
1.2.2 瘤胃纖毛蟲生物學(xué)意義
1.2.3 瘤胃纖毛蟲種群結(jié)構(gòu)研究進(jìn)展
1.2.4 分子生物學(xué)手段在瘤胃微生物研究中的應(yīng)用
1.3 研究目的及意義
第二章 復(fù)合抗菌肽對(duì)山羊瘤胃纖毛蟲種群結(jié)構(gòu)的影響
2.1 試驗(yàn)材料與動(dòng)物
2.1.1 試驗(yàn)藥品
2.1.2 試驗(yàn)儀器與試劑
2.1.3 試驗(yàn)動(dòng)物
2.2 試驗(yàn)方法
2.2.1 試驗(yàn)動(dòng)物的飼養(yǎng)管理
2.2.2 試驗(yàn)動(dòng)物的分組及處理
2.2.3 瘤胃液的采集和基因組DNA的提取
2.2.4 18S rDNA的擴(kuò)增及MiSeq測(cè)序
2.2.5 數(shù)據(jù)分析
2.3 結(jié)果
2.3.1 瘤胃細(xì)菌總DNA提取結(jié)果
2.3.2 樣品測(cè)序深度
2.3.3 Alpha多樣性分析
2.3.4 Beta多樣性分析
2.3.5 纖毛蟲種群結(jié)構(gòu)分析
2.4 討論
2.4.1 多樣性分析
2.4.2 復(fù)合抗菌肽對(duì)纖毛蟲種群結(jié)構(gòu)的影響
2.5 小結(jié)
第三章 復(fù)合抗菌肽對(duì)山羊瘤胃內(nèi)常見纖毛蟲數(shù)量的影響
3.1 試驗(yàn)材料與動(dòng)物
3.1.1 試驗(yàn)藥品
3.1.2 試驗(yàn)儀器與試劑
3.1.3 試驗(yàn)動(dòng)物
3.2 試驗(yàn)方法
3.2.1 試驗(yàn)動(dòng)物的飼養(yǎng)管理
3.2.2 試驗(yàn)動(dòng)物的分組及處理
3.2.3 瘤胃液的采集和細(xì)菌基因組DNA的提取
3.2.4 測(cè)定指標(biāo)
3.2.5 引物設(shè)計(jì)
3.2.6 目的基因的擴(kuò)增、鑒定及回收
3.2.7 標(biāo)準(zhǔn)品的制備
3.2.8 標(biāo)準(zhǔn)曲線的建立及Real-timePCR擴(kuò)增
3.2.9 數(shù)據(jù)分析
3.3 結(jié)果
3.3.1 纖毛蟲總數(shù)
3.3.2 目的基因片段克隆鑒定
3.3.3 陽性克隆測(cè)序結(jié)果及相似性分析
3.3.4 標(biāo)準(zhǔn)曲線的建立
3.3.5 熒光定量PCR擴(kuò)増與熔解曲線
3.3.6 熒光定量結(jié)果
3.4 討論
3.5 小結(jié)
結(jié)論
參考文獻(xiàn)
致謝
附錄
附錄Ⅰ瘤胃液基因組DNA的提取
附錄Ⅱ PCR產(chǎn)物與載體的連接轉(zhuǎn)化
作者簡歷
本文編號(hào):3826651
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