發(fā)布時(shí)間：2023-04-27 00:00

　　初產(chǎn)母豬斷奶后能否正常發(fā)情對(duì)養(yǎng)豬生產(chǎn)影響重大,也是初產(chǎn)母豬被淘汰的主要原因。本研究以乏情和發(fā)情初產(chǎn)母豬為研究對(duì)象,首次利用RNA-seq技術(shù)對(duì)其下丘腦-垂體-卵巢軸中的基因間長(zhǎng)鏈非編碼RNAs(long intergenic noncoding RNAs, lincRNAs)進(jìn)行篩選比較,得到lincRNAs的表達(dá)圖譜,并對(duì)其特征和功能進(jìn)行了初步分析。結(jié)果顯示,在乏情和發(fā)情初產(chǎn)母豬下丘腦–垂體–卵巢軸中鑒定得到3519個(gè)lincRNAs,以發(fā)情組為對(duì)照共有17個(gè)lincRNAs存在差異表達(dá),其中12個(gè)表達(dá)上調(diào),5個(gè)表達(dá)下調(diào)(FC≥2, P<0.05)。選擇4個(gè)差異表達(dá)的lincRNAs經(jīng)qRT-PCR驗(yàn)證,其表達(dá)水平與測(cè)序結(jié)果基本一致。對(duì)這17個(gè)差異表達(dá)的lincRNAs進(jìn)行GO分析、KEGG通路分析及l(fā)incRNA-mRNA共表達(dá)網(wǎng)絡(luò)分析,發(fā)現(xiàn)這些lincRNAs主要與豬卵母細(xì)胞減數(shù)分裂成熟、卵巢細(xì)胞分化及顆粒細(xì)胞凋亡等生殖活動(dòng)相關(guān)。本研究結(jié)果豐富了豬lincRNAs數(shù)據(jù)資源,為進(jìn)一步深入研究初產(chǎn)母豬的生殖機(jī)能提供了理論依據(jù)。

【文章頁(yè)數(shù)】：15 頁(yè)

【文章目錄】：
1 材料與方法
    1.1 實(shí)驗(yàn)動(dòng)物和樣品制備
    1.2 樣品總RNA提取
    1.3 cDNA文庫(kù)構(gòu)建和RNA-seq
    1.4 序列比對(duì)和轉(zhuǎn)錄本構(gòu)建
    1.5 lincRNAs鑒定
    1.6 差異表達(dá)的linc RNAs和差異表達(dá)的m RNAs篩選
    1.7 lincRNAs功能預(yù)測(cè)
    1.8 lincRNA-mRNA共表達(dá)網(wǎng)絡(luò)分析
    1.9 差異表達(dá)lincRNAs qRT-PCR驗(yàn)證
2 結(jié)果與分析
    2.1 轉(zhuǎn)錄本組裝及l(fā)incRNAs鑒定
    2.2 lincRNAs結(jié)構(gòu)特征分析
    2.3 差異表達(dá)lincRNAs和差異表達(dá)mRNAs的表達(dá)譜
    2.4 差異表達(dá)lincRNAs驗(yàn)證
    2.5 GO富集和KEGG通路分析
    2.6 lincRNA-mRNA共表達(dá)網(wǎng)絡(luò)分析
3 討論



本文編號(hào)：3802451