綿羊肺炎支原體NM2010株P60基因的生物信息學分析及原核表達
發(fā)布時間:2023-04-12 05:10
為了探討綿羊肺炎支原體NM2010株假定P60樣脂蛋白用于制備基因工程亞單位疫苗的可能性,試驗運用ExPASy、SignalP 4.0、TMHMM 2.0、SOPMA、 PSORT 6.4、IEDB、BlastP、Hclustersg、Muscle等生物信息學軟件,對綿羊肺炎支原體NM2010株P60基因編碼蛋白的理化性質、跨膜區(qū)、信號肽、二級結構、亞細胞定位、B細胞抗原表位、蛋白功能和基因家族進行預測分析。利用人工合成方法獲得P60成熟肽編碼區(qū)基因序列,并克隆到表達載體pET-32a(+)上進行原核表達及Western-blot分析。結果表明:綿羊肺炎支原體NM2010株P60基因編碼蛋白的二級結構以α-螺旋和隨機卷曲為主,其結構穩(wěn)定,可溶性較高;該編碼蛋白有信號肽,亞細胞定位在外膜,可能是一種外膜蛋白,具有較好的抗原性;參與綿羊肺炎支原體煙酸和煙酰胺代謝途徑,與綿羊肺炎支原體SC01株的GL000100(WP010321430.1)、豬肺炎支原體7448株的0353(WP011290189)屬于同一家族,均為P60樣...
【文章頁數(shù)】:6 頁
【文章目錄】:
1 材料
1.1 質粒和血清
1.2 主要試劑
2 方法
2.1 P60基因的生物信息學分析
2.1.1 假定P60樣脂蛋白理化性質分析
2.1.2 信號肽與跨膜區(qū)預測
2.1.3 二級結構預測
2.1.4 亞細胞定位預測
2.1.5 B細胞抗原表位預測
2.1.6 假定P60樣脂蛋白功能預測
2.1.7 基因家族預測
2.2 P60基因序列的人工合成
2.3 重組蛋白的誘導表達
2.4 重組蛋白的Western-blot分析
3 結果與分析
3.1 P60基因的生物信息學分析
3.1.1 假定P60樣脂蛋白理化性質分析
3.1.2 信號肽與跨膜區(qū)預測
3.1.3 二級結構預測
3.1.4 亞細胞定位預測
3.1.5 B細胞抗原表位預測
3.1.6 假定P60樣脂蛋白功能預測
3.1.7 基因家族預測
3.2 P60基因序列的人工合成
3.3 重組蛋白的誘導表達
3.4 重組蛋白的Western-blot分析
4 討論與結論
本文編號:3790498
【文章頁數(shù)】:6 頁
【文章目錄】:
1 材料
1.1 質粒和血清
1.2 主要試劑
2 方法
2.1 P60基因的生物信息學分析
2.1.1 假定P60樣脂蛋白理化性質分析
2.1.2 信號肽與跨膜區(qū)預測
2.1.3 二級結構預測
2.1.4 亞細胞定位預測
2.1.5 B細胞抗原表位預測
2.1.6 假定P60樣脂蛋白功能預測
2.1.7 基因家族預測
2.2 P60基因序列的人工合成
2.3 重組蛋白的誘導表達
2.4 重組蛋白的Western-blot分析
3 結果與分析
3.1 P60基因的生物信息學分析
3.1.1 假定P60樣脂蛋白理化性質分析
3.1.2 信號肽與跨膜區(qū)預測
3.1.3 二級結構預測
3.1.4 亞細胞定位預測
3.1.5 B細胞抗原表位預測
3.1.6 假定P60樣脂蛋白功能預測
3.1.7 基因家族預測
3.2 P60基因序列的人工合成
3.3 重組蛋白的誘導表達
3.4 重組蛋白的Western-blot分析
4 討論與結論
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