綿羊NRCAM基因的生物信息學(xué)分析
發(fā)布時(shí)間:2023-04-10 05:17
利用生物基因組學(xué)數(shù)據(jù)庫(kù),對(duì)綿羊神經(jīng)原相關(guān)的細(xì)胞粘附分子基因(neuro-related celladhesion molecule,NRCAM)進(jìn)行生物信息學(xué)分析,以初步了解其結(jié)構(gòu)并對(duì)其編碼的蛋白質(zhì)的功能進(jìn)行預(yù)測(cè)。結(jié)果表明,綿羊NRCAM基因含有1個(gè)最大長(zhǎng)度為3 648 bp的開(kāi)放閱讀框,編碼1215個(gè)氨基酸殘基。NRCAM基因編碼產(chǎn)物的分子質(zhì)量為134 367.13 KDa,理論等電點(diǎn)為5.49。亞細(xì)胞定位主要位于細(xì)胞質(zhì)(26.1%),屬于分泌蛋白,且存在信號(hào)肽序列。存在5段IGc2區(qū)、1段IG區(qū),1段低復(fù)雜性區(qū)域以及4段FN3區(qū),且有1段跨膜結(jié)構(gòu);二級(jí)結(jié)構(gòu)以無(wú)規(guī)卷曲和β折疊為主,三級(jí)結(jié)構(gòu)主要由無(wú)規(guī)卷曲和β折疊纏繞形成。
【文章頁(yè)數(shù)】:6 頁(yè)
【文章目錄】:
1 材料與方法
1.1 序列來(lái)源
1.2 方法
2 結(jié)果與分析
2.1 綿羊NRCAM基因開(kāi)放閱讀框分析
2.2 綿羊NRCAM基因編碼產(chǎn)物的理化性質(zhì)分析
2.3 綿羊NRCAM基因編碼產(chǎn)物亞細(xì)胞定位分析
2.4 綿羊NRCAM基因編碼產(chǎn)物的同源性分析
2.5 綿羊NRCAM基因編碼產(chǎn)物潛在信號(hào)肽剪切位點(diǎn)預(yù)測(cè)
2.6 綿羊NRCAM基因編碼產(chǎn)物跨膜螺旋結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè)
2.7 綿羊NRCAM基因編碼產(chǎn)物保守結(jié)構(gòu)域分析
2.8 綿羊NRCAM基因編碼產(chǎn)物親疏水性分析
2.9 綿羊NRCAM基因編碼產(chǎn)物二級(jí)結(jié)構(gòu)的預(yù)測(cè)
2.1 0 綿羊NRCAM基因編碼產(chǎn)物三級(jí)結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè)與分析
3 結(jié)論
本文編號(hào):3788399
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1 材料與方法
1.1 序列來(lái)源
1.2 方法
2 結(jié)果與分析
2.1 綿羊NRCAM基因開(kāi)放閱讀框分析
2.2 綿羊NRCAM基因編碼產(chǎn)物的理化性質(zhì)分析
2.3 綿羊NRCAM基因編碼產(chǎn)物亞細(xì)胞定位分析
2.4 綿羊NRCAM基因編碼產(chǎn)物的同源性分析
2.5 綿羊NRCAM基因編碼產(chǎn)物潛在信號(hào)肽剪切位點(diǎn)預(yù)測(cè)
2.6 綿羊NRCAM基因編碼產(chǎn)物跨膜螺旋結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè)
2.7 綿羊NRCAM基因編碼產(chǎn)物保守結(jié)構(gòu)域分析
2.8 綿羊NRCAM基因編碼產(chǎn)物親疏水性分析
2.9 綿羊NRCAM基因編碼產(chǎn)物二級(jí)結(jié)構(gòu)的預(yù)測(cè)
2.1 0 綿羊NRCAM基因編碼產(chǎn)物三級(jí)結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè)與分析
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