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綿羊NRCAM基因的生物信息學分析

發(fā)布時間:2023-04-10 05:17
  利用生物基因組學數(shù)據(jù)庫,對綿羊神經(jīng)原相關(guān)的細胞粘附分子基因(neuro-related celladhesion molecule,NRCAM)進行生物信息學分析,以初步了解其結(jié)構(gòu)并對其編碼的蛋白質(zhì)的功能進行預測。結(jié)果表明,綿羊NRCAM基因含有1個最大長度為3 648 bp的開放閱讀框,編碼1215個氨基酸殘基。NRCAM基因編碼產(chǎn)物的分子質(zhì)量為134 367.13 KDa,理論等電點為5.49。亞細胞定位主要位于細胞質(zhì)(26.1%),屬于分泌蛋白,且存在信號肽序列。存在5段IGc2區(qū)、1段IG區(qū),1段低復雜性區(qū)域以及4段FN3區(qū),且有1段跨膜結(jié)構(gòu);二級結(jié)構(gòu)以無規(guī)卷曲和β折疊為主,三級結(jié)構(gòu)主要由無規(guī)卷曲和β折疊纏繞形成。

【文章頁數(shù)】:6 頁

【文章目錄】:
1 材料與方法
    1.1 序列來源
    1.2 方法
2 結(jié)果與分析
    2.1 綿羊NRCAM基因開放閱讀框分析
    2.2 綿羊NRCAM基因編碼產(chǎn)物的理化性質(zhì)分析
    2.3 綿羊NRCAM基因編碼產(chǎn)物亞細胞定位分析
    2.4 綿羊NRCAM基因編碼產(chǎn)物的同源性分析
    2.5 綿羊NRCAM基因編碼產(chǎn)物潛在信號肽剪切位點預測
    2.6 綿羊NRCAM基因編碼產(chǎn)物跨膜螺旋結(jié)構(gòu)預測
    2.7 綿羊NRCAM基因編碼產(chǎn)物保守結(jié)構(gòu)域分析
    2.8 綿羊NRCAM基因編碼產(chǎn)物親疏水性分析
    2.9 綿羊NRCAM基因編碼產(chǎn)物二級結(jié)構(gòu)的預測
    2.1 0 綿羊NRCAM基因編碼產(chǎn)物三級結(jié)構(gòu)預測與分析
3 結(jié)論



本文編號:3788399

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