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黃牛GPR41和GPR43基因多態(tài)性及其與生長性狀相關性研究

發(fā)布時間:2023-04-04 01:11
  本研究采用PCR-SSCP和DNA測序技術,檢測了郟縣紅牛、魯西牛和秦川牛3個黃牛品種共403個個體GPR41和GPR43基因的遺傳變異,同時探討黃牛群體的遺傳多態(tài)性、遺傳結構、遺傳多態(tài)性與生長性狀(體重、體高、體長、胸圍、管圍、腹圍等)的關系,以期獲取相應的分子遺傳學信息,發(fā)掘與黃牛重要的經(jīng)濟性狀顯著相關的遺傳標記,為進一步保護利用與開發(fā)黃牛種質資源、建立分子標記數(shù)據(jù)庫以及改善與提高黃牛的生產(chǎn)性能提供重要的遺傳學依據(jù)。本研究共檢測了3個黃牛品種GPR41基因6個基因座(P1,P2,P3,P4,P5,P6)和GPR43基因7個基因座(P7,P8,P9,P10,P11,P12,P13)的遺傳變異。并與黃牛的生長性狀進行了相關分析,獲得了以下研究結果:1.黃牛GPR41基因的遺傳變異及其與生長性狀的關系研究GPR41,又稱FFAR3,是人體內最大的膜受體蛋白G蛋白偶聯(lián)受體(GPCRS)超家族中的成員。高產(chǎn)反芻動物需要利用大量短鏈脂肪酸作為能源,營養(yǎng)物質的吸收調控的關鍵步驟是營養(yǎng)物質的感知,行使這一功能的主要是G蛋白偶聯(lián)受體(GPCRS),GPR41作為脂肪酸感受器可以感知來自消化腔的短鏈脂...

【文章頁數(shù)】:111 頁

【學位級別】:碩士

【文章目錄】:
致謝
摘要
Abstract
1 引言
2 文獻綜述
    2.1 短鏈脂肪酸概述
        2.1.1 短鏈脂肪酸的種類及作用
    2.2 G蛋白偶聯(lián)受體的研究進展
        2.2.1 G蛋白偶聯(lián)受體的分類和基本結構
    2.3 短鏈脂肪酸受體的研究進展
        2.3.1 GPR41和GPR43基因的結構特點
        2.3.2 GPR41和GPR43蛋白的結構特點
        2.3.3 GPR41和GPR43蛋白的組織分布
        2.3.4 GPR41和GPR43蛋白的信號轉導
        2.3.5 GPR41和GPR43蛋白的生理功能
        2.3.6 GPR41和GPR43蛋白在動物胃腸道對營養(yǎng)物質吸收調控的研究進展
    2.4 小結
3 材料與方法
    3.1 實驗材料
        3.1.1 實驗動物
        3.1.2 實驗試劑
        3.1.3 溶液與緩沖液
        3.1.4 儀器設備
    3.2 實驗方法
        3.2.1 樣本的采集保存與數(shù)據(jù)收集
        3.2.2 生長指標的獲得
        3.2.3 全血中基因組DNA的提取
        3.2.4 DNA質量的電泳檢測、純化及濃度計算
        3.2.5 引物設計
        3.2.6 PCR擴增及產(chǎn)物檢測
        3.2.7 圖像分析
        3.2.8 多態(tài)產(chǎn)物測序分析
        3.2.9 統(tǒng)計分析方法
4 黃牛GPR41和GPR43基因遺傳變異檢測結果
    4.1 黃牛的基因組DNA樣品的檢測
    4.2 黃牛GPR41基因SNP檢測結果
        4.2.1 黃牛GPR41基因6個位點的PCR擴增結果
        4.2.2 擴增產(chǎn)物PCR-SSCP分析結果
        4.2.3 黃牛GPR41基因多態(tài)產(chǎn)物DNA測序結果
    4.3 黃牛GPR43基因SNP檢測結果
        4.3.1 黃牛GPR43基因7個位點的PCR擴增結果
        4.3.2 擴增產(chǎn)物PCR-SSCP分析結果
        4.3.3 黃牛GPR43基因多態(tài)產(chǎn)物DNA測序結果
5 黃牛GPR41和GPR43基因的生物信息學分析
    5.1 黃牛GPR41基因的生物信息學分析
        5.1.1 黃牛GPR41基因同源進化分析
        5.1.2 黃牛GPR41基因CDS密碼子使用及氨基酸組成
        5.1.3 黃牛GPR41蛋白一級結構特征分析與二級結構預測
    5.2 黃牛GPR43基因的生物信息學分析
        5.2.1 黃牛GPR43基因同源進化分析
        5.2.2 黃牛GPR43基因CDS密碼子使用及氨基酸組成
        5.2.3 黃牛GPR43蛋白一級結構特征分析與二級結構預測
6 黃牛GPR41和GPR43基因群體遺傳結構分析
    6.1 黃牛GPR41基因群體遺傳結構分析
        6.1.1 P3位點基因群體遺傳結構分析
    6.2 黃牛GPR43基因群體遺傳結構分析
        6.2.1 P7位點位點基因群體遺傳結構分析
        6.2.2 P8位點位點基因群體遺傳結構分析
        6.2.3 P10位點位點基因群體遺傳結構分析
        6.2.4 P12位點位點基因群體遺傳結構分析
        6.2.5 P13位點位點基因群體遺傳結構分析
7 黃牛GPR41和GPR43基因多態(tài)性及其與生長性狀相關分析
    7.1 黃牛GPR41基因多態(tài)性與生長性狀相關分析
        7.1.1 P3基因多態(tài)性與生長性狀相關分析
    7.2 黃牛GPR43基因多態(tài)性與生長性狀相關分析
        7.2.1 P7位點基因多態(tài)性與生長性狀相關分析
        7.2.2 P8位點基因多態(tài)性與生長性狀相關分析
        7.2.3 P10位點基因多態(tài)性與生長性狀相關分析
        7.2.4 P12位點基因多態(tài)性與生長性狀相關分析
        7.2.5 P13位點基因多態(tài)性與生長性狀相關分析
8 討論與結論
    8.1 討論
        8.1.1 黃牛GPR41基因遺傳變異及其與生長性狀相關分析
        8.1.2 黃牛GPR43基因遺傳變異及其與生長性狀相關分析
        8.1.3 黃牛GPR41和GPR43基因多態(tài)位點遺傳效應的相關分析
    8.2 結論與創(chuàng)新點
        8.2.1 結論
        8.2.2 創(chuàng)新點
參考文獻
作者簡歷
學位論文數(shù)據(jù)集



本文編號:3781498

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