黃牛GPR41和GPR43基因多態(tài)性及其與生長(zhǎng)性狀相關(guān)性研究
發(fā)布時(shí)間:2023-04-04 01:11
本研究采用PCR-SSCP和DNA測(cè)序技術(shù),檢測(cè)了郟縣紅牛、魯西牛和秦川牛3個(gè)黃牛品種共403個(gè)個(gè)體GPR41和GPR43基因的遺傳變異,同時(shí)探討黃牛群體的遺傳多態(tài)性、遺傳結(jié)構(gòu)、遺傳多態(tài)性與生長(zhǎng)性狀(體重、體高、體長(zhǎng)、胸圍、管圍、腹圍等)的關(guān)系,以期獲取相應(yīng)的分子遺傳學(xué)信息,發(fā)掘與黃牛重要的經(jīng)濟(jì)性狀顯著相關(guān)的遺傳標(biāo)記,為進(jìn)一步保護(hù)利用與開(kāi)發(fā)黃牛種質(zhì)資源、建立分子標(biāo)記數(shù)據(jù)庫(kù)以及改善與提高黃牛的生產(chǎn)性能提供重要的遺傳學(xué)依據(jù)。本研究共檢測(cè)了3個(gè)黃牛品種GPR41基因6個(gè)基因座(P1,P2,P3,P4,P5,P6)和GPR43基因7個(gè)基因座(P7,P8,P9,P10,P11,P12,P13)的遺傳變異。并與黃牛的生長(zhǎng)性狀進(jìn)行了相關(guān)分析,獲得了以下研究結(jié)果:1.黃牛GPR41基因的遺傳變異及其與生長(zhǎng)性狀的關(guān)系研究GPR41,又稱FFAR3,是人體內(nèi)最大的膜受體蛋白G蛋白偶聯(lián)受體(GPCRS)超家族中的成員。高產(chǎn)反芻動(dòng)物需要利用大量短鏈脂肪酸作為能源,營(yíng)養(yǎng)物質(zhì)的吸收調(diào)控的關(guān)鍵步驟是營(yíng)養(yǎng)物質(zhì)的感知,行使這一功能的主要是G蛋白偶聯(lián)受體(GPCRS),GPR41作為脂肪酸感受器可以感知來(lái)自消化腔的短鏈脂...
【文章頁(yè)數(shù)】:111 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【文章目錄】:
致謝
摘要
Abstract
1 引言
2 文獻(xiàn)綜述
2.1 短鏈脂肪酸概述
2.1.1 短鏈脂肪酸的種類及作用
2.2 G蛋白偶聯(lián)受體的研究進(jìn)展
2.2.1 G蛋白偶聯(lián)受體的分類和基本結(jié)構(gòu)
2.3 短鏈脂肪酸受體的研究進(jìn)展
2.3.1 GPR41和GPR43基因的結(jié)構(gòu)特點(diǎn)
2.3.2 GPR41和GPR43蛋白的結(jié)構(gòu)特點(diǎn)
2.3.3 GPR41和GPR43蛋白的組織分布
2.3.4 GPR41和GPR43蛋白的信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)
2.3.5 GPR41和GPR43蛋白的生理功能
2.3.6 GPR41和GPR43蛋白在動(dòng)物胃腸道對(duì)營(yíng)養(yǎng)物質(zhì)吸收調(diào)控的研究進(jìn)展
2.4 小結(jié)
3 材料與方法
3.1 實(shí)驗(yàn)材料
3.1.1 實(shí)驗(yàn)動(dòng)物
3.1.2 實(shí)驗(yàn)試劑
3.1.3 溶液與緩沖液
3.1.4 儀器設(shè)備
3.2 實(shí)驗(yàn)方法
3.2.1 樣本的采集保存與數(shù)據(jù)收集
3.2.2 生長(zhǎng)指標(biāo)的獲得
3.2.3 全血中基因組DNA的提取
3.2.4 DNA質(zhì)量的電泳檢測(cè)、純化及濃度計(jì)算
3.2.5 引物設(shè)計(jì)
3.2.6 PCR擴(kuò)增及產(chǎn)物檢測(cè)
3.2.7 圖像分析
3.2.8 多態(tài)產(chǎn)物測(cè)序分析
3.2.9 統(tǒng)計(jì)分析方法
4 黃牛GPR41和GPR43基因遺傳變異檢測(cè)結(jié)果
4.1 黃牛的基因組DNA樣品的檢測(cè)
4.2 黃牛GPR41基因SNP檢測(cè)結(jié)果
4.2.1 黃牛GPR41基因6個(gè)位點(diǎn)的PCR擴(kuò)增結(jié)果
4.2.2 擴(kuò)增產(chǎn)物PCR-SSCP分析結(jié)果
4.2.3 黃牛GPR41基因多態(tài)產(chǎn)物DNA測(cè)序結(jié)果
4.3 黃牛GPR43基因SNP檢測(cè)結(jié)果
4.3.1 黃牛GPR43基因7個(gè)位點(diǎn)的PCR擴(kuò)增結(jié)果
4.3.2 擴(kuò)增產(chǎn)物PCR-SSCP分析結(jié)果
4.3.3 黃牛GPR43基因多態(tài)產(chǎn)物DNA測(cè)序結(jié)果
5 黃牛GPR41和GPR43基因的生物信息學(xué)分析
5.1 黃牛GPR41基因的生物信息學(xué)分析
5.1.1 黃牛GPR41基因同源進(jìn)化分析
5.1.2 黃牛GPR41基因CDS密碼子使用及氨基酸組成
5.1.3 黃牛GPR41蛋白一級(jí)結(jié)構(gòu)特征分析與二級(jí)結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè)
5.2 黃牛GPR43基因的生物信息學(xué)分析
5.2.1 黃牛GPR43基因同源進(jìn)化分析
5.2.2 黃牛GPR43基因CDS密碼子使用及氨基酸組成
5.2.3 黃牛GPR43蛋白一級(jí)結(jié)構(gòu)特征分析與二級(jí)結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè)
6 黃牛GPR41和GPR43基因群體遺傳結(jié)構(gòu)分析
6.1 黃牛GPR41基因群體遺傳結(jié)構(gòu)分析
6.1.1 P3位點(diǎn)基因群體遺傳結(jié)構(gòu)分析
6.2 黃牛GPR43基因群體遺傳結(jié)構(gòu)分析
6.2.1 P7位點(diǎn)位點(diǎn)基因群體遺傳結(jié)構(gòu)分析
6.2.2 P8位點(diǎn)位點(diǎn)基因群體遺傳結(jié)構(gòu)分析
6.2.3 P10位點(diǎn)位點(diǎn)基因群體遺傳結(jié)構(gòu)分析
6.2.4 P12位點(diǎn)位點(diǎn)基因群體遺傳結(jié)構(gòu)分析
6.2.5 P13位點(diǎn)位點(diǎn)基因群體遺傳結(jié)構(gòu)分析
7 黃牛GPR41和GPR43基因多態(tài)性及其與生長(zhǎng)性狀相關(guān)分析
7.1 黃牛GPR41基因多態(tài)性與生長(zhǎng)性狀相關(guān)分析
7.1.1 P3基因多態(tài)性與生長(zhǎng)性狀相關(guān)分析
7.2 黃牛GPR43基因多態(tài)性與生長(zhǎng)性狀相關(guān)分析
7.2.1 P7位點(diǎn)基因多態(tài)性與生長(zhǎng)性狀相關(guān)分析
7.2.2 P8位點(diǎn)基因多態(tài)性與生長(zhǎng)性狀相關(guān)分析
7.2.3 P10位點(diǎn)基因多態(tài)性與生長(zhǎng)性狀相關(guān)分析
7.2.4 P12位點(diǎn)基因多態(tài)性與生長(zhǎng)性狀相關(guān)分析
7.2.5 P13位點(diǎn)基因多態(tài)性與生長(zhǎng)性狀相關(guān)分析
8 討論與結(jié)論
8.1 討論
8.1.1 黃牛GPR41基因遺傳變異及其與生長(zhǎng)性狀相關(guān)分析
8.1.2 黃牛GPR43基因遺傳變異及其與生長(zhǎng)性狀相關(guān)分析
8.1.3 黃牛GPR41和GPR43基因多態(tài)位點(diǎn)遺傳效應(yīng)的相關(guān)分析
8.2 結(jié)論與創(chuàng)新點(diǎn)
8.2.1 結(jié)論
8.2.2 創(chuàng)新點(diǎn)
參考文獻(xiàn)
作者簡(jiǎn)歷
學(xué)位論文數(shù)據(jù)集
本文編號(hào):3781498
【文章頁(yè)數(shù)】:111 頁(yè)
【學(xué)位級(jí)別】:碩士
【文章目錄】:
致謝
摘要
Abstract
1 引言
2 文獻(xiàn)綜述
2.1 短鏈脂肪酸概述
2.1.1 短鏈脂肪酸的種類及作用
2.2 G蛋白偶聯(lián)受體的研究進(jìn)展
2.2.1 G蛋白偶聯(lián)受體的分類和基本結(jié)構(gòu)
2.3 短鏈脂肪酸受體的研究進(jìn)展
2.3.1 GPR41和GPR43基因的結(jié)構(gòu)特點(diǎn)
2.3.2 GPR41和GPR43蛋白的結(jié)構(gòu)特點(diǎn)
2.3.3 GPR41和GPR43蛋白的組織分布
2.3.4 GPR41和GPR43蛋白的信號(hào)轉(zhuǎn)導(dǎo)
2.3.5 GPR41和GPR43蛋白的生理功能
2.3.6 GPR41和GPR43蛋白在動(dòng)物胃腸道對(duì)營(yíng)養(yǎng)物質(zhì)吸收調(diào)控的研究進(jìn)展
2.4 小結(jié)
3 材料與方法
3.1 實(shí)驗(yàn)材料
3.1.1 實(shí)驗(yàn)動(dòng)物
3.1.2 實(shí)驗(yàn)試劑
3.1.3 溶液與緩沖液
3.1.4 儀器設(shè)備
3.2 實(shí)驗(yàn)方法
3.2.1 樣本的采集保存與數(shù)據(jù)收集
3.2.2 生長(zhǎng)指標(biāo)的獲得
3.2.3 全血中基因組DNA的提取
3.2.4 DNA質(zhì)量的電泳檢測(cè)、純化及濃度計(jì)算
3.2.5 引物設(shè)計(jì)
3.2.6 PCR擴(kuò)增及產(chǎn)物檢測(cè)
3.2.7 圖像分析
3.2.8 多態(tài)產(chǎn)物測(cè)序分析
3.2.9 統(tǒng)計(jì)分析方法
4 黃牛GPR41和GPR43基因遺傳變異檢測(cè)結(jié)果
4.1 黃牛的基因組DNA樣品的檢測(cè)
4.2 黃牛GPR41基因SNP檢測(cè)結(jié)果
4.2.1 黃牛GPR41基因6個(gè)位點(diǎn)的PCR擴(kuò)增結(jié)果
4.2.2 擴(kuò)增產(chǎn)物PCR-SSCP分析結(jié)果
4.2.3 黃牛GPR41基因多態(tài)產(chǎn)物DNA測(cè)序結(jié)果
4.3 黃牛GPR43基因SNP檢測(cè)結(jié)果
4.3.1 黃牛GPR43基因7個(gè)位點(diǎn)的PCR擴(kuò)增結(jié)果
4.3.2 擴(kuò)增產(chǎn)物PCR-SSCP分析結(jié)果
4.3.3 黃牛GPR43基因多態(tài)產(chǎn)物DNA測(cè)序結(jié)果
5 黃牛GPR41和GPR43基因的生物信息學(xué)分析
5.1 黃牛GPR41基因的生物信息學(xué)分析
5.1.1 黃牛GPR41基因同源進(jìn)化分析
5.1.2 黃牛GPR41基因CDS密碼子使用及氨基酸組成
5.1.3 黃牛GPR41蛋白一級(jí)結(jié)構(gòu)特征分析與二級(jí)結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè)
5.2 黃牛GPR43基因的生物信息學(xué)分析
5.2.1 黃牛GPR43基因同源進(jìn)化分析
5.2.2 黃牛GPR43基因CDS密碼子使用及氨基酸組成
5.2.3 黃牛GPR43蛋白一級(jí)結(jié)構(gòu)特征分析與二級(jí)結(jié)構(gòu)預(yù)測(cè)
6 黃牛GPR41和GPR43基因群體遺傳結(jié)構(gòu)分析
6.1 黃牛GPR41基因群體遺傳結(jié)構(gòu)分析
6.1.1 P3位點(diǎn)基因群體遺傳結(jié)構(gòu)分析
6.2 黃牛GPR43基因群體遺傳結(jié)構(gòu)分析
6.2.1 P7位點(diǎn)位點(diǎn)基因群體遺傳結(jié)構(gòu)分析
6.2.2 P8位點(diǎn)位點(diǎn)基因群體遺傳結(jié)構(gòu)分析
6.2.3 P10位點(diǎn)位點(diǎn)基因群體遺傳結(jié)構(gòu)分析
6.2.4 P12位點(diǎn)位點(diǎn)基因群體遺傳結(jié)構(gòu)分析
6.2.5 P13位點(diǎn)位點(diǎn)基因群體遺傳結(jié)構(gòu)分析
7 黃牛GPR41和GPR43基因多態(tài)性及其與生長(zhǎng)性狀相關(guān)分析
7.1 黃牛GPR41基因多態(tài)性與生長(zhǎng)性狀相關(guān)分析
7.1.1 P3基因多態(tài)性與生長(zhǎng)性狀相關(guān)分析
7.2 黃牛GPR43基因多態(tài)性與生長(zhǎng)性狀相關(guān)分析
7.2.1 P7位點(diǎn)基因多態(tài)性與生長(zhǎng)性狀相關(guān)分析
7.2.2 P8位點(diǎn)基因多態(tài)性與生長(zhǎng)性狀相關(guān)分析
7.2.3 P10位點(diǎn)基因多態(tài)性與生長(zhǎng)性狀相關(guān)分析
7.2.4 P12位點(diǎn)基因多態(tài)性與生長(zhǎng)性狀相關(guān)分析
7.2.5 P13位點(diǎn)基因多態(tài)性與生長(zhǎng)性狀相關(guān)分析
8 討論與結(jié)論
8.1 討論
8.1.1 黃牛GPR41基因遺傳變異及其與生長(zhǎng)性狀相關(guān)分析
8.1.2 黃牛GPR43基因遺傳變異及其與生長(zhǎng)性狀相關(guān)分析
8.1.3 黃牛GPR41和GPR43基因多態(tài)位點(diǎn)遺傳效應(yīng)的相關(guān)分析
8.2 結(jié)論與創(chuàng)新點(diǎn)
8.2.1 結(jié)論
8.2.2 創(chuàng)新點(diǎn)
參考文獻(xiàn)
作者簡(jiǎn)歷
學(xué)位論文數(shù)據(jù)集
本文編號(hào):3781498
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