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一株塞內(nèi)卡病毒A全基因組序列測(cè)定與致病性分析

發(fā)布時(shí)間:2023-03-26 20:33
  本研究旨在明確塞內(nèi)卡病毒A(Senecavirus A, SVA)FJLY株的基因組特性及其與其他毒株的同源性關(guān)系,并了解SVA-FJLY株的致病性。以分離自福建省某養(yǎng)殖場(chǎng)中的一株SVA-FJLY株為研究對(duì)象,參照其原型毒株SVV-001(GenBank No.DQ641257.1)全基因組序列設(shè)計(jì)5對(duì)引物,通過RT-PCR擴(kuò)增、測(cè)序、拼接,獲得SVA-FJLY株全基因組序列并進(jìn)行序列分析;并通過滴鼻攻毒3~4周齡仔豬。結(jié)果表明,SVA-FJLY株基因組全長(zhǎng)7 275 bp(不包括PolyA),SVA-FJLY株基因組存在一個(gè)多聚蛋白、VP1蛋白和VP2蛋白。SVA-FJLY株與參考毒株之間的基因組一級(jí)結(jié)構(gòu)有較高的相似性,與HeB01-2017株(MF967574.1)相似性最高,達(dá)98.5%;而與SVA原型毒株SVV-001株(DQ641257.1)的相似性較低,為93.9%。SVA-FJLY株與國(guó)內(nèi)幾個(gè)毒株屬于同一個(gè)分支,與國(guó)內(nèi)的HeB01-2017株親緣關(guān)系最近,同時(shí)與國(guó)外Colombia-2016株(KX857728.1)的親緣關(guān)系最近。通過動(dòng)物試驗(yàn)發(fā)現(xiàn)試驗(yàn)組豬攻毒10 d后,...

【文章頁數(shù)】:7 頁

【文章目錄】:
1 材料與方法
    1.1 病毒和試驗(yàn)動(dòng)物
    1.2 主要試劑
    1.3 引物
    1.4 RNA提取
    1.5 RT-PCR
    1.6 目的基因回收與測(cè)序
    1.7 致病性試驗(yàn)
2 結(jié) 果
    2.1 目的基因擴(kuò)增
    2.2 序列測(cè)定與拼接
    2.3 SVA-FJLY株與參考毒株相似性比較
    2.4 致病性試驗(yàn)
3 討 論
4 結(jié) 論



本文編號(hào):3771679

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